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Elucidation of the relationship between amino acids synthesized by microbiome muscle mass in cirrhosis model/patients using network analysis

Research Project

Project/Area Number 21K15970
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 53010:Gastroenterology-related
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

Yamamoto Kenta  名古屋大学, 医学部附属病院, 病院助教 (80852582)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywords肝臓 / 腸内細菌 / 肝硬変 / 肝臓癌 / 胆汁酸 / ネットワーク解析 / マウス / ヒト / 肝癌 / 繊維化 / 肝疾患 / 筋肉 / サルコペニア / アミノ酸 / 機能遺伝子 / 慢性肝疾患
Outline of Research at the Start

肝硬変患者における腸内細菌叢が作るアミノ酸と筋肉量の関連性を明確にし、有用もしくは有害な細菌を同定することでサルコペニアや肝性脳症のリスク評価を可能とするバイオマーカーの発見と治療・予防薬の開発を目指す。肝硬変患者ではアンモニア産生菌や分岐鎖アミノ酸以外のアミノ酸合成菌が多く、アミノ酸を生成する際に窒素をとりあう「細菌による競合」が生じている可能性がある。この解明には単一の細菌を検出する目的ではなく肝硬変による腸内細菌叢の乱れ、競合する細菌など複数の有用な細菌や競合する細菌のネットワークを明らかにすることで新たな視点により人体に与える影響を解明する。

Outline of Final Research Achievements

We investigated how the gut microbiota of patients with chronic liver disease affects disease progression and muscle mass reduction. We found that patients with lower muscle mass had higher levels of specific bacteria, such as Bacteroides, and fewer bacteria capable of synthesizing amino acids crucial for muscle maintenance. Additionally, an increased abundance of Veillonella was associated with worse disease progression, whereas Ruminococcaceae appeared to slow disease advancement. Detailed bacterial functions and structures were elucidated using animal experiments and advanced microscopy techniques. Furthermore, extensive analysis using many patient samples demonstrated the clinical applicability of these findings.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究の成果は、腸内細菌が慢性肝疾患の進行や予後に重要な役割を果たしていることを科学的に証明し、これまで不明だった筋肉量低下のメカニズムの一部を明らかにしました。また、特定の腸内細菌を標的とする新たな治療法や予防策の開発可能性を提示し、患者のQOL向上に貢献できる社会的意義のある結果を得ました。さらに、顕微鏡による可視化など新たな解析技術の導入は、腸内細菌研究の進展にも大きく寄与しています。これらの研究成果は、医学的・社会的課題である慢性肝疾患の予防・治療の進展を支える重要な基礎となることが期待されます。

Report

(5 results)
  • 2024 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results)

  • [Journal Article] Identification of the microbiome associated with prognosis in patients with chronic liver disease2024

    • Author(s)
      Yamamoto K, Honda T*, Inukai Y, Yokoyama S, Ito T, Imai N, Ishizu Y, Nakamura M, Kawashima H
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 12 Issue: 3 Pages: 610-610

    • DOI

      10.3390/microorganisms12030610

    • Related Report
      2024 Annual Research Report 2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Impact of elobixibat on liver tumors, microbiome, and bile acid levels in a mouse model of nonalcoholic steatohepatitis2023

    • Author(s)
      Sugiyama Y, Yamamoto K, Honda T, Kato A, Muto H, Yokoyama S, Ito T, Imai N, Ishizu Y, Nakamura M, Asano T, Enomoto A, Zaitsu K, Ishigami M, Fujishiro M, Kawashima H.
    • Journal Title

      Hepatol Int

      Volume: 17 Issue: 6 Pages: 1378-1392

    • DOI

      10.1007/s12072-023-10581-2

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Patients with low muscle mass have characteristic microbiome with low potential for amino acid synthesis in chronic liver disease2022

    • Author(s)
      Yamamoto Kenta、Ishizu Yoji、Honda Takashi、Ito Takanori、Imai Norihiro、Nakamura Masanao、Kawashima Hiroki、Kitaura Yasuyuki、Ishigami Masatoshi、Fujishiro Mitsuhiro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 3674-3674

    • DOI

      10.1038/s41598-022-07810-3

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 消化器疾患における腸内細菌叢の解析;病態解明と診療展開 慢性肝疾患患者における腸内細菌叢ネットワークと中心性指標の解明2024

    • Author(s)
      山本 健太, 本多 隆, 犬飼 庸介, 山本 崇文, 水野 和幸, 横山 晋也, 伊藤 隆徳, 今井 則博, 石津 洋二, 川嶋 啓揮
    • Organizer
      消化器病学会 総会 2024
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] 肝疾患と臓器相関(胆汁酸,Microbiome含む) Elobixibat投与によるNASHモデルにおける肝腫瘍抑制と細菌叢変化に及ぼす影響2024

    • Author(s)
      山本 健太, 本多 隆, 川嶋 啓揮
    • Organizer
      肝臓 総会 2024
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] Exploring the Gut Microbiome's Interaction with Colon Mucosa in human Chronic Liver Disease using liquid-phase ASEM2024

    • Author(s)
      Kenta Yamamoto, Chikara Sato, Takashi Honda
    • Organizer
      Liquid Phase Electron Microscopy GRC 2024
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] INVESTIGATING THE RELATIONSHIP BETWEEN GUT MICROBIOME AND FIBROSIS MARKERS IN PATIENTS WITH VIRAL HEPATITIS2023

    • Author(s)
      K. Yamamoto, T. Honda, Y. Inukai, S. Yokoyama, T. Ito, N. Imai, Y. Ishizu, H. Kawashima, M. Ishigami
    • Organizer
      United European Gastroenterology week 2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 慢性肝疾患患者の予後に関する腸内細菌・臨床的因子の検討2023

    • Author(s)
      山本 健太 本多 隆 犬飼 庸介 水野 史崇 松田 宣賢 山本 崇文 水野 和幸 武藤 久哲 横山 晋也 伊藤 隆徳 今井 則博 石津 洋二 石上 雅敏 川嶋 啓揮
    • Organizer
      Japan Digestive Disease Week 2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Correlation Between Gut Microbiota and Clinical Parameters in Patients with Alcoholic Liver Disease2023

    • Author(s)
      Kenta Yamamoto, Takashi Honda, Shinya Yokoyama, Takanori Ito, Norihiro Imai, Yoji Ishizu, Masatoshi Ishigami Tetsuya Ishikawa, Hiroki Kawashima
    • Organizer
      The 3rd JSH International Liver Conference.
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 肝癌患者における長期予後と腸内細菌叢の関係2023

    • Author(s)
      山本 健太 本多 隆 石上 雅敏
    • Organizer
      第59回日本肝臓学会総会 2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] ネットワーク解析を用いた線維化マーカーと 腸内細菌叢の関係性の解明2023

    • Author(s)
      山本 健太 本多 隆 石上 雅敏
    • Organizer
      第109回日本消化器病学会総会 2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 慢性肝疾患患者における 腸内細菌ネットワーク解析と臨床的指標の関連性2022

    • Author(s)
      山本 健太 本多 隆 石上 雅敏
    • Organizer
      日本消化器病学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Microbiome correlated with fibrosis markers common to HBV and HCV patients2022

    • Author(s)
      Kenta Yamamoto. Takashi Honda. Masatoshi Ishigami
    • Organizer
      Japan Digestive Disease Week 2022
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 慢性肝疾患患者においてProton pump inhibitors内服下では腸内細菌に影響を与える臨床的因子が異なる2022

    • Author(s)
      山本 健太, 本多 隆, 松田 宜賢, 犬飼 庸介, 山本 崇文, 杉山 由晃, 吉岡 直輝, 水野 和幸, 武藤 久哲, 横山 晋也, 伊藤 隆徳, 今井 則博, 石津 洋二, 石上 雅敏
    • Organizer
      肝臓学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] The Effect of Elobixibat on Tumorigenesis in the NASH Mice Model2022

    • Author(s)
      Kenta Yamamoto, Yoshiaki Sugiyama, Takashi Honda, Asuka Kato, Hisanori Muto, Shinya Yokoyama, Takanori Ito, Norihiro Imai, Yoji Ishizu, Masatoshi Ishigami, Hiroki Kawashima
    • Organizer
      APASL Oncology 2022 (Single Topic Conference)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 肝疾患における臓器連関の役割 ランダムフォレストを用いた慢性肝疾患患者における筋肉量減少と関連ある腸内細菌叢の同定への試み2021

    • Author(s)
      山本 健太, 本多 隆, 石上 雅敏
    • Organizer
      第44回日本肝臓学会西部会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2026-01-16  

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