TTF-1の網羅的エピゲノム解析に基づくEGFR-TKI耐性獲得機序の解明
| Project/Area Number |
21K16112
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 53030:Respiratory medicine-related
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
穂苅 諭 新潟大学, 医歯学総合病院, 特任助教 (00771213)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
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| Keywords | TTF-1 / 肺腺癌 / EGFR遺伝子変異 / KRAS変異 / EGFR変異 / 上皮間葉転換 / エピゲノム / EGFR |
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| Outline of Research at the Start |
正常肺にも発現しているTTF-1は，肺腺癌においてがん促進的にもがん抑制的にも作用し，さらに小細胞肺癌における神経内分泌分化にも寄与していることが分かってきた．
今回，EGFR遺伝子変異陽性の肺腺癌における治療耐性メカニズムの一つである形質転換にTTF-1がどのように関わるかを検討する．本研究の知見は，肺癌治療薬の新規標的分子の発見だけでなく，肺癌発生機序の解明にも役立つことが期待される．
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| Outline of Annual Research Achievements |
Gene Expression Omnibusにて公開されているデータセットを用いて、EGFRチロシンキナーゼ(EGFR-TKI)阻害薬への耐性株の遺伝子発現データを取得した。Gene Ontology解析およびGene Set Enrichment解析を行ったところ、TTF-1低発現株とTTF-1高発現株ではEGFR-TKIの耐性機序は異なり、TTF-1高発現株では上皮間葉転換が耐性に関与していることが示唆された。これは、前年度のin vitro実験の結果と合致するものであった。
今後、TTF-1抗体を用いたクロマチン免疫沈降シークエンスやTTF-1ノックダウン細胞株のRNAシークエンスの解析を進め、TTF-1の制御遺伝子を同定して各種細胞間で比較検討する予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
EGFR-TKI耐性株のデータ取得まで行うことができているため。
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| Strategy for Future Research Activity |
ドライバー遺伝子変異のコンテクストに基づいたTTF-1の機能的解析を進めるとともに、TTF-1抗体を用いたクロマチン免疫沈降シークエンスの解析準備を行って
いる。
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Report
(2 results)
Research Products
(8 results)
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[Journal Article] Prognostic significance of procalcitonin in small cell lung cancer.2022
Author(s)
Ichikawa K, Watanabe S, Miura S, Ohtsubo A, Shoji S, Nozaki K, Tanaka T, Saida Y, Kondo R, Hokari S, Aoki N, Ohshima Y, Koya T, Kikuchi T.
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Journal Title
Transl Lung Cancer Res.
Volume: 11
Issue: 1
Pages: 43-52
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Subsequent systemic therapy for non-small cell lung cancer patients with immune checkpoint inhibitor-related interstitial lung disease.2021
Author(s)
Sato Y, Watanabe S, Ota T, Kushiro K, Fujisaki T, Takahashi M, Ohtsubo A, Shoji S, Nozaki K, Ichikawa K, Hokari S, Kondo R, Hayashi M, Ishikawa H, Miyabayashi T, Abe T, Miura S, Tanaka H, Okajima M, Terada M, Ishida T, Iwashima A, Sato K, Yoshizawa H, Aoki N, Ohshima Y, Koya T, Kikuchi T.
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Journal Title
Transl Lung Cancer Res.
Volume: 10
Issue: 7
Pages: 3132-3143
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] The Prognostic Significance of the Continuous Administration of Anti-PD-1 Antibody via Continuation or Rechallenge After the Occurrence of Immune-Related Adverse Events.2021
Author(s)
Fujisaki T, Watanabe S, Ota T, Kushiro K, Sato Y, Takahashi M, Ohtsubo A, Shoji S, Nozaki K, Ichikawa K, Hokari S, Kondo R, Miyabayashi T, Abe T, Miura S, Tanaka H, Okajima M, Terada M, Matsumoto N, Ishida T, Iwashima A, Sato K, Yoshizawa H, Aoki N, Hayashi M, Ohshima Y, Koya T, Kikuchi T.
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Journal Title
Front Oncol.
Volume: 11
Pages: 704475-704475
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] ニンテダニブはMDSCを抑制することでPD-1阻害剤の抗腫瘍効果を増強する2021
Author(s)
鈴木 遼, 渡部 聡, 有田 将史, 関谷 友樹, 安部 悠子, 佐藤 美由紀, 高橋 美帆, 大坪 亜矢, 庄子 聡, 野嵜 幸一郎, 市川 紘将, 穂苅 諭, 近藤 利恵, 大嶋 康義, 小屋 俊之, 菊地 利明
Organizer
第80回日本癌学会学術集会
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