microRNAとスーパーエンハンサーに着目した悪性リンパ腫のPVT1の役割解明
Project/Area Number |
21K16248
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Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 54010:Hematology and medical oncology-related
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Research Institution | Wakayama Medical University |
Principal Investigator |
細井 裕樹 和歌山県立医科大学, 医学部, 講師 (00646036)
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Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
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Keywords | PVT1 / lncRNA / 8q24染色体転座 / スーパーエンハンサー / microRNA |
Outline of Research at the Start |
悪性リンパ腫患者数は高齢化により増加傾向で、有害事象の少ない分子標的薬の開発につながる悪性リンパ腫の発症機序解明は重要である。8q24染色体転座を有する悪性リンパ腫の予後は不良であり、新たな治療法の開発が望まれている。本研究では8q24に存在する非コードRNAであるPVT1に着目して研究を行う。PVT1は1980年代に同定されたがその機能解析は未だ不十分である。これまでの申請者の研究活動から①PVT1内のmicroRNAと②転座により形成されるスーパーエンハンサーによるPVT1への影響に着目して悪性リンパ腫発症におけるPVT1の役割を明らかにする。
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Outline of Annual Research Achievements |
悪性リンパ腫の中でも特に8番染色体長腕24バンド(8q24)染色体転座を有する悪性リンパ腫の予後は不良であり、治療に難渋することがある。そのため、8q24染色体転座を有する悪性リンパ腫の腫瘍化の機構を明らかにして、新たな治療薬開発につなげることは重要である。染色体転座点近傍には腫瘍発症に重要な遺伝子が存在する。8q24転座点近傍にはガン遺伝子MYCとその下流にPlasmacytoma variant translocation 1 (PVT1)が存在する。PVT1はlong intergenic non-coding RNA(lncRNA)である。本研究の目的は、①PVT1内のmicroRNA (miR)と②転座により形成されるスーパーエンハンサーによるPVT1への影響に着目して悪性リンパ腫発症におけるPVT1の役割を明らかにすることである。 令和4年度はPVT1 5’発現抑制効果を十分に得るためにPVT1 5’領域を欠失させるCRISPRベクターを設計してPVT1 5’発現抑制下での腫瘍細胞増殖変化の検討を試みた。CRISPRベクターをレンチウイルスを用いて8q24転座を有する悪性リンパ腫細胞株への導入を試みている。また、PVT1の腫瘍化に関わる要因としてPVT1プロモーター領域の変異に関しても検討している。悪性リンパ腫症例の骨髄液またはリンパ節から抽出したDNAを用いてプロモーター配列の変異を検討している。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
COVID診療等により実験に制約が生じた。またCRISPR実験にさらなる工夫が必要のため時間を要している。
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Strategy for Future Research Activity |
PVT1 5'発現抑制効果を十分得られるようなCRISPRの実験系を確立する。また、PVT1をアンチセンスオリゴヌクレオチドを用いて発現抑制できないかを血液腫瘍以外の細胞株を用いて検討し、PVT1発現抑制方法を最適化する。
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Report
(2 results)
Research Products
(30 results)
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[Journal Article] Highly efficient Runx1 enhancer eR1-mediated genetic engineering for fetal, child and adult hematopoietic stem cells2023
Author(s)
Koh CP., Bahirvani AG., Wang CQ., Yokomizo T., Ng CEL., Du L., Tergaonkar V., Voon DC., Kitamura H., Hosoi H., Sonoki T., Michelle MMH., Tan LJ., Niibori-Nambu A., Zhang Y., Perkins AS., Hossain Z., Tenen DG., Ito Y., Venkatesh B., Osato M.
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Journal Title
Gene
Volume: 851
Pages: 147049-147049
DOI
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Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Liquid biopsy of plasma and cerebrospinal fluid are useful for detection of intravascular lymphoma with central nervous system symptoms alone.2022
Author(s)
Hosoi H, Tanigawa I, Kosako H, Okamoto A, Iwamoto R, Koh J, Mori M, Hiroi T, Mushino T, Murata S, Murata SI, Tomita A, Sonoki T.
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Journal Title
Annals of Hematology
Volume: 101
Issue: 3
Pages: 709-711
DOI
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Peer Reviewed
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[Presentation] Role of BM aspiration clots: comparison of clots, biopsies, and smears for evaluating BM cellularity.2021
Author(s)
Tanaka K, Hosoi H, Kodama R, Tabata S, Hiroi T, Kida Y, Mushino T, Murata S, Tamura S, Ikeda T, Sonoki T.
Organizer
第83回日本血液学会学術集会
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Author(s)
Kosako H, Hosoi H, Tanaka M, Iwamoto R, Iwahashi Y, Mori Y, Tanigawa I, Sakaki A, Takeda S, Yokoya Y, Tabata S, Yoshida K, Tochino Y, Hiroi T, Yamashita Y, Mushino T, Murata S, Nishikawa A, Tamura S, Jinnin M, Sonoki T.
Organizer
第83回日本血液学会学術集会
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