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DNAメチル化異常を標的とするリキッドバイオプシーを用いた食道癌診断技術の開発

Research Project

Project/Area Number 21K16423
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 55020:Digestive surgery-related
Research InstitutionKagawa University

Principal Investigator

岸野 貴賢  香川大学, 医学部附属病院, 講師 (60738681)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords食道癌 / メチル化マーカー / リキッドバイオプシー / DNAメチル化 / 食道癌早期診断 / DNAメチル化異常
Outline of Research at the Start

これまでの研究で、食道の正常な粘膜に蓄積した「DNAメチル化異常」がアルコールやタバコといった発癌リスクの曝露歴と相関し、食道癌の発癌リスクの予測に有用であることは証明されている。本研究では、血液などの検体を用いて「DNAメチル化異常」を調べることで、食道癌の診断技術の開発を目的とする。

Outline of Annual Research Achievements

過去の研究より、食道癌のメチル化マーカーとしてHOXA9、OPLAH、TFAP2E、ZNF569、TFPI2、TWIST、CCNA1を候補遺伝子としてプライマーを作成。院内に保存している食道癌患者42名の検体(病変部、非病変部、血清)を用いてリアルタイムPCRを施行した。研究の目標としてはリキッドバイオプシーにて血液中に流出したDNAのメチル化を測定することにより、食道癌の早期診断技術の開発を行うこと。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

リアルタイムPCRをまずSYBR GREEN法で施行。院内の保存検体は病変部と非病変部、血清に分けて施行した。いずれも優位な増幅を認めていたが、解析より非特異的な増幅が疑われた。SYBR GREEN法は感度が高いものの、特異度が低いとの欠点がある。そのためリアルタイムPCRをプローブ法に切り替えて行った。結果としては病変部と非病変部ではメチル化を検出することが可能であり、特にHOXA9とZNF569が有用なマーカーの候補としてあげられたが、肝心の血清からはDNAのメチル化を検出することができなかった。

Strategy for Future Research Activity

患者組織からはDNAのメチル化は検出可能ではあったが、血清からは検出はできなかった。原因として血液中に漏出しているDNA量が非常に少ないことが原因として考えられる。今後はデジタルPCRを用いた解析や、新たな候補マーカーの検索を行っていく。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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