• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Creation of IPMN organoid model and elucidation of malignant transformation mechanism by genetic screening

Research Project

Project/Area Number 21K16451
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 55020:Digestive surgery-related
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

OKUMURA Takashi  九州大学, 医学研究院, 共同研究員 (00883422)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
KeywordsIPMN / オルガノイド / 腫瘍微小環境 / 微小環境因子 / scRNA-seq / 膵オルガノイド / IPMN微小環境 / CRISPR Screening / Single cell RNAseq / 微小環境
Outline of Research at the Start

IPMN(膵管内乳頭状粘液性腫瘍)は膵嚢胞性腫瘍の一つで、膵癌の前駆病変であることが知られているが、その悪性化の機序については解明されていない。KRAS、GNAS、RNF43といった遺伝子変異がIPMNで高頻度にみられることから、これらはIPMNの発生に重要な遺伝子と考えられている。今回、我々はこれらの遺伝子変異をマウス由来膵オルガノイドに導入し、IPMN膵オルガノイドとそれを用いたsyngenic modelによって新たなIPMN疾患モデルを確立し、更に、網羅的遺伝子スクリーニングであるCRISPR Screeningによって、IPMN膵オルガノイドモデルの悪性化責任遺伝子を同定する。

Outline of Final Research Achievements

The purpose of this study was to elucidate the malignant transformation process of IPMN (intraductal papillary mucinous neoplasm), a precancerous lesion of pancreatic cancer, using molecular biological techniques. PDAC organoids retained the morphological characteristics of primary tumors. We have not yet established IPMN organoids, but we are planning to identify niche factors that are necessary for the establishment of IPMN organoids. We established a technique for clustering immune cells in the tumor immune microenvironment using single cell RNA seq in surgical specimens of esophageal cancer.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

膵癌の前癌病変と考えられるIPMNは低悪性度腫瘍であるため、2D培養では維持が困難である。3D培養による擬性構造体であるオルガノイドは、膵癌オルガノイドと実際の組織標本と比較することで分化度に応じた形態学的特徴が維持されることがわかった。分化度が高いほど周囲の微小環境因子に依存していたため、IPMNオルガノイドの樹立・維持には微小環境因子の評価が必要であることが示唆された。微小環境因子はCAFが供給していると考えられ、IPMNオルガノイドと腫瘍微小環境におけるCAFとの関係を解明することは、IPMNの悪性化機序の解明につながると期待される。

Report

(3 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Single‐cell transcriptome analysis reveals functional changes in tumour‐infiltrating B lymphocytes after chemotherapy in oesophageal squamous cell carcinoma2023

    • Author(s)
      Nakamura S, Ohuchida K, Ohtsubo Y, Yamada Y, Tsutsumi C, Okuda S, Hisano K, Mochida Y, Shinkawa T, Iwamoto C, Torata N, Mizuuchi Y, Shindo K, Nakata K, Moriyama T, Torisu T, Nagai E, Morisaki T, Kitazono T, Oda Y, Nakamura M
    • Journal Title

      Clinical and Translational Medicine

      Volume: 13 Issue: 1

    • DOI

      10.1002/ctm2.1181

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Subtypes in pancreatic ductal adenocarcinoma based on niche factor dependency show distinct drug treatment responses2022

    • Author(s)
      Shinkawa Tomohiko、Ohuchida Kenoki、Mochida Yuki、Sakihama Kukiko、Iwamoto Chika、Abe Toshiya、Ideno Noboru、Mizuuchi Yusuke、Shindo Koji、Ikenaga Naoki、Moriyama Taiki、Nakata Kohei、Oda Yoshinao、Nakamura Masafumi
    • Journal Title

      Journal of Experimental Clinical Cancer Research

      Volume: 41 Issue: 1 Pages: 89-89

    • DOI

      10.1186/s13046-022-02301-9

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] scRNA-seqを用いた胃癌cancer-associated fibroblastのheterogeneityの解明2022

    • Author(s)
      堤親範、大内田研宙、中村祥一、奥田翔、久野恭子、大坪慶志輝、進藤幸治、森山大樹、水内祐介、仲田興平、中村雅史
    • Organizer
      JDDW2022(第30回日本消化器関連学会週間)
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] scRNA-seqを用いた食道扁平上皮癌浸潤マクロファージに対する術前化学療法の影響の解明2022

    • Author(s)
      奥田翔、大内田研宙、寅田信博、永吉絹子、水内祐介、進藤幸治、池永直樹、森山大樹、仲田興平、中村雅史
    • Organizer
      第77回日本消化器外科学会総会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] シングルセル解析を用いた食道癌内B細胞における機能解析2022

    • Author(s)
      中村祥一、大内田研宙、奥田翔、大坪慶志輝、寅田信博、水内祐介、進藤幸治、仲田興平、森山大樹、中村雅史
    • Organizer
      第77回日本消化器外科学会総会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] scRNA-seqを用いた術前化学療法に伴う食道癌内B細胞の不均一性の変動の解析2022

    • Author(s)
      中村祥一、大内田研宙、奥田翔、大坪慶志輝、寅田信博、水内祐介、進藤幸治、仲田興平、森山大樹、中村雅史
    • Organizer
      第122回日本外科学会定期学術集会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] シングルセル解析による食道癌内の腫瘍浸潤マクロファージの食作用の評価2021

    • Author(s)
      中村祥一、大内田研宙、奥田翔、大坪慶志輝、寅田信博、水内祐介、進藤幸治、仲田興平、森山大樹、中村雅史
    • Organizer
      第29回日本消化器関連学会週間(JDDW 2021)
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Single-cell RNA-sequenceを用いた食道扁平上皮癌の免疫環境についての解析2021

    • Author(s)
      奥田翔、大内田研宙、大坪慶志輝、中村祥一、久野恭子、持田郁己、新川智彦、寅田信博、水内祐介、進藤幸治、森山大樹、仲田興平、中村雅史
    • Organizer
      第29回日本消化器関連学会週間(JDDW 2021)
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Single cell RNA sequenceを用いた家族性大腸腺腫症におけるmacrophageのheterogeneityの解明2021

    • Author(s)
      久野恭子、水内祐介、大内田研宙、中村祥一、奥田翔、大坪慶志輝、佐田政史、永吉絹子、寅田信博、進藤幸治、仲田興平、森山大樹、永井俊太郎、中村雅史
    • Organizer
      第29回日本消化器関連学会週間(JDDW 2021)
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi