Project/Area Number |
21K16650
|
Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
|
Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 56020:Orthopedics-related
|
Research Institution | Shinshu University |
Principal Investigator |
鬼頭 宗久 信州大学, 医学部附属病院, 助教(診療) (60624707)
|
Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2023-03-31
|
Project Status |
Granted (Fiscal Year 2021)
|
Budget Amount *help |
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
|
Keywords | 筋肉内粘液腫 / GNAS遺伝子 / 次世代シーケンサー / 遺伝子解析 |
Outline of Research at the Start |
筋肉内粘液腫は良性の腫瘍であるが、粘液性悪性軟部腫瘍との鑑別が困難な場合が多く、臨床医にとって治療方針の決定に苦慮する厄介な軟部腫瘍である。本研究では、GNAS遺伝子変異が筋肉内粘液腫に特異的であるかを検索し、また既知の変異以外に疾患特異的な遺伝子変異が存在するか検索する。そして各種遺伝子検索方法の中で、GNAS変異の検出が総合的に最適である遺伝子解析法を明らかにすることを目的とした研究である。このことは臨床医の治療方針決定の手助けとなり、過剰治療・過少治療を減少させ患者の大きな利益へとつながると考える。
|
Outline of Annual Research Achievements |
筋肉内粘液腫は良性の軟部腫瘍であるが、粘液性悪性軟部腫瘍(特に低悪性度粘液線維肉腫)との鑑別が困難な場合が多い。良性腫瘍と悪性腫瘍では治療方法が大きく異なるため、臨床医にとって治療方針の決定に苦慮する厄介な軟部腫瘍である。筋肉内粘液腫は、GNAS遺伝子のミスセンス突然変異が報告されている。次世代シーケンサーの登場によりこれまでにExon8 Arg201・Exon9 Gln227のミスセンス突然変異が報告されており、GNAS変異の同定は粘液性悪性軟部腫瘍との鑑別に有用と考えられる。本研究では、まず検体量の多い手術検体での筋肉内粘液腫のGNAS遺伝子のミスセンス突然変異を次世代シーケンサー・PCRダイレクトシーケンス法で解析を行った。次世代シーケンサーでの解析では、9検体中5検体で従来報告されているGNASの遺伝子変異(Exon8: Arg201Cys, Arg201His)が検出された。またPCRダイレクトシーケンス法では、Exon8 Arg201の変異は9検体中3例(Arg201Cys 2例、Arg201His 1例)で検出され、Exon9 Gln227の変異は7検体中で検出されたものはなかった。
|
Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
手術検体における筋肉内粘液腫のGNAS遺伝子変異検索は、次世代シーケンサーでは9検体中5検体で従来の遺伝子変異を同定できた。またPCRダイレクトシーケンス法では、9検体中3検体のみ変異が検出された。筋肉内粘液腫は腫瘍細胞割合が少ないためPCRダイレクトシークエンス法では変異検出感度が低いことが予想された。現時点ではすべての対象手術検体での遺伝子検索がまだ終了していないため当初の予定より若干進捗状況は遅れている。
|
Strategy for Future Research Activity |
手術検体の遺伝子検索をすべて行い、その後生検検体での遺伝子検索を行っていく。またPCRダイレクトシークエンス法より高感度のPCRベースの検査方法を検討していき、最適にGNAS変異を同定できる解析方法を検索していく。
|