CRISPR libraryを用いた卵巣癌プロモーター制御による新規治療法の検討
| Project/Area Number |
21K16800
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 56040:Obstetrics and gynecology-related
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| Research Institution | Tokyo Medical University |
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Principal Investigator |
山本 阿紀子 東京医科大学, 医学部, 講師 (50531224)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
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| Keywords | CRISPR / 卵巣癌 / プロモーター解析 / MYC / 癌遺伝子 |
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| Outline of Research at the Start |
癌遺伝子MYCは約40%の卵巣癌で高増幅し、腫瘍の発生や進展に関与することが予測されるが、その発現を阻害する治療薬はいまだない。
MYCの発現には、様々な機構が複雑に働いていることが報告されているが、プロモーター領域の制御については完全には解明されていない。そこで、本研究ではCRISPR libraryの技術を卵巣癌の細胞株に適応し、MYCのプロモーター領域に作用し転写活性を制御する分子のスクリーニングを行い、同定された分子がMYCの発現を阻害するかの検証を行う。この研究の成果はMYCの発現調節機構の解明だけでなく、卵巣癌に対する新たな阻害薬研究に寄与することが期待される。
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| Outline of Annual Research Achievements |
卵巣癌細胞株であるOVSAHOにMYCのプロモーター領域と八放サンゴDendraに由来する蛍光タンパクを組み込んだベクターを導入し、MYCのプロモーター領域を発現するOVSAHO細胞を樹立した。この細胞はMYCが過剰発現すれば光照射により蛍光を発するように設計されている。この細胞に対してCRISPRLibraryを導入することにより、MYCが過剰発現していると予想される細胞をDendraの発光を用いてソーティングし、回収した。予備実験で用いたHEK細胞はsingle cellで回収し、十分解析に耐えられたが、しかし、OVSAHOはクローニングが難しく、回収方法を変更しながら、解析できる細胞数までクローニングできる方法を模索した。ソーティングゲートを変更しながら、うまく回収できた細胞から抽出したDNAを用いて、組み込まれたgRNAの配列をサンガーシーケンスを用いて解析すると、いずれもMYCそのものであることが判明した。そこで、OVSAHOに導入するベクターのMYCのgRNAの配列に変異を加え、同様の実験を行ったが、それでもシーケンスの結果はMYCであった。改善策としてMYCのgRNAの配列部位を完全に欠失させたベクターを作成し、OVSAHOに導入した。この細胞を用いてプロモーターアッセイを行うと、MYCgRNAをインフェクションさせてもプロモーター活性が上昇しないことを確認した。そこで、この細胞に対してCRISPRLibraryを導入し、再度ソーティングを行い、細胞を回収した。回収した細胞の一部を用いて、gRNA領域のTOPOクローニングを行った後に、サンガーシーケンスにて導入されたｇRNAを確認したところ、複数個の分子が同定し得た。そのため、このサンプルに対して次世代シーケンスを行い、MYCの活性を挙げる分子の同定を予定している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
当初、回収した細胞にたいして導入されたと判断されるｇRNAが複数種類確認できればただちに次世代シーケンスに提出する予定としていた。しかし、回収した細胞から検出されたのはMYCのみであることが、条件を変更しても続いたため、MYC以外の分子が検出される方法を樹立するのに予定以上の時間を要した。
また、研究者が2022年7月より3か月間、海外での医療活動に従事していたためその間の研究が滞ったことも進捗が遅れる原因となっている。
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| Strategy for Future Research Activity |
現在次世代シーケンスの結果待ちである。結果の解析をし、候補となる遺伝子が同定されれば、その分子を用いて、検証実験を進めていく。具体的にはOVSAHOに対して、これらの分子を過剰発現させたときのMYCのmRNAやタンパクレベルでの発現を検証することや、実際の臨床検体を用いて、タンパクの発現の確認や、予後との相関を解析する予定である。またその分子を阻害することによる抗腫瘍効果を細胞実験で行い、うまく、抗腫瘍効果を確認できれば動物を用いた生体内での反応を確認する。
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Report
(2 results)
Research Products
(8 results)
