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Functional analysis of syndromic hearing loss and its application to gene therapy

Research Project

Project/Area Number 21K16863
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 56050:Otorhinolaryngology-related
Research InstitutionResearch Institute, Shiga Medical Center

Principal Investigator

十名 理紗  滋賀県立総合病院(研究所), その他部局等, 主任研究員 (30717020)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2024: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2023: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2022: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywords難聴 / 遺伝性疾患 / 症候性難聴 / てんかん / 内耳
Outline of Research at the Start

先天性高度難聴の頻度は出生1000人に1人であり、70%が遺伝性難聴、そのうちの30%が症候性難聴、70%が非症候性難聴である。症候性難聴の多くは稀な疾患であり、個々の病態の解明はほとんどされていない。ヒトTBC1D24遺伝子は、遺伝子変異の場所の違いにより、常染色体劣性遺伝形式をとる非症候性難聴 (DFNB86)、常染色体優性遺伝を示す非症候性難聴 (DFNA65)、てんかん、難聴とてんかんを合併する全身疾患 (DOORS 症候群) を引き起こす。本研究では、CRISPR/Cas9ゲノム編集を用いてTbc1d24アレル特異的変異マウスを作成し機能解析を行う。

Outline of Annual Research Achievements

本研究は、非症候性難聴および症候性難聴の両者の原因となるTBC1D24遺伝子に着目し研究を進めている。CRISPR/Cas9ゲノム編集を用いて、TBC1D24の非症候性てんかんのモデルであるS324Tfs*3変異マウス、非症候性難聴DFNB86のモデルであるD70Y変異マウスおよびDFNA65のモデルであるS178L変異マウス、症候性難聴のモデルであるH336Qfs*12変異マウスを作成した。このうち、S324Tfs*3マウスは、生後2週以降にけいれん発作を起こし、生後3週で死に至ることがわかっている。
Tbc1d24のS324Tfs*3変異はマイクロエクソン上にあり、S324Tfs*3マウスにアンチセンスオリゴヌクレオチド (ASO: Antisense Oligonucleotides) を投与することによって、てんかん発作の抑制や生存期間が延長されるかをアウトカムとし、今後のヒトに対する遺伝子治療への応用を目的としている。2022年度までにTbc1d24遺伝子のS324Tfs*3変異マウスおよびコントロールマウスの腎細胞を用いてprimary cell lineを作成した。また、マイクロエクソンに作用する複数のASOを設計し、primary cell lineに対してどの配列のASOが最も効果があるかを評価した。2022年度は、in vitroで効果の高かったASOを2種類選択し、実際に変異マウスへの投与を開始した。
一方、TBC1D24と相互作用するタンパク質としてKIBRAを同定した。TBC1D24はTBCドメインとTLDcドメインからなるが、これまでの研究でマウスのKIBRAは、TBC1D24のTLDcドメインと相互作用することを明らかにした。2022年度は、これまで相互作用を確認していたマウスでの配列に加え、ヒトでの配列においても相互作用するかを評価した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ASOを用いた遺伝子治療に関しては、おおむね計画通りに研究が進んでいる。TBC1D24と相互作用するタンパク質の機能解析に関しては、マウスにおけるタンパク質の配列で評価するのに加え、ヒトの配列でも評価を追加したため予定よりはやや遅れているが、全体としての研究はおおむね順調である。

Strategy for Future Research Activity

研究はおおむね計画通りに行われているので、今後も研究計画通りに研究を進めていく。

Report

(2 results)
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (1 results)

  • [Int'l Joint Research] NIDCD/NIH/University of Iowa(米国)

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] NIDCD/NIH(米国)

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] University of the Punjab(パキスタン)

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] University of Ibadan(ナイジェリア)

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Journal Article] Unbalanced bidirectional radial stiffness gradients within the organ of Corti promoted by TRIOBP2022

    • Author(s)
      Babahosseini Hesam、Belyantseva Inna A.、Yousaf Rizwan、Tona Risa、Hadi Shadan、Inagaki Sayaka、Wilson Elizabeth、Kitajiri Shin-ichiro、Frolenkov Gregory I.、Friedman Thomas B.、Cartagena-Rivera Alexander X.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119 Issue: 26

    • DOI

      10.1073/pnas.2115190119

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Detailed clinical features and genotype-phenotype correlation in an OTOF-related hearing loss cohort in Japan.2022

    • Author(s)
      Iwasa YI, Nishio SY, Yoshimura H,..., Naito Y,..., Usami SI
    • Journal Title

      Hum Genet

      Volume: 141 Issue: 3-4 Pages: 865-875

    • DOI

      10.1007/s00439-021-02351-7

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Variants of human <i>CLDN9</i> cause mild to profound hearing loss2021

    • Author(s)
      Ramzan Memoona、Philippe Christophe、Belyantseva Inna A.、Nakano Yoko、Fenollar‐Ferrer Cristina、Tona Risa、Yousaf Rizwan、Basheer Rasheeda、Imtiaz Ayesha、Faridi Rabia、Vitobello Antonio、Kartti Souad、Zarrik Oumaima、Witmer P. Dane、Banfi Botond、Moutton Sebastien、Friedman Thomas B.、Naz Sadaf、et. al.
    • Journal Title

      Human Mutation

      Volume: 42 Issue: 10 Pages: 1321-1335

    • DOI

      10.1002/humu.24260

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Genomic analysis of childhood hearing loss in the Yoruba population of Nigeria2021

    • Author(s)
      Adeyemo Adebolajo、Faridi Rabia、Chattaraj Parna、Yousaf Rizwan、Tona Risa、Okorie Samuel、Bharadwaj Thashi、Nouel-Saied Liz M.、Acharya Anushree、Schrauwen Isabelle、Morell Robert J.、Leal Suzanne M.、Friedman Thomas B.、Griffith Andrew J.、Roux Isabelle
    • Journal Title

      European Journal of Human Genetics

      Volume: 30 Issue: 1 Pages: 42-52

    • DOI

      10.1038/s41431-021-00984-w

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] けいれん発作を伴う症候性難聴遺伝子TBC1D24の機能解析2021

    • Author(s)
      十名理紗、大森孝一
    • Organizer
      第122回日本耳鼻咽喉科学会総会・学術講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2023-12-25  

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