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熱スパイクによって誘起される分子運動およびその生物作用の解明

Research Project

Project/Area Number 21K18148
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 14:Plasma science and related fields
Research InstitutionNational Institutes for Quantum Science and Technology

Principal Investigator

鹿園 直哉  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, 上席研究員 (10354961)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小林 正規  千葉工業大学, 惑星探査研究センター, 主席研究員 (70312080)
森林 健悟  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, 上席研究員 (70354975)
米谷 佳晃  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 関西光量子科学研究所 量子応用光学研究部, 主幹研究員 (80399419)
Project Period (FY) 2021-07-09 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥25,610,000 (Direct Cost: ¥19,700,000、Indirect Cost: ¥5,910,000)
Fiscal Year 2025: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2024: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2021: ¥7,930,000 (Direct Cost: ¥6,100,000、Indirect Cost: ¥1,830,000)
Keywords量子ビーム / 熱スパイク / 水の密度変化 / シミュレーション / DNA損傷 / イオンビーム / 分子運動 / 生物作用
Outline of Research at the Start

量子ビームによって付与されるエネルギーの大半は熱に変換され局所的な高温状態(熱スパイク)が生じる。熱スパイクは生物作用に関与しないと一般的に考えられてきたが、その根拠は十分とは言い難い。本研究では、量子ビームによって誘起される熱スパイクに由来する圧力波がDNAに作用し、生物作用を左右する可能性を調べる。本研究は、量子ビーム生物作用の原因として電離・励起に加え新たなメカニズムを提唱する点で極めて独創的かつ挑戦的である。一方で、本研究の推進は、がん治療における患部への重粒子イオン照射をリアルタイムで観測する新規技術確立につながるため、治療の高度化に極めて大きな貢献をすることが期待できる。

Outline of Annual Research Achievements

量子ビームによって付与されるエネルギーの大半は熱に変換され局所的な高温状態(熱スパイク)が生じる。熱スパイクは生物作用に関与しないと一般的に考えられているが、これまでの研究対象は主にタンパク質等であり、生物作用を左右する可能性についての検討は十分とはいえない。本研究では、近年向上が目覚ましい各種解析技術を組み合わせ、量子ビームによって誘起される熱スパイクに由来する圧力波がDNAに作用し、生物作用を左右する可能性を明らかにすることを目指して研究を進める。
本年度は昨年度に引き続き、鉄イオンビーム照射後の水の温度上昇による密度変化を測定するための超音波エコー測定による実験を進めた。超音波エコーシグナルが鉄イオンビームの飛跡の中のどこで生じているかに関する知見を得るために、電離箱を用いビームの進行方向での電離量を調べた。超音波エコーシグナルのビーム進行方向の発生位置を調べたところ、シグナルは、鉄イオンビームが停止する直前の最大のエネルギーを付与するブラッグピークの位置で最も高頻度に検出されることが明らかになった。このことから、超音波エコーシグナルはエネルギーの付与量と密接に関係することが示唆された。さらに、超音波エコーシグナルはブラッグピークの位置よりも深い位置でも観測されることもわかった。ビーム照射によって生じる破砕核に由来するシグナルが検出されていると考えている。
また本年度は、昨年度までに開発した、量子ビームのエネルギー付与による軌道付近の水分子の挙動を調べる分子動力学計算コードを用い、軌道付近の水の密度および温度変化を調べた。その結果、瞬間的に大きなエネルギーが局所的に付与されると、軌道付近の温度は上昇するとともに密度は低下するが、その範囲はナノメーターの領域であり、数十ピコ秒のオーダーで照射前の状態に戻ることが明らかとなった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

本年度は量子ビーム照射後の水の密度変化を調べるための実験を本格的に開始し、エコーシグナルが主にブラッグピークで生じていることを明らかにした。また、開発したシミュレーションコードを使い、熱が与えられた後の水分子の挙動を調べた。しかしながら、量子ビーム照射実験施設(HIMAC)が電力削減のためマシンタイムの割り当てを削減したため、量子ビームによって照射される水の状態を変化させたときにエコーシグナルがどのように影響を受けるかを調べる実験を行うことができず、量子ビーム照射実験は当初の予定よりやや遅れている。

Strategy for Future Research Activity

量子ビームによって照射される水の状態を変化させたときエコーシグナルがどのように影響を受けるかを調べる実験を進める。エコーシグナルは、照射直後に生じたナノメーターのオーダーの空洞に水中に溶存する気体が入り込んだ気泡である可能性がある。そこで、重曹など水中の溶存気体を増やす操作を行い、シグナルの観測に影響があるか明らかにする実験を行う。また上記実験では、超音波の音圧、振動数、パワー等を変化させながら観測を行い、シグナルの実体についての知見を集める。一方で、分子動力学シミュレーションにより、量子ビームによって付与されるエネルギーが熱エネルギーとなって水に瞬間的・局所的に与えられた後の個々の水分子の挙動を調べる計算を進め、ビームの軌道周辺の圧力の変化について調べていく。
これらの実験および計算を進めることにより、量子ビーム照射後の水の分子運動に関する理解を深める。

Report

(4 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Comments on the Screening Results   Research-status Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 1 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Unsolved problem of long-range interactions: dipolar spin-ice study2024

    • Author(s)
      Yonetani Yoshiteru
    • Journal Title

      Journal of Physics: Condensed Matter

      Volume: 36 Issue: 17 Pages: 175401-175401

    • DOI

      10.1088/1361-648x/ad1ca6

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multi-scale simulations aiming to advance heavy ion beam cancer therapy2023

    • Author(s)
      Moribayashi K.、Matsubara H.、Yonetani Y.、Shikazono N.
    • Journal Title

      AIP Conference Proceedings

      Volume: 2756 Pages: 30001-30001

    • DOI

      10.1063/5.0140807

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Proximity Estimation and Quantification of Ionizing Radiation-induced DNA Lesions in Aqueous Media using Fluorescence Spectroscopy2023

    • Author(s)
      Akamatsu Ken、Satoh Katsuya、Shikazono Naoya、Saito Takeshi
    • Journal Title

      Radiation Research

      Volume: 201 Issue: 2 Pages: 150-159

    • DOI

      10.1667/rade-23-00145.1

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Strange layer structure of dipolar spins formed on the spin-ice lattice2023

    • Author(s)
      Y. Yonetani
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters

      Volume: 817 Pages: 140406-140406

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2023.140406

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Formation of clustered DNA damage in vivo upon irradiation with ionizing radiation: Visualization and analysis with atomic force microscopy2022

    • Author(s)
      Nakano Toshiaki、Akamatsu Ken、Tsuda Masataka、Tujimoto Ayane、Hirayama Ryoichi、Hiromoto Takeshi、Tamada Taro、Ide Hiroshi、Shikazono Naoya
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119 Issue: 13

    • DOI

      10.1073/pnas.2119132119

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Debye shield formed by track potential and transport of secondary electrons in heavy ion irradiation2021

    • Author(s)
      Kengo Moribayashi
    • Journal Title

      Radiation Physics and Chemistry

      Volume: 184 Pages: 109436-109436

    • DOI

      10.1016/j.radphyschem.2021.109436

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Molecular dynamics simulation of fluorescent dye-labeled DNA with apurinic/apyrimidinic sites2024

    • Author(s)
      Masumoto Kotaro, Fujiwara Susumu, Mizuguchi Tomoko, Yonetani Yoshiteru, Shikazono Naoya, Akamatsu Ken, Nakamura Hiroaki
    • Organizer
      AROB-ISBC-SWARM 2024
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      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analysis of orientation factors of gapped DNA labeled with fluorescent probes by molecular dynamics simulation2024

    • Author(s)
      Hashi Takumi Timothy , Fujiwara Susumu , Mizuguchi Tomoko , Yonetani Yoshiteru , Shikazono Naoya , Akamatsu Ken , Nakamura Hiroaki
    • Organizer
      AROB-ISBC-SWARM 2024
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      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 放射線により生じる高複雑度のDNA損傷の可視化と修復機構の解明2023

    • Author(s)
      中野敏彰 , 赤松憲 , 鹿園直哉
    • Organizer
      日本放射線影響学会第66回大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 双極子スピンアイスの長距離相互作用と相転移2023

    • Author(s)
      米谷佳晃
    • Organizer
      日本物理学会第78回年次大会
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      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Molecular Dynamics Study on Cluster Damaged DNA Containing Apurinic/Apyrimidinic Sites on the Same Strand2023

    • Author(s)
      Terakawa, K., Fujiwara, S., Mizuguhi, T., Yonetani, Y., Shikazono, N., Akamatsu, K., Nakamura, H.
    • Organizer
      AROB-ISBC-SWARM 2023
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 電離放射線を照射したTK6細胞におけるゲノムDNA損傷の原子間力顕微鏡(AFM)による直接可視化2022

    • Author(s)
      中野敏彰、赤松憲、津田雅貴、井出博、鹿園直哉
    • Organizer
      日本放射線影響学会第65回大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 細胞模擬条件下で生じた放射線DNA損傷の局在性評価のための蛍光異方性解析2022

    • Author(s)
      赤松憲、鹿園直哉、佐藤勝也、齊藤剛
    • Organizer
      日本放射線影響学会第65回大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Direct visualization of isolated and clustered DNA damage using atomic force microscope (AFM) in TK6 cells exposed to ionizing radiation2022

    • Author(s)
      Nakano, T., Akamatsu, K., Shikazono, N.
    • Organizer
      68th Annual Meeting of Radiation Research Society
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 脱塩基部位からなるクラスターDNA損傷の分子動力学シミュレーション2022

    • Author(s)
      寺川和志、藤原進、水口朋子、米谷佳晃、鹿園直哉、赤松憲、中村浩章
    • Organizer
      量子生命科学会第4回大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 放射線照射したプラスミドDNAに生じたクラスター損傷のFRET分析―乾燥及び細胞模擬条件下での比較2021

    • Author(s)
      赤松憲、鹿園直哉
    • Organizer
      日本影響学会第64回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 放射線照射した細胞に生じるDNA損傷の可視化2021

    • Author(s)
      中野敏彰、赤松憲、津田雅貴、井出博、平山亮一、廣本武史、玉田太郎、鹿園直哉
    • Organizer
      日本影響学会第64回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] MULTI-SCALE SIMULATIONS AIMING TO ADVACE HEAVY ION BEAM CANCER THERAPY2021

    • Author(s)
      Moribayashi, K., Matsubara, H., Yonetani, Y., Shikazono, N.
    • Organizer
      COMDATA2021
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 重イオンビーム照射で形成する自己組織化とDNA損傷の可能性2021

    • Author(s)
      森林健悟
    • Organizer
      量子生命科学会第3回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 重イオンビーム照射による散逸構造,自己組織化形成の可能性2021

    • Author(s)
      森林健悟
    • Organizer
      日本物理学会2021年秋季大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-07-13   Modified: 2024-12-25  

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