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Novel Platform for Bioorganism Identification Optimised for Archaeological Research

Research Project

Project/Area Number 21K18382
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 3:History, archaeology, museology, and related fields
Research InstitutionOsaka University (2022-2023)
Teikyo University (2021)

Principal Investigator

OSHIKANE Hiroyuki  大阪大学, 大学院薬学研究科, 特任准教授(常勤) (10727283)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 植月 学  帝京大学, 付置研究所, 准教授 (00308149)
藤澤 明  帝京大学, 付置研究所, 准教授 (70720960)
上田 たかね  帝京大学, 医学部, 講師 (80459312)
Project Period (FY) 2021-07-09 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords文化財科学 / 考古科学 / DNAバーコード技術 / DNAバーコーディング / aDNA / DNA考古学 / 土壌DNA / 考古学目的に最適化したDNA定量法
Outline of Research at the Start

本研究は、考古資料に残留している核酸情報からの生物種同定における新規方法論の実証
に係り、①発掘現場での核酸の定量を可能にする方法論の実証、②経年変化により損傷したDNAを復元できる方法論の実証、および③その他核酸からの生物種同定法の確立を目的としており、限られた考古資料から最大限の情報抽出を可能にする新規方法論構築に関する研究である。本研究の実現により生物種の株・系統に至るまでの高精度な生物情報をもたらすと共に、生物種の時間的・空間的拡がりに対する理解を提供できることから、それぞれの時代における古食性や環境・文化・技法を現代に復元できる極めて有力な研究ツールとなることが期待される。

Outline of Final Research Achievements

This study pertains to the development of novel analytical methodologies capable of visualising ancient people, geographic and chronological information, and technology through high-end biological tools. Although it is still deemed to be technically demanding to analyse ancient DNAs, we succeeded in developing novel methodologies comprising a direct quantification system for environmental DNA coupled with DNA barcoding via direct PCR method, which allows for substantial detection of the species of interest regardless of the environmental contaminants. Also, we illustrated the source authentication of the gelatins utilised for manufacturing Ukiyo-e, Japanese classical block printing via our developed methodologies. We hope that these molecular methods will pave the way for further development of unprecedented visualisation techniques for ancient samples.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

文化や歴史は過去から現代に至るまでその長い時間の中で形作られ、人々も離合集散を繰り返してきたが、従来的な方法論ではその具体的な流れを知ることに限度があった。一方、昨今の生命科学の発展によりDNAを通した可視化が可能となってきており、考古学や文化財学における応用も為せる様になってきた。本研究では本研究グループで独自に開発したDNAを通した可視化技術の有効性について科学的な実証に成功した。本成果は人々がどの様に生き、どの様な文化を形成していたかについて継承する道筋の提供に貢献すると考えられ、今後の人文知を現代の科学技術を通して支援する方法論の学術的基盤の一端に発展することを期待している。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2023 2022

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Animal species identification utilising DNAs extracted from traditionally manufactured gelatin (Wanikawa)2022

    • Author(s)
      Haruki Kuramata, Miho Hashiba, Yuriko Kai, Kazuhisa Nishizawa, Tsuyoshi Inoue, Takane Kikuchi-Ueda, Manabu Uetsuki, Kazuya Yamauchi, Akira Fujisawa, Hiroyuki Oshikane
    • Journal Title

      Heritage Science

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 183-183

    • DOI

      10.1186/s40494-022-00798-z

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Novel and Rapid on site Nucleic Acid Quantification Platform Customised for Archaeological Science2022

    • Author(s)
      Hiroyuki Oshikane, Miho Hashiba, Takane Kikuchi-Ueda, Yuriko Kai, Tsuyoshi Inoue, Kei Asayama, Ryuichi Fujisaki, Koichi Makimura, Manabu Uetsuki, Akira Fujisawa, Kazuya Yamauchi
    • Journal Title

      Annals of Biomedical Research

      Volume: 4(2) Pages: 1-7

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 浮世絵に使用された膠に対する DNA バーコード技術を通した動物種同定2023

    • Author(s)
      押鐘 浩之, 藤澤 明, 植月 学, 倉股 春希, 橋場 美穂, 甲斐 由理子
    • Organizer
      文化財保存修復学会第45回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 生命科学から見た文化財の世界2023

    • Author(s)
      押鐘 浩之
    • Organizer
      実践女子大学 文芸資料研究所セミナー
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] DNA考古学へのマイルストーン2022

    • Author(s)
      押鐘浩之, 橋場美穂, 上田たかね, 藤澤明, 植月学, 山内和也
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 生体分子が有する情報の効率的な抽出法の検討2022

    • Author(s)
      上田たかね、押鐘浩之
    • Organizer
      2021年度シルクロード学研究会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Book] 考古学ジャーナル2022年7月号2022

    • Author(s)
      押鐘 浩之
    • Total Pages
      4
    • Publisher
      ニューサイエンス社
    • Related Report
      2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-07-13   Modified: 2025-01-30  

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