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Development of Super-Sensitive Immunostaining Method Utilizing DNA Origami Molecular Machines

Research Project

Project/Area Number 21K18882
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 28:Nano/micro science and related fields
Research InstitutionKansai University

Principal Investigator

Kuzuya Akinori  関西大学, 化学生命工学部, 教授 (00456154)

Project Period (FY) 2021-07-09 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
KeywordsDNAオリガミ / 人工抗体 / 免疫染色 / ELISA
Outline of Research at the Start

研究代表者が世界に先駆けて独自に開発した「ターゲット分子を挟むように結合することで閉じた形状へと変形するDNAオリガミ分子機械」をベースに、アロステリックな動作機構を示す「人工抗体」を構築する。ヒトIgGなどの実践的なターゲットを認識する「基質認識部位」、および全体の構造変化を蛍光や酵素活性として検出するための「シグナル発信部位」を組み込むことで、基質に結合してはじめてシグナルを発する、免疫染色やELISAのための世界に類例のない「アロステリック人工抗体」の実用化をめざす。

Outline of Final Research Achievements

1. Introduction of antibody fragments into DNA Pliers, a DNA Origami molecular machine originally developed by the Principal Investigator. Results suggesting that the two antibody fragments introduced to DNA Pliers cooperatively bind to the target molecule were obtained utilizing an allosteric mechanism of the DNA Origami molecular machine. 2. Construction of a signal transmission site for visualization of substrate binding. We succeeded in developing a system in which the emission color of a luminescent protein changes in accordance with the conformational change of DNA Pliers by utilizing the "control of bioluminescence resonance energy transfer (BRET) using DNA scaffolds" system, which had been separately developed.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究における「基質の結合を可視化するためのシグナル発信部位の構築」により、ターゲット分子の結合に伴ってDNA Pliersが構造変化すると、発光タンパク質の発光色が変化するシステムが開発された。これまでDNA Pliersの構造変化はAFMでイメージングする以外、FRETを利用したわずかな蛍光スペクトルの変化からしか観察することができなかったが、この系により、高価な研究用機材を有していない一般家庭などでも、DNA Pliersの開閉を明瞭に区別することができるようになった。DNA Pliersを化学検査キットとして実用化するための最大の障壁が克服され、DNAオリガミ技術の社会実装に近づいた。

Report

(3 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] スイス連邦工科大学チューリッヒ校(スイス)

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  • [Presentation] 遺伝子発現細胞内検出を志向した核酸検出DNAオリガミプローブの開発2022

    • Author(s)
      南出悠貴、真野祐樹、田中喜基、葛谷明紀
    • Organizer
      第68回高分子研究発表会(神戸)
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  • [Presentation] DNA Origami液中微細構造サブnm解析のためのBRETシステムの開発2022

    • Author(s)
      田花汐理、南出悠貴、高野史章、仁木智哉、葛谷明紀
    • Organizer
      第71回高分子討論会
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  • [Presentation] DNAを足場に活用した多色生物発光「システム」の開発2022

    • Author(s)
      高野史章、南出悠貴、仁木智哉、田花汐理、葛谷明紀
    • Organizer
      「細胞を創る」研究会15.0
    • Related Report
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    • Invited
  • [Presentation] DNA OrigamiのAFM観察を活用した単分子抗原検査法の開発2021

    • Author(s)
      南出悠貴、西山健太郎、仁木智哉、秋葉宏樹、永田諭志、鎌田春彦、大野浩章、葛谷明紀
    • Organizer
      第5回分子ロボティクス年次大会
    • Related Report
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  • [Presentation] Visualization of Antigen Binding on DNA Origami Using Atomic Force Microscopy2021

    • Author(s)
      Yuki Minamide, Kentaro Nishiyama, Tomoya Niki, Hiroki Akiba, Satoshi Nagata, Haruhiko Kamada, Hiroaki Ohno, Akinori Kuzuya
    • Organizer
      CBI学会2021年大会
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  • [Book] Molecular Robotics, An Introduction, Satoshi Murata, Ed.2022

    • Author(s)
      Akinori Kuzuya
    • Total Pages
      296
    • Publisher
      Springer Singapore
    • ISBN
      9789811939877
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  • [Remarks] 関西大学 化学生命工学部 知能分子学研究室

    • URL

      https://wps.itc.kansai-u.ac.jp/mol-mach/

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  • [Remarks] 関西大学 学術情報システム

    • URL

      https://gakujo.kansai-u.ac.jp/profile/ja/e43atXUd5P3aff3deIc240Ib6.html

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URL: 

Published: 2021-07-13   Modified: 2024-01-30  

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