• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Role of predator-prey interactions between magnetotactic bacteria and eukaryotic microorganisms on global iron cycle

Research Project

Project/Area Number 21K19071
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

Taoka Azuma  金沢大学, 生命理工学系, 教授 (20401888)

Project Period (FY) 2021-07-09 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywords磁性細菌 / 鉄循環 / 微生物生態 / 生物間相互作用 / 磁気感知 / 細菌 / 原生生物 / 磁鉄鉱 / 環境細菌 / バイオミネラリゼーション / 微生物生態系
Outline of Research at the Start

本研究は、水圏生態系の鉄循環における磁性細菌の役割を評価し、生態系への貢献を検証することを目的とする。鉄は、生命活動に必須の元素であるが、食物網において鉄循環を支えている微生物実態はよく分かっていない。本研究では、磁性細菌と真核微生物の生物間相互作用の実態を明らかにするため、磁性細菌を摂餌する微生物群集(=磁性細菌食者)を同定する。また、磁性細菌の微生物による捕食が環境中の鉄の存在状態や濃度、同じ環境で生息する微生物群集へ及ぼす影響を評価する。

Outline of Final Research Achievements

Magnetotactic bacteria (MTB) are ubiquitous in aquatic environments and contain 100 to 1000 times more iron than normal bacteria. In this study, we examined the role of MTB as iron providers in microbial ecosystems. We found that MTB predation by protist cells increased Fe2+ concentrations in the intra- and extracellular milieu. Moreover, we identified ciliates belonging to the genus Coleps as naturally occurring MTB grazers in a freshwater pond. Furthermore, we investigated the effects of MTB predation on the microbial compositions of a freshwater pond environment. In this study, we evaluated the effects of the interspecies interactions between MTB and eukaryotic microorganisms on environmental iron states and on microbial communities.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

近年の研究成果から、海洋や湖沼などの水環境には多くの磁性細菌が生育しており、環境中の鉄を細胞内に濃集し生態系での鉄循環に重要な役割が期待されるが、磁性細菌が生態系で果たす意義は検討されてこなかった。本研究では、環境中での磁性細菌と真核微生物との被食捕食関係が、環境中の鉄の存在状態や同じニッチで生息する生物群集に及ぼす影響を初めて評価した。本研究の成果は、鉄供給者としての磁性細菌が貢献することを実証したもので、生態系の物質循環における細菌の新たな役割を提案した。本研究は、生態系の保全や制御方法を検討するための基礎知識として学術的社会的な意義がある。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (22 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] カリフォルニア大学バークレ校(米国)

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Journal Article] Influence of protozoan grazing on magnetotactic bacteria on intracellular and extracellular iron content2023

    • Author(s)
      Seki Yusuke、Eguchi Yukako、Taoka Azuma
    • Journal Title

      Environmental Microbiology Reports

      Volume: 15 Issue: 3 Pages: 181-187

    • DOI

      10.1111/1758-2229.13140

    • Related Report
      2023 Annual Research Report 2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Recent advances in studies on magnetosome‐associated proteins composing the bacterial geomagnetic sensor organelle2023

    • Author(s)
      Taoka Azuma、Eguchi Yukako、Shimoshige Rino、Fukumori Yoshihiro
    • Journal Title

      Microbiology and Immunology

      Volume: 67 Issue: 5 Pages: 228-238

    • DOI

      10.1111/1348-0421.13062

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Live-Cell Fluorescence Imaging of Magnetosome Organelle for Magnetotaxis Motility2023

    • Author(s)
      Eguchi Yukako、Taoka Azuma
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2646 Pages: 133-146

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-3060-0_12

    • ISBN
      9781071630594, 9781071630600
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] McaA and McaB control the dynamic positioning of a bacterial magnetic organelle2022

    • Author(s)
      Wan Juan、Monteil Caroline L.、Taoka Azuma、Ernie Gabriel、Park Kieop、Amor Matthieu、Taylor-Cornejo Elias、Lefevre Christopher T.、Komeili Arash
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 5652-5652

    • DOI

      10.1038/s41467-022-32914-9

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 原生生物による磁性細菌の捕食が微生物群集に与える影響2023

    • Author(s)
      福井深月, 池田慶信, 田岡東
    • Organizer
      日本微生物生態学会第36回浜松大会 アジア微生物生態シンポジウム第13回浜松大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 原生生物による磁性細菌捕食が細胞内外の鉄濃度に及ぼす影響 関 雄介, 江口 友佳子, ○田岡 東z2023

    • Author(s)
      関 雄介, 江口 友佳子, 田岡 東
    • Organizer
      日本微生物生態学会第36回浜松大会 アジア微生物生態シンポジウム第13回浜松大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 原生生物による磁性細菌捕食が微生物群集に与える影響2023

    • Author(s)
      福井深月, 田岡東
    • Organizer
      第23回マリンバイオテクノロジー学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] マグネトソームを固定する動的MamK細胞骨格繊維を維持するMamJ機構解明2023

    • Author(s)
      Yuanyuan Pan, Takumi Saito, Yousuke Kikuchi, Azuma Taoka
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 磁性細菌Magnetospirillum magneticum AMB-1細胞内で新規に合成されたマグネトソームの配置機構2023

    • Author(s)
      下茂 梨乃、田岡 東
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Qind株を用いた細胞内で新規合成されたマグネトソーム配置機構解析2022

    • Author(s)
      下茂 梨乃、江口 友佳子、田岡 東
    • Organizer
      第18回 21世紀大腸菌研究会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Dynamic in vitro assembly of MamK cytoskeleton for magnetosome positioning.2022

    • Author(s)
      Azuma Taoka, Yousuke Kikuchi, Takumi Saito, Yoshihiro Fukumori
    • Organizer
      The 7th International Meeting on Magnetotactic Bacteria
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Identification of protozoan predators that feed on magnetotactic bacteria from freshwater environment.2022

    • Author(s)
      Yukako Eguchi, Yusuke Seki, Yoshinobu Ikeda, Yoshihiro Fukumori, Azuma Taoka
    • Organizer
      The 7th International Meeting on Magnetotactic Bacteria
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 細菌オルガネラ「マグネトソーム」の形成初期に起こるタンパク質間相互作用の同定2022

    • Author(s)
      古田 瑞希、江口 友佳子、田岡 東
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] NanoBRET法を用いたマグネトソームタンパク質間相互作用の検出法の開発2022

    • Author(s)
      菊池 咲紀、江口 友佳子、田岡 東
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] AFM Phase Imaging Imaged Binding Process of Extracellular Membrane Vesicles to Living Bacterial Cell Surface2021

    • Author(s)
      Yousuke Kikuchi, Masanori Toyofuku, Nozomu Obana, Nobuhiko Nomura, Azuma Taoka
    • Organizer
      World Microbe Forum (ASM Microbe and FEMS Congress 2021)
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] High-speed AFM phase imaging visualized physical behavior of bacterial membrane vesicles in living bacterial cell surface2021

    • Author(s)
      Yousuke Kikuchi, Masanori Toyofuku, Nozomu Obana, Nobuhiko Nomura, Azuma Taoka
    • Organizer
      EMBO Workshop Bacterial membrane vesicles: Biogenesis, functions and medical applications
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 細菌オルガネラ「マグネトソーム」の形成初期に起こるタンパク質間相互作用の同定2021

    • Author(s)
      古田瑞希、江口友佳子、田岡東、
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] NanoBRET法を用いたマグネトソームのタンパク質相互作用の生細胞イメージング2021

    • Author(s)
      菊池咲紀、江口友佳子、田岡東
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 走査型イオン伝導顕微鏡による生きた細菌表層のナノスケール物性およびその動態の観察2021

    • Author(s)
      渡辺 信嗣,Linhao Sun,菊池 洋輔,田岡 東
    • Organizer
      第95回日本細菌学会総会シンポジウム
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Remarks] 金沢大学 生体分子生理学研究室ホームページ

    • URL

      http://pronet.w3.kanazawa-u.ac.jp/J/index.html

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Remarks] 金沢大学生体分子生理学研究室ホームページ

    • URL

      http://pronet.w3.kanazawa-u.ac.jp/J/index.html

    • Related Report
      2022 Research-status Report 2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-07-13   Modified: 2025-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi