HiFiリードの活用による効率的変異体選抜技術の開発

Research Project

Project/Area Number	21K19105
Research Category	Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Medium-sized Section 39:Agricultural and environmental biology and related fields
Research Institution	University of Tsukuba
Principal Investigator	有泉亨筑波大学, 生命環境系, 准教授 (70575381)
Project Period (FY)	2021-07-09 – 2023-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help	¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000) Fiscal Year 2022: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000) Fiscal Year 2021: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords	トマト / 突然変異体 / TILLING / 第三世代シーケンサー / 第ニ世代シーケンサー
Outline of Research at the Start	既存のTILLING技術の高コストかつ非効率な技術課題を解決するため、20kbの長鎖DNAを99.9%以上の精度のhigh-fidelity（HiFi）リードを生成するロングリードシークエンサーSequel IIをTILLINGに活用する。このHiFiリードを適応させることで既存技術の課題を解決できる可能性がある。そこで本研究はHiFiリードを活用して超効率的な変異体選抜技術の開発を目指す。