| Project/Area Number |
21K19203
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 43:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
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| Research Institution | Japanese Foundation for Cancer Research (2022-2023)
Tohoku University (2021) |
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Principal Investigator |
大学 保一 公益財団法人がん研究会, がん研究所 がんゲノム動態プロジェクト, プロジェクトリーダー (80619875)
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| Project Period (FY) |
2021-07-09 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
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| Keywords | DNA複製 / DNAポリメラーゼ / 転写 / 複製開始点 / 染色体編成 |
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| Outline of Research at the Start |
DNA複製の際も遺伝子発現は常に起きているため，ゲノムDNAの複製を円滑に行う上で，RNA転写との調和は重要である．特に，RNAポリメラーゼはDNA複製装置と干渉し合う関係にあり，その影響は染色体異常の原因になることが報告されている．本研究では，特定のDNAポリメラーゼ合成を全ゲノムに渡ってプロファイリングする実験系：Polymerase usage sequencing （Pu-seq）を用い，転写によるゲノム複製への影響を検証する．さらに，その知見をもとに，人工的な転写制御を介して，外部から導入したDNAの複製をコントロールすることを目指す．
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は、遺伝子転写による複製への影響をより高精度に解析をおこなうため、期間を延長して研究を実施した。２０２２年度の研究から、遺伝子領域内で転写機構がDNAポリメラーゼの機能に影響を及ぼすことが示されたが、本年度は、ヒトゲノム上で特に、この影響が大きい領域の探索を行った。その結果、ゲノム上に数ある染色体脆弱部位（Common Fragile site）のうち、最も不安定な領域であるFRA3BやFRA16Dにおいて、リーディング鎖合成を担うPolεの機能が低下することが示された。 FRA3BやFRA16D領域には長い遺伝子（それぞれFHIT、WWOX）が存在するが、同様に傾向がその他の長い遺伝子の近傍（150kb-1。5Mb）において示された。これらのことから、長い遺伝子の領域内では、転写と複製フォークが干渉する頻度が高く、フォークの進行に付随したリーディング鎖合成へ影響を及ぼしたと考えられる。
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Report
(3 results)
Research Products
(11 results)
