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Development of innovative natural product producing methods based on large-scale genome editing system

Research Project

Project/Area Number 21K19324
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 47:Pharmaceutical sciences and related fields
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

Asai Teigo  東北大学, 薬学研究科, 教授 (60572310)

Project Period (FY) 2021-07-09 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords天然物化学 / 糸状菌 / 生合成 / ゲノム再編成 / 休眠遺伝子 / 制限酵素 / 天然物 / ゲノム再編性
Outline of Research at the Start

微生物のゲノム上には、医薬品候補となり得る新しい天然有機化合物をコードする未利用な生合成遺伝子が数多く存在する。本研究では、TAQingシステムを糸状菌に最適化し、大規模ゲノム再編成を引き起こすことで休眠遺伝子を活性化する、独創的な方法の開発を試みる。本研究が達成されれば、これまで利用困難であった遺伝子由来の天然物の獲得が可能となり、医薬品開発を支える新しい化合物ライブラリーの構築が可能となる。

Outline of Final Research Achievements

Fungi have a huge number of untapped silent biosynthetic gene clusters. In this study, we attempted to develop a method to activate untapped silent biosynthetic gene clusters in fungi by applying a large-scale genome editing technique induced by DNA cleavage with restriction enzymes, with the aim of developing a new method to search for new compounds. After expressing restriction enzymes in Aspergillus niger and cultivated under various conditions. Finally, we found that some mutant strains that shows different morphologies could be obtained by continuing cultivation under around 30 degrees Celsius. We observed that some mutants showed the different secondary metabolite profiles from that of the parental strain. Genome analysis of those mutants suggested the presence of genome editing by restriction enzyme. Although the results are currently preliminal, they show that genome reorganization can be used to activate a wide variety of dormant genes.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

天然物は様々な医薬品開発に貢献してきた重要な医薬資源である。感染症治療薬の分野では顕著な貢献をしており、新規天然物の発見が、新規医薬品の開発を支えてきた。本研究は、糸状菌のゲノム上に存在する未知天然物の生産を誘導することを可能にする技術の開発であり、本研究に端を発する、新規休眠遺伝子活性化法が確立できれば、様々な糸状菌、さらには他の微生物に応用することで、これまでにはない天然物を含むスクリーニングソースの構築が可能になり、新しい作用を示す医薬品の探索を加速させることが期待される。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2023

All Presentation (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Presentation] ゲノム再編成による糸状菌Aspergillus nigerの二次代謝活性化法の検討2023

    • Author(s)
      天井涼太,森下陽平、河野宏光、尾﨑太郎, 菅原章公,太田邦史、浅井禎吾
    • Organizer
      2023年度日本農芸化学会東北支部第158回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 制限酵素により誘導されるゲノム再編成を利用した糸状菌休眠遺伝子活性化法の開発2023

    • Author(s)
      天井涼太,森下陽平、河野宏光、尾﨑太郎, 菅原章公,太田邦史、浅井禎吾
    • Organizer
      第22回糸状菌分子生物学コンファレンス
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 大規模ゲノム再編成を利用した糸状菌休眠遺伝子活性化研究2023

    • Author(s)
      天井涼太,森下陽平、河野宏光、尾﨑太郎, 菅原章公,太田邦史、浅井禎吾
    • Organizer
      第62回 日本薬学会 東北支部大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] ゲノム再編を利用した糸状菌休眠遺伝子由来の二次代謝産物の生産2023

    • Inventor(s)
      浅井禎吾、天井涼太、太田邦史、河野宏光
    • Industrial Property Rights Holder
      浅井禎吾、天井涼太、太田邦史、河野宏光
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2023-121930
    • Filing Date
      2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2021-07-13   Modified: 2025-01-30  

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