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Epigenome manipulation by chemical catalyst-driven abiotic histone acylation

Research Project

Project/Area Number 21K19326
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 47:Pharmaceutical sciences and related fields
Research InstitutionChiba University (2023)
The University of Tokyo (2021-2022)

Principal Investigator

Yamatsugu Kenzo  千葉大学, 大学院薬学研究院, 教授 (30646807)

Project Period (FY) 2021-07-09 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywords触媒 / ヒストン / 生細胞内反応 / アシル化 / 細胞内反応 / プローブ / 環境
Outline of Research at the Start

生命はDNAやタンパク質などの生体分子とそれらに介在する化学反応から成る。その代表がタンパク質の翻訳後修飾であり、その多くは生物触媒である酵素によって導入される。しかし、生体に介入しうる化学反応は、酵素が触媒するものに限定される必要はない。
本研究では、遺伝子転写に密接に関与するヒストンタンパク質を対象に、本来生体にはない翻訳後修飾(アシル化)を我々が培ってきた化学触媒により導入し、細胞のエピゲノムを操作すること、そして、それによる細胞の応答を理解することを目標とする。

Outline of Final Research Achievements

Life emerges from biomolecules such as proteins and the chemical reactions mediated by them. Post-translational modification of proteins is a representative example. The purpose of this research is to manipulate and understand the epigenome of cells by introducing abiotic post-translational modifications, particularly acylation of lysine residues, into histone proteins, which are involved in gene transcription, using chemical catalysts.
We developed an acylation catalyst system with higher activity than conventional ones and succeeded in causing growth inhibition through selective histone acylation and epigenome manipulation of leukemia cells. Furthermore, we developed a new catalyst that activates intracellular acyl-CoA to perform histone acylation, and were able to develop an epigenetic tool that detects the concentration of intracellular acyl-CoA, which changes in response to environmental changes.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、遺伝子転写に関与するヒストンタンパク質を対象に、本来生体にはない翻訳後修飾を化学触媒により導入し、細胞のエピゲノムを操作すること、細胞の応答を理解することを目的とする。生きた細胞のヒストンに非天然型の化学修飾を積極的に導入して細胞のエピゲノム状態を操作する例はなく、本研究の成果は、化学触媒によるエピゲノム操作という革新的な生体機能制御法の開発に発展すると考えられ、分子生物学、薬学、医学などの広い生命科学分野に大きな波及効果を持つ。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (43 results)

All 2024 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (38 results) (of which Int'l Joint Research: 13 results,  Invited: 23 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Catalytic Approaches to Chemo- and Site-Selective Transformation of Carbohydrates2023

    • Author(s)
      Yamatsugu Kenzo、Kanai Motomu
    • Journal Title

      Chemical Reviews

      Volume: 123 Issue: 10 Pages: 6793-6838

    • DOI

      10.1021/acs.chemrev.2c00892

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      Mauro E.、Lapaillerie D.、Tumiotto C.、Charlier C.、Martins F.、Sousa S. F.、M?tifiot M.、Weigel P.、Yamatsugu K.、Kanai M.、Munier-Lehmann H.、Richetta C.、Maisch M.、Dutrieux J.、Batisse J.、Ruff M.、Delelis O.、Lesbats P.、Parissi V.
    • Journal Title

      mBio

      Volume: 14

    • DOI

      10.1128/mbio.01083-23

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      Habazaki Misuzu、Mizumoto Shinsuke、Kajino Hidetoshi、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi、Kawashima Shigehiro A.、Yamatsugu Kenzo、Kanai Motomu
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 14 Issue: 1 Pages: 5790-5790

    • DOI

      10.1038/s41467-023-41426-z

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      Fujimura Akiko、Ishida Hisashi、Nozaki Tamiko、Terada Shuhei、Azumaya Yuto、Ishiguro Tadashi、Kamimura Yugo R.、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi、Kono Hidetoshi、Yamatsugu Kenzo、Kawashima Shigehiro A.、Kanai Motomu
    • Journal Title

      ACS Central Science

      Volume: 9 Issue: 11 Pages: 2115-2128

    • DOI

      10.1021/acscentsci.3c00930

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Published: 2021-07-13   Modified: 2025-01-30  

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