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Identification and validation of colitis associated cancer driver genes.

Research Project

Project/Area Number 21K19421
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 50:Oncology and related fields
Research InstitutionNational Cancer Center Japan

Principal Investigator

Takeda Haruna  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (80647975)

Project Period (FY) 2021-07-09 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords生体内スクリーニング / 大腸がん / マウスモデル / 高脂肪食 / 大腸炎 / DSS / トランスポゾン / スクリーニング
Outline of Research at the Start

潰瘍性大腸炎患者の大腸がん発症リスクは、通常より1.7-2.4倍高まる。慢性炎症を伴うがん形成は、TP53経路異常やエピゲノム脱制御を介していると考えられ、散発性大腸がんとは異なる分子機構で大腸がん形成が促進されている可能性があるが、詳細な分子機構や関与する遺伝子の全体像はいまだ不明確である。そこで本研究では、1)Sleeping Beauty挿入変異誘発法を用いたマウス生体内スクリーニング、2)潰瘍性大腸炎関連大腸がん由来の臨床検体を用いた解析、3)候補遺伝子の機能検証、を行うことで慢性炎症を伴うがん特異的に機能する大腸がんドライバー遺伝子を同定する。

Outline of Final Research Achievements

To elucidate genes and pathways involved in inflammation-associated colorectal cancer development, we performed a transposon-based in vivo screening of cancer-related genes in a DSS-induced colitis mouse model. We could identify genes that were more frequently mutated in inflammation-associated colon tumors.
The tumor suppressive potential of the candidate colorectal cancer genes was validated in the experimental system using mouse tumor organoids, and two genes were shown to be tumor suppressors.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究成果により、炎症関連腫瘍形成に関与する遺伝子を網羅的に同定した。同定した遺伝子のCdkn2aは、炎症刺激によりDNAメチル化を介して不活性化されることをin vitroの実験により示した。慢性炎症はエピゲノム異常を引き起こしてがん促進的に機能することが知られるが、本研究で同定した遺伝子群を詳細に調べることにより、炎症関連腫瘍で機能する遺伝子の特定につながると考えられる。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Sleeping Beauty transposon mutagenesis in mouse intestinal organoids identifies genes involved in tumor progression and metastasis2024

    • Author(s)
      Naoko Iida, Yukari Muranaka, Jun Won Park, Shigeki Sekine, Neal G. Copeland, Nancy A. Jenkins, Yuichi Shiraishi, Masanobu Oshima, Haruna Takeda
    • Journal Title

      Cancer Gene Therapy

      Volume: 31 Pages: 527-536

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Sleeping Beauty transposon mutagenesis identified genes and pathways involved in inflammation-associated colon tumor development2023

    • Author(s)
      Shimomura Kana、Hattori Naoko、Iida Naoko、Muranaka Yukari、Sato Kotomi、Shiraishi Yuichi、Arai Yasuhito、Hama Natsuko、Shibata Tatsuhiro、Narushima Daichi、Kato Mamoru、Takamaru Hiroyuki、Okamoto Koji、Takeda Haruna
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 14 Issue: 1

    • DOI

      10.1038/s41467-023-42228-z

    • URL

      https://pure.teikyo.jp/en/publications/f9dc5b3e-a574-4630-927d-39a56a065555

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Characterization of RNF43 frameshift mutations that drive Wnt ligand‐ and R‐spondin‐dependent colon cancer2022

    • Author(s)
      Yamamoto Daisuke、Oshima Hiroko、Wang Dong、Takeda Haruna、Kita Kenji、Lei Xuelian、Nakayama Mizuho、Murakami Kazuhiro、Ohama Takashi、Takemura Hirofumi、Toyota Mutsumi、Suzuki Hiromu、Inaki Noriyuki、Oshima Masanobu
    • Journal Title

      The Journal of Pathology

      Volume: 257 Issue: 1 Pages: 39-52

    • DOI

      10.1002/path.5868

    • Related Report
      2022 Research-status Report 2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A Platform for Validating Colorectal Cancer Driver Genes Using Mouse Organoids.2021

    • Author(s)
      Haruna Takeda
    • Journal Title

      Frontiers in genetics

      Volume: 12 Pages: 698771-69877

    • DOI

      10.3389/fgene.2021.698771

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 大腸炎症関連がんにおける細胞老化経路の関与2022

    • Author(s)
      下村 奏、服部 奈緒子、飯田 直子、加藤 護、白石 友一、武田はるな
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] SB トランスポゾンスクリーニングを用いた炎症関連がん形成に関与する遺伝子の網羅的同定2022

    • Author(s)
      武田はるな、下村 奏、飯田 直子、服部 奈緒子、加藤 護、白石 友一
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] SB トランスポゾンを用いた生体内スクリーニング2022

    • Author(s)
      武田はるな
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] SB トランスポゾンスクリーニングを用いた大腸がん転移に関わる遺伝子の同定2022

    • Author(s)
      村中 柚花理、飯田 直子、服部 奈緒子、加藤 護、白石 友一、武田はるな
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Sleeping Beautyを用いた炎症関連がん遺伝子の網羅的同定2022

    • Author(s)
      下村 奏、服部 奈緒子、飯田 直子、加藤 護、白石 友一、武田はるな
    • Organizer
      第35回発癌病理研究会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Sleeping Beauty トランスポゾンを用いた大腸がん転移モデルの樹立2021

    • Author(s)
      武田はるな
    • Organizer
      第80回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Sleeping Beauty トランスポゾンを用いた大腸炎関連がん遺伝子の同定2021

    • Author(s)
      下村 奏、武田 はるな
    • Organizer
      第80回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of colorectal cancer driver genes by Sleeping Beauty mutagenesis2021

    • Author(s)
      Haruna Takeda
    • Organizer
      The 39th Sapporo International Cancer Symposium
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2021-07-13   Modified: 2025-01-30  

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