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The significance of non-self-variant pregnancy outcomes based on mother-child pair genome sequence information

Research Project

Project/Area Number 21K19551
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 56:Surgery related to the biological and sensory functions and related fields
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

Usui Hirokazu  千葉大学, 大学院医学研究院, 准教授 (90375634)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中田 恵美里  千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (30447289)
羽生 裕二  千葉大学, 医学部附属病院, 助教 (40816162)
佐藤 明日香  千葉大学, 医学部附属病院, 助教 (60779859)
Project Period (FY) 2021-07-09 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Keywords妊娠 / 胎盤 / 非自己バリアント / 三世代コホート / 東北メディカル・メガバンク / 妊娠高血圧 / バイオインフォマティクス / 次世代シークエンサー / 次世代シークエンス / 全エクソームシークエンス
Outline of Research at the Start

胎盤は妊娠中に胎児の成長サポートに必須の期間限定器官である。胎盤は胎児と遺伝学的に同じであり、胎盤は免疫学的には、「他人」であるが、拒絶を受けない。最近の次世代シークエンサーによる解析の結果から、ヒトゲノムには多数のバリアントが存在していることが明らかにされてきた。アミノ酸配列置換が起こる変化に限っても、個体平均で10,000カ所存在するとされる。母と胎盤でアミノ酸配列が異なるバリアント(本研究では非自己バリアントと呼ぶ)は、免疫学的に非自己と認識され得る。非自己バリアントパラメーターは、胎盤における免疫反応に関係し、産科的アウトカム(妊娠高血圧症候群など)に寄与する可能性があるか検証する。

Outline of Final Research Achievements

From the comprehensive genomic sequence data of Tohoku Medical Megabank Project Birth and Three-Generation Cohort Study (TMM BirThree Cohort Study), we conducted a screening for placental non-self-variants, which the mother could potentially recognize as non-self. A significant number of genes, which are highly expressed in the placenta, contained these non-self-variants. However, there was no apparent difference in the incidence of these placental non-self-variants between the group that developed pregnancy-induced hypertension and the group that did not. To ascertain the significance of placental non-self-variants, it is necessary to investigate their expression in the placenta and whether the placental non-self-variant proteins are recognized as non-self by the mother.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

母とは異なる配列を有する非自己バリアント蛋白をコードする遺伝子が存在する可能性がゲノム塩基配列レベルで確認された。妊娠アウトカムに対する非自己バリアント評価を行うには、非自己バリアント蛋白の胎盤での発現、母体が非自己バリアント蛋白を実際に非自己と認識しているかなどを実験的に評価する必要がある。また、本研究では、妊娠高血圧罹患例の数が少なく、妊娠アウトカムと非自己バリアントの関係を十分に明らかにすることはできなかった。妊娠アウトカムと関連を評価するには、妊娠高血圧罹患例を増やして非自己バリアントの評価が必要と考えられる。

Report

(3 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2023 2022

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Developmental mechanism of hydatidiform moles based on DNA polymorphism analysis2023

    • Author(s)
      Usui Hirokazu
    • Journal Title

      Chiba Medical J

      Volume: 99E Pages: 1-7

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 絨毛癌/high risk GTNの診断と治療2023

    • Author(s)
      碓井宏和 中村名律子 片山恵里 佐藤明日香
    • Journal Title

      産婦人科の実際

      Volume: 72 Pages: 145-151

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Journal Article] 胞状奇胎発症機序についての最新知見~遺伝子変異と生殖補助医療の観点より2023

    • Author(s)
      佐藤明日香 碓井宏和
    • Journal Title

      産婦人科の実際

      Volume: 72 Pages: 165-170

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Journal Article] Auxiliary and experimental diagnostic techniques for hydatidiform moles2022

    • Author(s)
      Usui Hirokazu
    • Journal Title

      Journal of Obstetrics and Gynaecology Research

      Volume: 48 Issue: 12 Pages: 3077-3086

    • DOI

      10.1111/jog.15422

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Short tandem repeat polymorphism analysis for primary peritoneal choriocarcinoma: A case report and literature review2022

    • Author(s)
      Yamauchi Kota、Sato Yukiyasu、Usui Hirokazu、Sakurai Azusa、Harada Ryusuke、Goto Masaki
    • Journal Title

      Journal of Obstetrics and Gynaecology Research

      Volume: 48 Issue: 10 Pages: 2640-2646

    • DOI

      10.1111/jog.15347

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 胞状奇胎の補助的診断法2022

    • Author(s)
      碓井宏和
    • Organizer
      第55回日本婦人科病理学会学術集会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 多型解析に基づく胞状奇胎の発生機序・病態の解明2022

    • Author(s)
      碓井宏和
    • Organizer
      第14回千葉医学会賞 受賞記念講演
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] エトポシド脱感作プロトコールで治療した絨毛癌の2例2022

    • Author(s)
      碓井宏和, 中村名律子, 羽生裕二, 佐藤明日香, 大塚聡代, 松岡歩, 錦見恭子, 楯真一, 生水真紀夫
    • Organizer
      第74回日本産科婦人科学会学術集会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 胞状奇胎後の持続する低単位hCGがphantom hCGであったと考えられた1例2022

    • Author(s)
      碓井宏和, 中村名律子, 佐藤明日香, 大塚聡代, 羽生裕二, 松岡歩, 錦見恭子, 楯真一, 生水真紀夫
    • Organizer
      第64回日本婦人科腫瘍学会学術講演会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

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Published: 2021-07-13   Modified: 2025-03-27  

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