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Development of AI for the Detection of Synchronous Burst Firing in Neural Circuit Activity

Research Project

Project/Area Number 21K20519
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0403:Biomedical engineering and related fields
Research InstitutionTohoku Institute of Technology

Principal Investigator

Matsuda Naoki  東北工業大学, 工学部, 助教 (80909490)

Project Period (FY) 2021-08-30 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords機械学習 / 脳・神経 / in vitro / 微小電極アレイ / 神経毒性 / 同期バースト発火 / 同期バースト
Outline of Research at the Start

神経回路が同期的に活動する「同期バースト発火」は医薬品の毒性および薬効評価の重要な解析パラメータとなっているが、同期バースト発火の個数や長さを正確、かつ施設間で統一して検出する方法は未確立である。本研究では、機械学習を用いて間差に依存せず統一して使用できる「同期バースト発火検出AI」の開発を行う。また、AIが同期バースト発火の検出に使用した特徴量を同定し、特徴量を復元することで、新しい同期バースト発火の定義付けを行う。

Outline of Final Research Achievements

This study aimed to develop a synchronization burst detection AI that can be used consistently across different experiments. Spontaneous activity of human induced pluripotent stem cell-derived neurons cultured on a microelectrode array (MEA) and responses to epileptogenic compounds were acquired. Using the obtained data, five synchronization burst detection AIs were developed, and models capable of handling inter-data variations were identified. The identified raster plot image-based learning model demonstrated the ability to detect the number of synchronization bursts with an accuracy of 99.8% and the length of synchronization bursts with an accuracy of 91.9% even with different experimental data. The synchronization burst detection method using machine learning developed in this study showed the capability to evaluate neural activity obtained from MEA consistently across different experiments.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究で開発した機械学習を用いた同期バースト検出法は、MEAで取得した神経活動を実験間差なく評価できることが示された。国内外でMEA神経活動計測法を用いた神経毒性評価の取り組みが行われており、本研究は、当該分野の基盤かつ統一的な解析法になる位置づけである。また、本研究で行う同期バースト発火検出AIは、上述のin vitro試験のみならず、in vivoの電気活動データにも適用可能であることから、電気活動を指標とした神経科学研究全般に拡張することができ、汎用性が高い研究開発である。

Report

(3 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2022

All Presentation (4 results)

  • [Presentation] MEA計測による脳オルガノイドの電気活動評価2022

    • Author(s)
      永福菜美, 柴田実可子, 松田直毅, 鈴木郁郎
    • Organizer
      第49回日本毒性学会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 高時間分解能を有する電気イメージングによる化合物の神経応答2022

    • Author(s)
      松田直毅, 韓笑波, 柴田実可子, 永福菜美, 石橋勇人, 鈴木郁郎
    • Organizer
      第13回スクリーニング学研究会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 236,880電極CMOS-MEAを用いたヒトiPS細胞由来ニューラルネットワークの電気活動のシングル細胞解析2022

    • Author(s)
      松田直毅, 韓笑波, 鈴木郁郎
    • Organizer
      第96回日本薬理学会学術年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 機械学習を用いたMEAにおけるバースト検出法の開発2022

    • Author(s)
      松田 直毅
    • Organizer
      第13回日本安全性薬理研究会学術年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-10-22   Modified: 2024-01-30  

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