| Project/Area Number |
21K20580
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
0602:Agricultural and environmental biology and related fields
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| Research Institution | Tokyo Institute of Technology |
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Principal Investigator |
Tanaka Hiroyuki 東京工業大学, 生命理工学院, 研究員 (60782042)
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| Project Period (FY) |
2021-08-30 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | 異質倍数体 / 種分化 / 比較ゲノム解析 / スミレ属 |
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| Outline of Research at the Start |
ゲノムの倍数化は植物一般にみられる現象であり、植物の進化・種分化において重要な役割をもつと古くから考えられてきたが、倍数体形成による 遺伝子レベルの進化については未だに解明されていない点が多い。
そこで本申請課題では、“ゲノム倍数化がもたらす生物多様化のメカニズム”を研究するための新たな実験材料として、スミレ属植物に注目し、異質倍数体スミレのゲノム解読と比較ゲノム解析によって、スミレ属植物における研究基盤を構築する。
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| Outline of Final Research Achievements |
In order to building a foundation for genomic analysis of Viola spicese, I perfoermed genome sequencing project of allotetraploid viola (Viola odorata). I generated a chromosome-level reference genome and high-quality predicted gene annotation dataset for V. odorata.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
ゲノム重複による高次倍数体の形成は植物一般にみられる現象であり、染色体倍化が植物の進化・種分化において重要な役割をもつと古くから考えられてきたが、倍数体形成による遺伝子レベルの進化については未だに解明されていない点が多い。
スミレ属は日本という狭い範囲内で環境適正や形態などが多様化した数十種類の異質多倍体スミレが自生しており、ゲノム倍数化と種分化の研究において適した研究材料である。スミレ属でゲノム研究を展開するための基盤構築が実現すれば、染色体倍化がもたらす植物の進化・種分化機構の役割の解明に貢献すると考えられる。
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