| Project/Area Number |
21K20638
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
0701:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
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| Research Institution | Ehime University |
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Principal Investigator |
Yamagami Ryota 愛媛大学, 理工学研究科(工学系), 助教 (70767227)
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| Project Period (FY) |
2021-08-30 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | RNA / tRNA / tRNA修飾 / tRNA修飾酵素 / 網羅解析 / 変異プロファイリング法 / RNAメチル化酵素 / 次世代シーケンス / 変異プロファイリング / RNAシーケンス / 核酸関連タンパク質 |
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| Outline of Research at the Start |
近年の研究より、RNAの配列や構造因子は、多くの遺伝子の発現を調節することが明らかになっています。RNAは、転写後にプロセシングやRNA修飾などの様々な成熟過程を経て、その機能性を獲得します。その一方で、「RNAの配列と構造がどのようにしてRNA成熟化酵素と相互作用し、どのようにRNA成熟化機構の制御に関わるのか」に関するメカニズムの全貌は、未解明です。本研究では、RNA修飾酵素やプロセシング酵素と基質RNAとの相互作用をハイスループットに解析する技術を開発します。本技術を用いて、RNAの配列や構造を介したRNA成熟化反応の制御機構とそれによる遺伝子発現調節機構を探ります。
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| Outline of Final Research Achievements |
The objective of this project is to develop a new high-throughput technique for conducting functional analyses of RNA modification enzymes. The findings have been reported as follows: (1) We have developed tRNA-MaP, a technique that selectively detects substrate tRNAs from a mixture of substrate and non-substrate tRNAs. (2) By using tRNA-MaP, we were able to reveal the substrate tRNA recognition mechanism of tRNA m1A22 methyltransferase (TrmK) from Geobacillus stearothermophilus, a thermophilic bacteria. (3) In combination with protein orthology analysis, tRNA-MaP was used to predict the tRNA modification enzyme genes encoded in the G. stearothermophilus genome.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究は、RNAとRNA修飾酵素の相互作用機構とその機能の理解を深めることを目的としています。本研究によって開発されたtRNA-MaP法は、本目的の達成を加速させるものであり、幅広い分野での応用が期待できます。
This project aims to enhance our understanding of RNA modification enzymes and their functions, and the developed tRNA-MaP technique has potential implications for further studies in this field.
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