International joint research to elucidate the propagation of domestic animals across the Indian Ocean
| Project/Area Number |
21KK0122
|
|---|
| Research Category |
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
|
| Allocation Type | Multi-year Fund |
|---|
| Review Section |
Medium-sized Section 42:Veterinary medical science, animal science, and related fields
|
|---|
| Research Institution | Kobe University |
|---|
Principal Investigator |
万年 英之 神戸大学, 農学研究科, 教授 (20263395)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
米澤 隆弘 東京農業大学, 農学部, 准教授 (90508566)
下桐 猛 鹿児島大学, 農水産獣医学域農学系, 教授 (40315403)
笹崎 晋史 神戸大学, 農学研究科, 准教授 (50457115)
川口 芙岐 神戸大学, 農学研究科, 助教 (00879968)
西堀 正英 広島大学, 統合生命科学研究科(生), 教授 (80237718)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2021-10-07 – 2026-03-31
|
| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
|
| Budget Amount *help |
¥18,980,000 (Direct Cost: ¥14,600,000、Indirect Cost: ¥4,380,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2024: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
|
|---|
| Keywords | インド洋 / 家畜 / ヤギ / ニワトリ / ブタ / 伝播 / ゲノム解析 / 海洋経路 / 中小家畜 / 海上ルート / DNA |
|---|
| Outline of Research at the Start |
本国際共同研究は、インド洋海上経路が中小家畜の伝播経路という新仮説の検証を目的とする。インド洋海上経路国（インドネシア、モーリシャス、マダガスカルなど）と国際共同研究を構築し、収集する中小家畜の全ゲノムリシーケンスを含むゲノムワイドな遺伝学的解析を実施する。解析情報からインド洋海路が家畜伝播や遺伝子流入に与えた影響を評価する。本研究を基礎に国際共同研究コンソーシアム構築や若手研究者の国際共同研究のリーダー育成にも貢献する。
|
| Outline of Annual Research Achievements |
2022年度は世界的なコロナ禍が継続中であったが、世界的にもその規制等が緩和され、予定していた調査計画が進捗できた。調査対象国は当初予定通りのインドネシアとモーリシャスである。モーリシャスはFAREIのGobindram博士との共同研究のもと、2022年9月3日から9月18日の日程で調査が実行された。対象動物はヤギとニワトリであった。モーリシャス本島とロドリゲス島の2島を訪問・調査し、合計でヤギ74頭、ニワトリ45羽の生態試料（血液、毛、羽）を得た。同国の研究所でDNA抽出・精製を行い、神戸大学と鹿児島大学に持ち帰り、DNA試料を保存した。
インドネシアはHasanuddin大学のBugiwati 教授と連絡を取り、2022年度の調査を計画した。2022年度前半では、日本人研究者のインドネシアの調査はコロナ禍の状況を鑑み、困難であると判断した。相談の結果、Bugiwati 教授を始めとするHasanuddin大学の共同研究者4名による、現地調査を実施した。調査期間は2022年6月27日から7月4日である。Moa島とLakor島において合計46頭の在来ヤギの血液試料を採取し、Hasanuddin大学に持ち帰り、血液試料を冷凍保存した。インドネシア在来ヤギの一部のDNA試料に対して、本共同研究によるミトゲノム解析を進めており、Lakor島における在来ヤギがmtDNAハプログループBを示し、また特徴的な配列構造を有していることが明らかになりつつある。この特徴的な配列を示した個体は1個体のみであったので、今後、頭数を増やして解析を実施する予定である。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
2022年度は世界的なコロナ禍が継続中であったが、世界的にもその規制等が緩和され、予定していた調査計画が進捗できた。調査対象国は当初予定通りのインドネシアとモーリシャスである。モーリシャスはFAREIのGobindram博士との共同研究のもと、2022.9.3-18の日程で調査が実行された。対象動物はヤギとニワトリである。モーリシャス本島とロドリゲス島の2島を訪問し、合計でヤギ74頭、ニワトリ45羽の生態試料（血液、毛、羽）を得た。同国の研究所でDNA抽出・精製を行い、神戸大学と鹿児島大学に持ち帰り、DNA試料を保存した。
インドネシアはHasanuddin大学のBugiwati 教授と連絡を取り、2022年度の調査を計画した。2022年度前半では、日本人研究者のインドネシアの調査はコロナ禍の状況を鑑み、困難であると判断した。相談の結果、Bugiwati 教授を始めとするHasanuddin大学の共同研究者4名による、現地調査を実施した。調査期間は2022.6.27-7.4である。Moa島とLakor島において合計46頭の在来ヤギの血液試料を採取し、Hasanuddin大学に持ち帰り、血液試料を冷凍保存した。これら試料は2023年度に代表者等が現地へ赴き、共同研究との協議やDNA精製等を行う予定としている。
|
| Strategy for Future Research Activity |
2023年度は世界的なコロナ禍が概ね終息をむかえたと考え、計画に沿った共同研究調査、および収集したDNAサンプルに対する解析を実施する予定である。
1) 国際共同研究による海外調査：2022年度と同様にインドネシア共同研究者による在来ヤギの調査・試料収集を「香辛料諸島」の数島に対して実施する予定である。時期としては～8月を予定している。また9月以降に神戸大学研究者を中心に、共同研究者先であるHasanuddin大学に赴き、「香辛料諸島」の1島の調査、およびこれまで収集した血液試料の抽出・精製を行い、神戸大学に輸送・保存する予定である。また、広島大学研究者を中心にカリマンタン島のブタ・イノシシの調査を情報収集から始め、可能であれば現地調査を実施する予定である。
2)収集DNA試料を用いた遺伝学的解析：2022年9月に得たモーリシャスのDNA試料に対して母系mtDNA解析と父系SRY遺伝子の塩基配列解析を行う予定である。得た塩基配列情報に基づいて、系統解析、遺伝構造解析、頻度分布調査などを実施する予定である。
|
Report
(2 results)
Research Products
(8 results)
