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統合的構造解析法による繊毛中心対複合体の構造解明

Research Project

Project/Area Number 21KK0125
Research Category

Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 43:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

塚崎 智也  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (80436716)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 八木 俊樹  県立広島大学, 生命環境学部, 教授 (40292833)
市川 宗厳  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 博士研究員 (80844662)
甲賀 栄貴  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 助教 (90909376)
Project Period (FY) 2021-10-07 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥19,110,000 (Direct Cost: ¥14,700,000、Indirect Cost: ¥4,410,000)
Fiscal Year 2023: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2022: ¥9,490,000 (Direct Cost: ¥7,300,000、Indirect Cost: ¥2,190,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Keywords繊毛 / 鞭毛 / 中心対複合体 / クライオ電子顕微鏡法
Outline of Research at the Start

繊毛は下等真核生物の運動を駆動するだけでなく、ヒトにおいても気管内からウイルスなどの異物を除去するなど極めて重要な機能を担っている細胞小器官である。その中心部を構成する中心対複合体は多くのタンパク質から構成されているが、未だその構成タンパク質の同定は不十分で、かつ、中心対複合体の立体構造も高分解能では得られていない。そこで、国際共同研究として、クライオ電子顕微鏡法及びX線結晶構造解析を用いて中心対複合体の構造を高分解能で明らかにし、その繊毛の運動制御機構についても理解することを目指す。

Outline of Annual Research Achievements

真核生物の運動駆動装置である繊毛・鞭毛の中心には、屈曲運動を制御する中心対複合体が存在している。中心対複合体は、2本の微小管を軸としてその周囲に多数のタンパク質が結合することで構成される。中心対複合体は繊毛の運動制御に重要な役割を担っているが、構成タンパク質の同定が未だ不十分であるとともに、その高分解能の構造は得られていない。そこで、本研究では中心対複合体の構築や、その機能の詳細について明らかにすることを目指した。中国復旦大学との国際共同研究として、クライオ電子顕微鏡での生体分子の構造解析にむけたサンプル調製、測定、ならびに画像解析を進めた。クライオ電子顕微鏡にてさらに良質な画像を得るためには、サンプルの濃度やバッファー条件などを調製する必要があったため、様々な条件にてサンプル調製を行った。また、中心対複合体を構成する因子のうち、いくつかのタンパク質は結晶構造解析により、より高分解能の構造を得ることで、機能の詳細に迫ろうとした。機能解析では、主に研究分担者の八木教授を中心に、緑藻クラミドモナスの変異株を用いて、中心対複合体に存在する2種類のキネシン様タンパク質(KLP1, FAP125)について調べた。変異体を用いた機能相補実験などから、どちらのタンパク質もモーターの活性を失活させても中心対複合体の最低限の機能は維持されていることが判明した。この2つのタンパク質については、モーターの機能の有無ではなく、タンパク質の存在そのものが中心対複合体の機能に重要であることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

実験の進行状況から、渡航を24年度に行うこととし、研究期間の延長を行なったため。

Strategy for Future Research Activity

サンプルの準備し、国際的な状況を判断し、国際共同研究先へ渡航する。共同研究先では、最新のクライオ電子顕微鏡のサンプル調製技術を学び、クライオ電子顕微鏡によるデータ収集を行う予定である。エックス線結晶構造解析、機能解析は、前年度から引き続き研究を進める。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2024 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 8 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results) Book (1 results) Remarks (3 results)

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      Ikei Mai、Miyazaki Ryoji、Monden Keigo、Naito Yusuke、Takeuchi Azusa、Takahashi Yutaro S.、Tanaka Yoshiki、Murata Keina、Mori Takaharu、Ichikawa Muneyoshi、Tsukazaki Tomoya
    • Journal Title

      PLOS Biology

      Volume: 22 Issue: 4 Pages: e3002601-e3002601

    • DOI

      10.1371/journal.pbio.3002601

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    • Author(s)
      Kondo Yusuke、Ogawa Tomoka、Kanno Emiri、Hirono Masafumi、Kato-Minoura Takako、Kamiya Ritsu、Yagi Toshiki
    • Journal Title

      Cell Structure and Function

      Volume: 48 Issue: 2 Pages: 175-185

    • DOI

      10.1247/csf.23044

    • ISSN
      0386-7196, 1347-3700
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      Yagi Toshiki、Toda Akiyuki、Ichikawa Muneyoshi、Kurisu Genji
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 20 Issue: 1 Pages: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v20.0008

    • ISSN
      2189-4779
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      Kohga Hidetaka、Mori Takaharu、Tanaka Yoshiki、Yoshikaie Kunihito、Taniguchi Katsuhide、Fujimoto Kei、Fritz Lisa、Schneider Tanja、Tsukazaki Tomoya
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 30 Issue: 8 Pages: 1088-1097

    • DOI

      10.1016/j.str.2022.05.008

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    • Author(s)
      Inaba Hiroshi、Sueki Yurina、Ichikawa Muneyoshi、Kabir Arif Md. Rashedul、Iwasaki Takashi、Shigematsu Hideki、Kakugo Akira、Sada Kazuki、Tsukazaki Tomoya、Matsuura Kazunori
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 8 Issue: 36

    • DOI

      10.1126/sciadv.abq3817

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      Miyazaki Ryoji、Ai Mengting、Tanaka Natsuko、Suzuki Takehiro、Dhomae Naoshi、Tsukazaki Tomoya、Akiyama Yoshinori、Mori Hiroyuki
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 298 Issue: 11 Pages: 102572-102572

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102572

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    • Author(s)
      Inaba Hiroshi、Sueki Yurina、Ichikawa Muneyoshi、Kabir Arif Md. Rashedul、Iwasaki Takashi、Shigematsu Hideki、Kakugo Akira、Sada Kazuki、Matsuura Kazunori
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2022.01.27.476107

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    • Author(s)
      八木俊樹, 藤田洋介, 上村慎治, 岩本裕之
    • Journal Title

      SPring-8/SACLA Research Report

      Volume: 9 Issue: 6 Pages: 375-379

    • DOI

      10.18957/rr.9.6.375

    • NAID

      130008112298

    • ISSN
      2187-6886
    • Year and Date
      2021-10-29
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  • [Presentation] 大腸菌の細胞壁合成に必須な脂質フリッパーゼ MurJ を阻害する抗菌ペプチド LysM の生化学的解析2024

    • Author(s)
      甲賀栄貴、Napathip LERTPREEDAKORN、田中宏幸、宮﨑亮次、塚﨑智也
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      日本農芸化学会2024年度大会
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      Yusuke Kondo, Tomoka Ogawa, Emiri Kanno, Masafumi Hirono, Takako Kato-Minoura, Ritsu Kamiya, Toshiki Yagi
    • Organizer
      Chlamy 2023 international meeting
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    • Author(s)
      Napathip Lertpreedakorn, Hidetaka Kohga Hidetaka, Ryoji Miyazaki, Tomoya Tsukazaki
    • Organizer
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    • Author(s)
      Muneyoshi Ichikawa, Hiroshi Inaba, Yurina Sueki, Arif Md. Rashedul Kabir, Takashi Iwasaki, Hideki Shigematsu, Akira Kakugo, Kazuki Sada, Tomoya Tsukazaki, Kazunori Matsuura
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      Yusuke Kondo, Tomoka Ogawa, Emiri Kanno, Masafumi Hirono, Takako Minoura, Ritsu Kamiya, Toshiki Yagi
    • Organizer
      第60回日本生物物理学会年会
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    • Author(s)
      近藤裕祐, 八木俊樹
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    • Author(s)
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    • Organizer
      日本生物物理学会第59回年会
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    • Author(s)
      Susan Dutcher (編集)
    • Total Pages
      346
    • Publisher
      Academic Press
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      https://www.naist.jp/pressrelease/2022/09/009218.html

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    • URL

      https://bsw3.naist.jp/tsukazaki/

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Published: 2021-10-22   Modified: 2024-12-25  

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