Analysis of molecular characteristics and metastatic mechanism of Pancreatic neuroendocrine neoplasm.
Project/Area Number |
21KK0146
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Research Category |
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Medium-sized Section 53:Organ-based internal medicine and related fields
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Research Institution | Tokyo Medical and Dental University |
Principal Investigator |
伊藤 剛 東京医科歯科大学, 高等研究院, 特任助教 (20733900)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
小林 正典 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 助教 (10825459)
工藤 篤 東京医科歯科大学, 医学部附属病院, 准教授 (20376734)
田邉 稔 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 教授 (50197513)
岡本 隆一 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 教授 (50451935)
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Project Period (FY) |
2021-10-07 – 2024-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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Budget Amount *help |
¥19,110,000 (Direct Cost: ¥14,700,000、Indirect Cost: ¥4,410,000)
Fiscal Year 2023: ¥7,150,000 (Direct Cost: ¥5,500,000、Indirect Cost: ¥1,650,000)
Fiscal Year 2022: ¥7,150,000 (Direct Cost: ¥5,500,000、Indirect Cost: ¥1,650,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
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Keywords | 膵神経内分泌腫瘍 / pan-NEN / 膵オルガノイド / RNA-seq / RNA -seq / NET / NEC / RNAーseq |
Outline of Research at the Start |
膵神経内分泌腫瘍(pan-NEN)は切除不能例には有効な治療が存在せず極めて予後不良である。従来pan-NENは稀な疾患とされていたが、技術の向上に伴い診断例は急増しており、新規治療の開発は急務である。NENは増殖能が低いが、一方で腫瘍径非依存的に他臓器へ転移することが重要な予後規定因子となっている。本国際共同研究では海外協力施設が有する独自のハイスループット解析技術と、本学が有する国内随一のpan-NEN患者コホート、患者由来オルガノイドの作成技術を統合することにより、「pan-NENの成立・進展を規定する細胞・分子機構」や「pan-NENの転移を規定する因子」を明らかとすることを目的とする
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Outline of Annual Research Achievements |
2023年度は当初の研究計画にのっとりpan-NEN手術検体、EUS-FNA検体、同一症例の膵非腫瘍組織や肝転移巣等からも患者由来オルガノイドを樹立し100例を超える手術検体とオルガノイドのバイオバンクの樹立を行った。同バイオバンクよりNET症例の手術検体、原発巣25例、正常部24例、肝転移15例とオルガノイド検体、腫瘍部10例、肝転移4例、正常部10例をそれぞれRNA-seqに提出しIKMB国際共同研究先IKMBの専任Bioinformaticianとzoom会議を通して密に連携を行い、解析を行なった。正常部と比較した原発巣の遺伝学的特徴、原発巣と比較し肝転移で変動が大きい遺伝子群の解析を行い、GO解析では肝転移巣でより免疫細胞賦活に関連する経路の賦活を認めている。またG1,2,3の遺伝学的特徴についてはG1とG3でPCAプロットにおいて分別が可能であった。またNETG2手術検体のシングルセルシークエンスも行い、腫瘍を構成する細胞の不均一性も明らかとしている。腫瘍細胞だけでなく、間質や免疫細胞も多数認め新たな知見と考えている。 本年度も本グループから国際共同研究先のキールへは研究代表者と指導大学院生1名が赴き、共同研究先研究所で口演し、成果の発表を行った。また候補遺伝子の抽出や今後の方針について現地で意見交換を行うだけでなく、国際学会にも出席し発表を行なっている。今後の国際交流発展のため研究代表者所属大学とキール大学は医学部間協定を締結し、今後ますますの国際交流の発展を視野に入れている。
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Report
(3 results)
Research Products
(16 results)
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[Journal Article] Single cell analysis revealed that two distinct, unique CD4+ T cell subsets were increased in the small intestinal intraepithelial lymphocytes of aged mice.2024
Author(s)
Yuki Yonemoto, Yasuhiro Nemoto, Ryo Morikawa, Nana Shibayama, Shigeru Oshima, Takashi Nagaishi, Tomohiro Mizutani, Go Ito, Satoru Fujii, Ryuichi Okamoto.
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Journal Title
Frontiers in Immunology.
Volume: 15
Pages: 1340048-1340048
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Serine metabolism is crucial for cGAS-STING signaling and viral defense control in the gut2024
Author(s)
Becker B, Wottawa F, Bakr M, Koncina E, Mayr L, Kugler J, Yang G, Windross SJ, Neises L, Mishra N, Welz L, Stengel ST, Ito G, Coleman OI, Jaeger C, Haller D, Paludan SR, Blumberg R, Kaser A, Cicin-Sain L, Schreiber S, Adolph TE, Letellier E, Rosenstiel P, Meiser J, Aden K
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Journal Title
iScience
Volume: 27
Issue: 3
Pages: 109173-109173
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Discovery of non-genomic drivers of YAP signaling modulating the cell plasticity in CRC tumor lines2024
Author(s)
Ogasawara N, Kano Y, Yoneyama Y, Kobayashi S, Watanabe S, Kirino S, Velez-Bravo FD, Hong Y, Ostapiuk A, Lutsik P, Onishi I, Yamauchi S, Hiraguri Y, Ito G, Kinugasa Y, Ohashi K, Watanabe M, Okamoto R, Tejpar S, Yui S.
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Journal Title
iScience
Volume: 27
Issue: 3
Pages: 109247-109247
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Collagen type I-mediated mechanotransduction controls epithelial cell fate conversion during intestinal inflammation2022
Author(s)
Kobayashi S, Ogasawara N, Watanabe S, Yoneyama Y, Kirino S, Hiraguri Y, Inoue M, Nagata S, Okamoto-Uchida Y, Kofuji S, Shimizu H, Ito G, Mizutani T, Yamauchi S, Kinugasa Y, Kano Y, Nemoto Y, Watanabe M, Tsuchiya K, Nishina H, Okamoto R, Yui S.
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Journal Title
Inflammation and Regeneration
Volume: 42
Issue: 1
Pages: 49-49
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Zranb1-mutant mice display abnormal colonic mucus production and exacerbation of DSS-induced colitis.2022
Author(s)
Tamura A, Ito G, Matsuda H, Nibe-Shirakihara Y, Hiraoka Y, Kitagawa S, Hiraguri Y, Nagata S, Aonuma E, Otsubo K, Nemoto Y, Nagaishi T, Watanabe M, Okamoto R, Oshima S.
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Journal Title
Biochem Biophys Res Commun.
Volume: 628
Pages: 147-154
DOI
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Epithelial X-Box Binding Protein 1 Coordinates Tumor Protein p53-Driven DNA Damage Responses and Suppression of Intestinal Carcinogenesis2022
Author(s)
Welz L, Kakavand N, Hang X, Laue G, Ito G, Silva MG, Plattner C, Mishra N, Tengen F, Ogris C, Jesinghaus M, Wottawa F, Arnold P, Kaikkonen L, Stengel S, Tran F, Das S, Kaser A, Trajanoski Z, Blumberg R, Roecken C, Saur D, Tschurtschenthaler M, Schreiber S, Rosenstiel P, Aden K.
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Journal Title
Gastroenterology
Volume: 162(1)
Issue: 1
Pages: 223-237
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Presentation] Analysis of gene expression to elucidate the pathogenesis of pancreatic solid pseudopapillary neoplasm.2023
Author(s)
Katsuda H, Ito G, Hiraguri Y, Muto T, Ishido S, Kobayashi M, Yamashita H, Ito A, Ono H, Kudo A, Watanabe M, Tanabe M, Okamoto R
Organizer
UEGW2023
Related Report
Int'l Joint Research
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[Presentation] Analysis of molecular characteristics and metastatic mechanism of pancreatic neuroendocrine neoplasms.2022
Author(s)
Ryota Kuribayashi, Go Ito, Neha Mishra, Yui Hiraguri, Hiromune Katsuda, Masanori Kobayashi, Tomohiro Muto, Hironari Yamashita, Atsushi Kudo,Minoru Tanabe, Konrad Aden, Philip Rosenstiel,Mamoru Watanabe, Ryuichi Okamoto
Organizer
International Syscid Symposium, 2022.Kiel, Germany
Related Report
Int'l Joint Research
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