Biogeography and conservation of freshwater fishes in the Japanese Archipelago: phylogeography and ecological niche modeling approaches

• Project/Area Number: 22570082
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Biodiversity/Systematics
• Research Institution: Fisheries Research Agency (2011-2012); Hokkaido University (2010)
• Principal Investigator: YOKOYAMA Ryota 独立行政法人水産総合研究センター, 増養殖研究所・内水面研究部, 研究等支援職員 (40532403)
• Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha): GOTO Akira 北海道大学, 北方生物圏フィールド科学センター, 教授 (30111165)
• Project Period (FY): 2010 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000); Fiscal Year 2012: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000); Fiscal Year 2011: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2010: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
• Keywords: 系統地理 / 生息地予測 / 保全生物学 / 分布域形成

Research Abstract

We generated ecological niche models (ENM) for several species of coldwater-adapted fishes in Japan. In the stone loach, habitat connectivity estimated from ENM was correlated with gene flow, suggesting that the ENM would have potential for representing gene flow regime (genetic population structure). Effects of climate change on population structure and genetic diversity of coldwater-adapted fishes were evaluated by using molecular genetic, phylogeographic and ENM approaches.

Research Products

• [Journal Article] Population structure and gene flow among anadromous Arctic lamprey (Lethenteron camtschaticum) populations deduced from polymorphic microsatellite loci (2013)
  • Author(s): Yamazaki, Y., R. Yokoyama, T. Nagai, A. Goto,
  • Journal Title: Environmental Biology of Fishes Volume: 未定 Issue: 1 Pages: 43-52
  • DOI: 10.1007/s10641-013-0121-y
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Freshwater sculpin dwelling in Lake Chuzenji, Nikko, Kanto District, Janan, is identified as Utsusemikajika, Cottus reinii, unintentionally introduced from Lake Biwa (2012)
  • Author(s): Yokoyama, R., S. Yamamoto
  • Journal Title: Ichthyological Research Volume: 54 Issue: 4 Pages: 389-393
  • DOI: 10.1007/s10228-012-0298-7
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Mitochondrial DNA analysis reveals a unique population structure of the amphidromous sculpin Cottus pollux middle-egg type (Teleostei : Cottidae) (2011)
  • Author(s): Tsukagoshi, H., R.Yokoyama, A.Goto
  • Journal Title: Molecular Phylogenetics and Evolution Volume: 60 Pages: 265-270
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Formation of a fluvial-nonparasitic population as the first step in lamprey speciation (2011)
  • Author(s): Yamazaki, Y., R.Yokoyama, T.Nagai, A.Goto
  • Journal Title: Journal of Fish Biology Volume: 79 Pages: 2043-2059
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 底生性カジカ類の適応放散と種分化:プロコッタス属.日本魚類学会シンポジウム「バイカル湖におけるカジカ類の期限、適応放散と種分化」 (2012)
  • Author(s): 横山良太
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 水産大学校(下関市)
  • Year and Date: 2012-09-24
• [Presentation] 中禅寺湖に生息する淡水カジカ類は琵琶湖より非意図的にもたらされたウツセミカジカである (2012)
  • Author(s): 横山良太・山本祥一郎
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 水産大学校(下関市)
  • Year and Date: 2012-09-23
• [Presentation] Incidence of skeletal deformity (truncated upper jaw) in a natural population of white-spotted charr Salvelinus leucomaenis. (2012)
  • Author(s): Yamamoto, S., K. Morita, R. Yokoyama, K. Miyamoto, M. Sato and K. Maekawa
  • Organizer: The 7th International Charr Symposium.
  • Place of Presentation: Yuzhino-Sakhalinsk, Russia
  • Year and Date: 2012-09-04
• [Presentation] Origin, molecular phylogeny and adaptive radiation of sculpin species flock in Lake Baikal (2012)
  • Author(s): Goto, A., R. Yokoyama and V. G. Sideleva
  • Organizer: XIV European Congress of Ichthyology
  • Place of Presentation: Liege, Belgium
  • Year and Date: 2012-07-03
• [Presentation] Predicting effects of climate change on population structure of a boreal fish, Barbatula toni, based on ecological niche modeling. (2012)
  • Author(s): Yokoyama, R., H. Shirakawa, M. Uranishi and A. Goto
  • Organizer: Predicting effects of climate change on population structure of a boreal fish, Barbatula toni, based on ecological niche modeling.
  • Place of Presentation: Otsu, Shiga
  • Year and Date: 2012-03-21
• [Presentation] Predicting effects of climate change on population structure of a boreal fish, Barbatula toni, based on ecological niche modeling (2012)
  • Author(s): Yokoyama, R., ほか(全4名中1番目)
  • Organizer: The 5th East Asian Federation of Ecological Societies International Congress
  • Place of Presentation: 龍谷大学瀬田キャンパス
  • Year and Date: 2012-03-21
• [Presentation] 生態ニッチモデリングと遺伝データから冷水性淡水魚類の集団構造を推定する (2012)
  • Author(s): 横山良太・白川北斗・浦西茉耶・桑原禎知・後藤晃
  • Organizer: 日本生態学会
  • Place of Presentation: 龍谷大学瀬田キャンパス(大津市)
  • Year and Date: 2012-03-20
• [Presentation] 生態ニッチモデリングと遺伝データから冷水性淡水魚類の集団構造を推定する (2012)
  • Author(s): 横山良太, ほか(全5名中1番目)
  • Organizer: 日本生態学会
  • Place of Presentation: 龍谷大学瀬田キャンパス
  • Year and Date: 2012-03-20
• [Presentation] 中禅寺湖に生息する淡水カジカ類は琵琶湖より非意図的にもたらされたウツセミカジカである (2012)
  • Author(s): 横山良太、山本祥一郎
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 水産大学校（下関）
• [Presentation] 底生性カジカ類の適応放散と種分化：プロコッタス属 (2012)
  • Author(s): 横山良太
  • Organizer: 日本魚類学会（シンポジウム）
  • Place of Presentation: 水産大学校（下関）
• [Presentation] Incidence of skeletal deformity (truncated upper jaw) in a natural population of white-spotted charr Salvelinus leucomaenis (2012)
  • Author(s): Yamamoto, S., K. Morita, R. Yokoyama, K. Miyamoto, M. Sato and K. Maekawa
  • Organizer: The 7th International Charr Symposium
  • Place of Presentation: SakhNIRO(Yuzhno-Sakhalinsk, Russia)
• [Presentation] Origin, molecular phylogeny and adaptive radiation of sculpin species flock in Lake Baikal (2012)
  • Author(s): Goto, A., R. Yokoyama, V. G. Sideleva
  • Organizer: XIV European Congress of Ichthyology
  • Place of Presentation: University of Liege (Liege, Belgium)
• [Presentation] 生息適地モデルからフクドジョウの集団構造を予測する (2011)
  • Author(s): 横山良太・西城学・白川北斗・浦西茉耶・後藤晃
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 弘前大学(弘前市)
  • Year and Date: 2011-10-01
• [Presentation] フナ種群Carassius auratus-complex における主要系統のさらなる探索 (2011)
  • Author(s): 高田未来美ほか15 名
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 弘前大学(弘前市)
  • Year and Date: 2011-10-01
• [Presentation] 生態系エンジニアとしてのカワヤツメ幼生の生息適地の環境変化に伴う変遷を予測する (2011)
  • Author(s): 白川北斗・浦西茉耶・横山良太・後藤晃
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 弘前大学(弘前市)
  • Year and Date: 2011-10-01
• [Presentation] 生息適地モデルからフクドジョウの集団構造を予測する (2011)
  • Author(s): 横山良太, ほか(全4名中1番目)
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 弘前大学文京町キャンパス
  • Year and Date: 2011-10-01
• [Presentation] 生態系エンジニアとしてのカワヤツメ幼生の生息適地の環境変化に伴う変遷を予測する (2011)
  • Author(s): 白川北斗, ほか(全4名中3番目)
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 弘前大学文京町キャンパス
  • Year and Date: 2011-10-01
• [Presentation] 希少水産資源カワヤツメの遺伝的集団構造 (2011)
  • Author(s): 山崎裕治・長井輝美・横山良太・後藤晃
  • Organizer: 日本水産学会
  • Place of Presentation: 長崎大学(長崎市)
  • Year and Date: 2011-09-28
• [Presentation] 分子からみた河川性魚類の分布域形成とデモグラフィ (2011)
  • Author(s): 横山良太・西城学・白川北斗・浦西茉耶・後藤晃
  • Organizer: 日本生態学会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター(札幌市)
  • Year and Date: 2011-03-11
• [Presentation] 分子からみた河川性魚類の分布域形成とデモグラフィ (2011)
  • Author(s): 横山良太, 他5名
  • Organizer: 日本生態学会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター(札幌)
  • Year and Date: 2011-03-11
• [Presentation] ミトコンドリアDNA およびマイクロサテライトDNA を用いたカジカ種群の網羅的系統解析 (2010)
  • Author(s): 塚越英晴・横山良太・後藤晃
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 三重市民会館(津市)
  • Year and Date: 2010-09-25
• [Presentation] バイカルカジカ類の水深に応じた適応放散:Procottus 属4 種の分子系統 (2010)
  • Author(s): 横山良太・シデレワ,V.G.・高橋洋・宗原弘幸・木下泉・後藤晃
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 三重市民会館(津市)
  • Year and Date: 2010-09-25
• [Presentation] ミトコンドリアDNAおよびマイクロサテライトDNAを用いたカジカ種群の網羅的系統解析 (2010)
  • Author(s): 塚越英晴, 他2名
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 三重県文化会館(津)
  • Year and Date: 2010-09-25
• [Presentation] バイカルカジカ類の水深に応じた適応放散:Procottus属4種の分子系統 (2010)
  • Author(s): 横山良太, 他4名
  • Organizer: 日本魚類学会
  • Place of Presentation: 三重県文化会館(津)
  • Year and Date: 2010-09-25
• [Presentation] バイカルカジカ類のProcottus 属における視覚関連遺伝子の適応と分化 (2010)
  • Author(s): 横山良太・シデレワ,V.G.・宗原弘幸・高橋洋・木下泉・後藤晃
  • Organizer: 日本進化学会
  • Place of Presentation: 東京工業大学(東京)
  • Year and Date: 2010-08-03
• [Presentation] バイカルカジカ類のProcottus属における視覚関連遺伝子の適応的分化 (2010)
  • Author(s): 横山良太, 他5名
  • Organizer: 日本進化学会
  • Place of Presentation: 東京工業大学(東京)
  • Year and Date: 2010-08-03
• [Book] 淡水カジカ類の分子系統と生活史進化,カジカ類の多様性‐適応と進化‐(宗原弘幸・後藤晃・矢部衞編) (2011)
  • Author(s): 横山良太・後藤晃
  • Publisher: 東海大学出版会
• [Book] カジカ類の多様性-適応と進化- (2011)
  • Author(s): 横山良太・後藤晃(分担執筆)
  • Publisher: 東海大学出版会
• [Book] 冷水性淡水魚類の系統地理,淡水魚類地理の自然史【多様性と分化をめぐって】(渡辺勝敏・高橋洋編) (2010)
  • Author(s): 横山良太
  • Publisher: 北海道大学出版会
• [Book] 淡水魚類地理の自然史【多様性と分化をめぐって】 (2010)
  • Author(s): 横山良太(共著)
  • Publisher: 北海道大学出版会