Evolution of genetic regulatory networks through amplification and transposition of transposons

• Project/Area Number: 22570212
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Evolutionary biology
• Research Institution: Hiroshima University
• Principal Investigator: HIKOSAKA Akira 広島大学, 大学院・総合科学研究科, 助教 (30263635)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): KAWAHARA Akira 広島大学, 大学院・総合科学研究科, 教授 (50112157)
• Project Period (FY): 2010 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2012: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000); Fiscal Year 2011: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2010: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
• Keywords: 遺伝子進化 / トランスポゾン / ツメガエル / ゲノム進化 / MITE / 自然選択 / 遺伝子発現調節 / 進化 / ゲノム / 遺伝子発現

Research Abstract

We studied the possibility that some transposons whose transposition activities have been retained for a long time in Xenopushave been involved in the evolution of genetic regulatory network. We developed a new strategy to find and classify the T2-MITE transposon family and searched the Xenoousgenomes for T2-MITEs. In addition, we analyzed insertion loci of such transposons and gene expression patterns of neighbor genes and found T2-MITE subfamilies whose transposition and amplification might have driven the evolution of genetic regulatory network of Xenopus.

Research Products

• [Journal Article] Recent transposition activity of XenopusT2 family miniature inverted-repeat transposable elements (2011)
  • Author(s): Akira Hikosaka、Kazuki Nishimura、Tomoe Hikosaka-Katayama、Akira Kawahara
  • Journal Title: Molecular Genetics and Genomics. Volume: 285巻 Issue: 3 Pages: 219-224
  • DOI: 10.1007/s00438-010-0599-3
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Recent transposition activity of Xenopus T2 family miniature inverted-repeat transposable elements. (2011)
  • Author(s): Akira Hikosaka、Kazuki Nishimura、Tomoe Hikosaka-Katayama、Akira Kawahara
  • Journal Title: MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS Volume: 285 Pages: 219-224
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 無腸動物Waminoa sp.の人工飼育と産卵法 -動物-藻類共生研究モデル系開発に向けて- (2010)
  • Author(s): 彦坂-片山智恵、彦坂暁
  • Journal Title: 広島大学総合科学研究科紀要I,人間科学研究 Volume: 5 Pages: 39-45
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ツメガエルの転移因子 T2-MITE の転移酵素は純化選択により保存されてきたのか? (2012)
  • Author(s): 彦坂暁、小西世悟、河原明
  • Organizer: 日本動物学会第83回大会
  • Place of Presentation: 大阪大学
  • Year and Date: 2012-09-13
• [Presentation] ツメガエル T2-MITE トランスポゾンが「長生き」な理由を考える (2011)
  • Author(s): 彦坂暁
  • Organizer: 第5回日本ツメガエル研究集会
  • Place of Presentation: 静岡県熱海市
  • Year and Date: 2011-10-06
• [Presentation] ツメガエルT2-MITEトランスポゾンが「長生き」な理由を考える (2011)
  • Author(s): 彦坂暁
  • Organizer: 第5回日本ツメガエル研究集会
  • Place of Presentation: 静岡県熱海市
  • Year and Date: 2011-10-06
• [Presentation] トランスポゾン T2-MTIEのシスエレメント進化における役割 (2011)
  • Author(s): 彦坂暁、河原明
  • Organizer: 日本動物学会第82回大会
  • Place of Presentation: 北海道旭川市
  • Year and Date: 2011-09-22
• [Presentation] トランスポゾンT2-MTIEのシスエレメント進化における役割 (2011)
  • Author(s): 彦坂暁
  • Organizer: 日本動物学会第82回大会
  • Place of Presentation: 北海道旭川市
  • Year and Date: 2011-09-22
• [Presentation] 無腸動物ワミノアの卵巣成熟と共生藻獲得過程の観察手法 (2011)
  • Author(s): 彦坂智恵
  • Organizer: 日本動物学会第82回大会
  • Place of Presentation: 北海道旭川市
  • Year and Date: 2011-09-21
• [Presentation] ツメガエルのトランスポゾン T2-MITE ファミリーを動かす転移酵素群の進化 (2010)
  • Author(s): 彦坂暁、河原明
  • Organizer: 第12回日本進化学会大会
  • Place of Presentation: 東京工業大学
  • Year and Date: 2010-08-05
• [Presentation] ツメガエルのトランスポゾンT2-MITEファミリーを動かす転移酵素群の進化 (2010)
  • Author(s): 彦坂暁
  • Organizer: 第12回日本進化学会大会
  • Place of Presentation: 東京都目黒区
  • Year and Date: 2010-08-04
• [Presentation] ツメガエルの転移因子T2-MITEの転移酵素は純化選択により保存されてきたのか？
  • Author(s): 彦坂暁
  • Organizer: 日本動物学会第八十三回大会
  • Place of Presentation: 大阪大学
• [Remarks]
  • URL: http://home.hiroshima-u.ac.jp/akirahs/Site/top.html