Development of an Alliumhigh accuracy chromosome map via the use of doubled haploid lines

• Project/Area Number: 22580033
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Horticulture/Landscape architecture
• Research Institution: Yamaguchi University
• Principal Investigator: SHIGYO Masayoshi 山口大学, 農学部, 農学部 (40314827)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): ITO Shinichi 山口大学, 農学部, 教授 (30243629)
• Project Period (FY): 2010 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2012: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2011: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2010: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
• Keywords: シャロット / タマネギ / 倍加半数体 / 雌性発生 / 雄性不稔回復遺伝子 / サポニン / QTL / タマネギ乾腐病 / 雄性不稔性回復遺伝子 / 雌性発生個体群 / 細胞質雄性不稔 / 稔性回復遺伝子 / DNAマーカー / 連鎖地図 / ネギ属 / 倍加半数体系統 / 高精度染色体地図 / フザリウム菌 / 乾腐病

Research Abstract

The combined use of doubled haploid (DH) lines and molecular markers in Alliumgenetic study can provide an essential information in Allium cepabreeding program. In this study, a gynogenic mapping population was successfully produced from F1plants between shallot and bulb onion DH lines, and could be used for constructing the linkage map of A. cepa. The successful research outcomes of this study were to map DNA markers linked to the Msnuclear fertility-restoring gene for S-type cytoplasmic male sterility and to determine the chromosomal locations of genes related to Fusarium basal rot resistance.

Research Products

• [Presentation] 倍加半数体技術の効果的な利用による Allium cepa 連鎖地図の構築 (2013)
  • Author(s): 岩田智志・塚崎光・若生忠幸・山内直樹・執行正義
  • Organizer: 園芸学会平成 25 年度春季大会
  • Place of Presentation: 東京農工大学(小金井市)
  • Year and Date: 2013-03-24
• [Presentation] Combined use of gene preservation lines and artificially manipulated genetic stocks in omics approach of cultivated Allium species、 (2013)
  • Author(s): Masayoshi Shigyo・ Syo Hirata ・ Abdelrahman Mostafa・Hoa Quynh Vu・Ariyanti Nur Aeni・Satoshi Iwata,・Tadayuki Wako・Naoki Yamauchi
  • Organizer: Plant and Animal Genome Conference (PAG) ASIA 2013
  • Place of Presentation: Grand Copthorne Waterfront Hotel (Singapore)
  • Year and Date: 2013-03-19
• [Presentation] Development of Aneuploid and Doubled Haploid Genetic Stocks in Cultivated Allium Species and Their Application to Omics Approach (2013)
  • Author(s): Masayoshi Shigyo
  • Organizer: 、Plant and Animal Genome Conference (PAG) ASIA 2013
  • Place of Presentation: Grand Copthorne Waterfront Hotel, (Singapore)
  • Year and Date: 2013-03-17
• [Presentation] タマネギおよびシャロット倍加半数体間の F1 雑種に由来する雌性発生個体群の作出 (2013)
  • Author(s): 岩田智志・山内直樹・執行正義
  • Organizer: 日本育種学会 2012 年春季大会
  • Place of Presentation: 宇都宮大学(宇都宮市)
  • Year and Date: 2013-03-04
• [Presentation] Combined use of gene preservation lines and artificially manipulated genetic stocks in omics approach of cultivated Allium species (2013)
  • Author(s): Masayoshi Shigyo, Syo Hirata, Abdelrahman Mostafa, Hoa Quynh Vu, Ariyanti Nur Aeni, Satoshi Iwata, Tadayuki Wako, Naoki Yamauchi
  • Organizer: Plant and Animal Genome Conference (PAG) ASIA 2013
  • Place of Presentation: Grand Copthorne Waterfront Hotel, Singapore
• [Presentation] タマネギ S 型雄性不稔細胞質に対する稔性回復遺伝子座の詳細マッピングに適した倍加半数体由来分離集団における DNA マーカー解析 (2012)
  • Author(s): 岩田智志・中島徹也・山内直樹・執行正義
  • Organizer: 園芸学会平成 23 年度秋季大会、
  • Place of Presentation: 岡山大学(岡山市)
  • Year and Date: 2012-09-25
• [Presentation] タマネギおよびシャロット倍加半数体系統間の F2 集団の育成とその遺伝分析 (2012)
  • Author(s): 西澤秀信・岩田智志・山内直樹・執行正義
  • Organizer: 園芸学会中四国支部平成 24 年度大会
  • Place of Presentation: 岡山大学(岡山市)
  • Year and Date: 2012-07-21
• [Presentation] Development of Novel Mapping Populations of Allium cepa via Effective Use of Doubled Haploid Technology (2012)
  • Author(s): Satoshi Iwata・Tetsuya Nakajima・Naoki Yamauchi・Masayoshi Shigyo
  • Organizer: 6th International Symposium on Edible Alliaceae
  • Place of Presentation: ACROS Fukuoka (Fukuoka)
  • Year and Date: 2012-05-22
• [Presentation] タマネギおよびシャロット倍加半数体間のF1雑種に由来する雌性発生個体群の作出 (2012)
  • Author(s): 岩田智志・山内直樹・執行正義
  • Organizer: 日本育種学会2012年春季大会
  • Place of Presentation: 宇都宮大学・宇都宮市
  • Year and Date: 2012-03-04
• [Presentation] Development of Novel Mapping Populations of Allium cepa via Effective Use of Doubled Haploid Technology (2012)
  • Author(s): Satoshi Iwata, Tetsuya Nakajima, Naoki Yamauchi, Masayoshi Shigyo
  • Organizer: 6th International Symposium on Edible Alliaceae
  • Place of Presentation: ACROS Fukuoka（福岡市）
• [Presentation] タマネギS型雄性不稔細胞質に対する稔性回復遺伝子座の詳細マッピングに適した倍加半数体由来分離集団におけるDNAマーカー解析 (2011)
  • Author(s): 岩田智志・中島徹也・山内直樹・執行正義
  • Organizer: 園芸学会平成23年度秋季大会
  • Place of Presentation: 岡山大学・岡山市
  • Year and Date: 2011-09-25
• [Presentation] Allium 属植物の根に含まれる抗菌性サポニン (2011)
  • Author(s): 手島祥貴・Magdi A. El-Sayed・田中秀平・ 執行正義・鍛治原寛・伊藤真一
  • Organizer: 平成 23年度日本植物病理学会大会
  • Place of Presentation: 東京農工大学(府中市)
  • Year and Date: 2011-03-28
• [Presentation] Allium属植物の根に含まれる抗菌性サポニン (2011)
  • Author(s): 手島祥貴・Magdi A.El-Sayed・田中秀平・執行正義・鍛治原寛・伊藤真一
  • Organizer: 平成23年度日本植物病理学会大会
  • Place of Presentation: 東京農工大学
  • Year and Date: 2011-03-28
• [Presentation] タマネギおよびシャロット倍加半数体系統間における DNA マーカーの開発とそれらの F1雑種を用いたマッピング集団の作出 (2011)
  • Author(s): 岩田智志・中島徹也・山内直樹・執行正義
  • Organizer: 園芸学会平成 23 年度春季大会
  • Place of Presentation: 宇都宮大学(宇都宮市)
  • Year and Date: 2011-03-20
• [Presentation] タマネギおよびシャロット倍加半数体系統間におけるDNAマーカーの開発とそれらのF1雑種を用いたマッピング集団の作出 (2011)
  • Author(s): 岩田智志・中島徹也・山内直樹・執行正義
  • Organizer: 園芸学会平成23年度春季大会
  • Place of Presentation: 宇都宮大学
  • Year and Date: 2011-03-20
• [Presentation] タマネギおよびシャロット倍加半数体系統間の DNA 多型検出とそれらの F1雑種を用いた雌性配偶子由来半数体の作出 (2010)
  • Author(s): 岩田智志
  • Organizer: 第2回中国地域育種談話会
  • Place of Presentation: 鳥取大学(鳥取市)
  • Year and Date: 2010-12-18
• [Presentation] タマネギおよびシャロット倍加半数体系統間のDNA多型検出とそれらのF1雑種を用いた雌性配偶子由来半数体の作出 (2010)
  • Author(s): 岩田智志
  • Organizer: 第2回中国地域育種談話会
  • Place of Presentation: 鳥取大学
  • Year and Date: 2010-12-18
• [Presentation] シャロットに含まれる二次代謝物の抗菌作用 (2010)
  • Author(s): 手島祥貴・Hangger G. Mawandha・Magdi A. El-Sayed・田中秀平・執行正義・赤壁善彦・伊藤真一
  • Organizer: 平成 22 年度日本植物病理学会
  • Place of Presentation: 福井 AOSSA(福井市)
  • Year and Date: 2010-09-30
• [Presentation] シャロットに含まれる二次代謝物の抗菌作用 (2010)
  • Author(s): 手島祥貴・Hangger G.Mawandha・Magdi A.El-Sayed・田中秀平・執行正義・赤壁善彦・伊藤真一
  • Organizer: 平成22年度日本植物病理学会関西部会
  • Place of Presentation: 福井AOSSA
  • Year and Date: 2010-09-30
• [Presentation] 倍加半数体技術の効果的な利用によるAllium cepa 連鎖地図の構築
  • Author(s): 岩田智志・塚崎光・若生忠幸・山内直樹・執行正義
  • Organizer: 園芸学会平成25 年度春季大会
  • Place of Presentation: 東京農工大（小金井市）
• [Presentation] Development of Aneuploid and Doubled Haploid Genetic Stocks in Cultivated Allium Species and Their Application to Omics Approach
  • Author(s): Masayoshi Shigyo
  • Organizer: Plant and Animal Genome Conference (PAG) ASIA 2013
  • Place of Presentation: Grand Copthorne Waterfront Hotel, Singapore
• [Presentation] タマネギおよびシャロット倍加半数体系統間のF2 集団の育成とその遺伝分析
  • Author(s): 西澤秀信・岩田智志・山内直樹・執行正義
  • Organizer: 園芸学会中四国支部平成24年度大会
  • Place of Presentation: 岡山大学（岡山市）