Analysis of frequency specificity, oscillations and adaptation in a signaling pathway consisting of multiple signaling modules.

• Project/Area Number: 22680024
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Bioinformatics/Life informatics
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: SAWAI Satoshi 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)
• Project Period (FY): 2010 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥24,960,000 (Direct Cost: ¥19,200,000、Indirect Cost: ¥5,760,000); Fiscal Year 2012: ¥7,930,000 (Direct Cost: ¥6,100,000、Indirect Cost: ¥1,830,000); Fiscal Year 2011: ¥8,060,000 (Direct Cost: ¥6,200,000、Indirect Cost: ¥1,860,000); Fiscal Year 2010: ¥8,970,000 (Direct Cost: ¥6,900,000、Indirect Cost: ¥2,070,000)
• Keywords: 生体情報 / 振動 / 適応 / 粘菌 / 入出力関係 / 頑強性 / モジュール / シグナル伝達 / ネットワーク / ライブセルイメージング / 自己組織化

Research Abstract

Adaptive and oscillatory response consisting of multiple time-scales was analyzed by taking an example from cAMP-induced cAMP relay-response in Dictyostelium. Based on quantitative live-cell imaging analysis, we found that the first peak can be considered as an output from a module that realizes fold-change detection. The prolonged response on the other hand depends on the absolute concentration of extracellular cAMP and appears to be dependent on F-actin mediated feedaback. We discussed the relationship between these observed properties and robustness of cell-cell signaling.

Research Products

• [Journal Article] Phase geometries oftwo-dimensional excitable wavesgovern self-organized morphodynamicsof amoeboid cells. (2013)
  • Author(s): D. Taniguchi, S. Ishihara, T. Oonuki,M. Honda-Kitahara, K. Kaneko and S.Sawai
  • Journal Title: Proc. Natl. Acad.Sci. USA Volume: 110
• [Journal Article] The green tea catechinepigallocatechin gallate (EGCG) blocks cell motility, chemotaxis and development in Dictyostelium discoideum. (2013)
  • Author(s): K. J. McQuade, A. Nakajima, A. N.Ilacqua1, N. Shimada and S. Sawai.
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: 8(3) Issue: 3 Pages: e59275-e59275
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0059275
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Robustness of Self-Organizing Chemoattractant Field Arising from Precise Pulse Induction of Its Breakdown Enzyme: A Single-Cell Level Analysis of PDE Expression in Dictyostelium. (2013)
  • Author(s): N. Masaki, K. Fujimoto, M.Honda-Kitahara, E. Hada and S. Sawai
  • Journal Title: Biophys. J. Volume: 104 Issue: 5 Pages: 1191-1202
  • DOI: 10.1016/j.bpj.2013.01.023
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Phase geometries of two-dimensional excitable waves govern self-organized morphodynamics of amoeboid cells (2013)
  • Author(s): D. Taniguchi, S. Ishihara, T. Oonuki, M. Honda-Kitahara, K. Kaneko and S. Sawai
  • Journal Title: Proc. Natl. Acad. Sci. USA Volume: Vol. 110, No. 13 Issue: 13 Pages: 5016-5021
  • DOI: 10.1073/pnas.1218025110
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The collective oscillations in developing cells: Insights from simple systems. (2011)
  • Author(s): K. Kamino, K. Fujimoto and S. Sawai
  • Journal Title: Dev. Growth Diff. Volume: 53 Issue: 4 Pages: 503-517
  • DOI: 10.1111/j.1440-169x.2011.01266.x
  • NAID: 10028273979
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The onset of collective behavior in social amoebae. (2010)
  • Author(s): T. Gregor, K. Fujimoto, N. Masaki and S. Sawai
  • Journal Title: Science Volume: 328 Issue: 5981 Pages: 1021-1025
  • DOI: 10.1126/science.1183415
• [Journal Article] The onset of collective behavior in social amoebae (2010)
  • Author(s): T.Gregor, N.Masaki, K.Fujimoto, S.Sawai
  • Journal Title: Science Volume: 328 Pages: 1021-1025
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Wave geometries and cell shape dynamics (2013)
  • Author(s): S. Sawai ( Tokyo Univ. )
  • Organizer: The 10th NIBB-EMBL Symposium 2013 on Quantitative Bioimaging
  • Place of Presentation: Okazaki Conference Center （愛知県、岡崎市）
  • Invited
• [Presentation] Design principle of group-level decision making in cell populations (2013)
  • Author(s): K. Fujimoto (Osaka Univ.), S. Sawai ( Tokyo Univ. )
  • Organizer: The 1st annual winter Q-bio conference
  • Place of Presentation: Hilton Hawaiian Village (米国、ハワイ）
• [Presentation] 細胞動態と自己組織化現象：反応-拡散-駆動系 (2013)
  • Author(s): 澤井哲（東京大学）
  • Organizer: 第51回東京大学物理学教室コロキアム
  • Place of Presentation: 東京大学本郷キャンパス（東京都、文京区）
  • Invited
• [Presentation] 細胞性粘菌の1細胞レヘルの cAMP応答における cAMP受容体のリン酸化の役割 (2012)
  • Author(s): 井元大輔, 本多麻衣, 澤井哲
  • Organizer: 第5回定量生物学の会
  • Place of Presentation: 東京大学生産技術研究所、東京、日本
  • Year and Date: 2012-11-25
• [Presentation] Phase response of the collective cAMP oscillations Dictyostelium discoideum and its implication to the adaptive properties (2012)
  • Author(s): D. Imoto & S. Sawai
  • Organizer: 第50回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 大学東キャンハス、日本)
  • Year and Date: 2012-09-23
• [Presentation] Processing and Self-organization in Developing Cell (2012)
  • Author(s): S. Sawai
  • Organizer: CDB Symposium 2012 on Quantitative Developmental Biology "Information
  • Place of Presentation: 理化学研究所、神戸、日本
  • Year and Date: 2012-03-28
• [Presentation] Information Processing and Self-organization in Developing Cells (2012)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: CDB Symposium 2012 on Quantitative Developmental Biology
  • Place of Presentation: 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター(神戸)(招待講演)
  • Year and Date: 2012-03-28
• [Presentation] Mechanism identification of multicellular dynamics with statistical machine learning (2012)
  • Author(s): 近藤洋平, 神野圭太, 石原秀至, 澤井哲, 金子邦彦
  • Organizer: CDB Symposium 2012 on Quantitative Developmental Biology
  • Place of Presentation: 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター(神戸)(ポスター発表)
  • Year and Date: 2012-03-27
• [Presentation] A Mathematical Model of Amoeboid Motion in Dictyostelium (2012)
  • Author(s): 石原秀至, 谷口大相, 澤井哲
  • Organizer: CDB symposium2012 Quantitative Developmental Biology
  • Place of Presentation: 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター(神戸)(ポスター発表)
  • Year and Date: 2012-03-26
• [Presentation] Robust cell-cell signaling is achieved by fold-change responsiveness of the cells (2012)
  • Author(s): 神野圭太
  • Organizer: CDB Symposium 2012 on Quantitative Developmental Biology
  • Place of Presentation: 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター(神戸)(ポスター発表)
  • Year and Date: 2012-03-26
• [Presentation] 統計的機械学習による細胞ダイナミクスのメカニズム推定 (2012)
  • Author(s): 近藤洋平, 神野圭太, 石原秀至, 澤井哲, 金子邦彦
  • Organizer: 日本物理学会第67回年次大会
  • Place of Presentation: 関西学院大学西宮上ヶ原キャンパス(口頭発表)
  • Year and Date: 2012-03-24
• [Presentation] アメーバの自発的形状変化とリン脂質シグナルの自己組織化パターンとの関係 (2012)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: 分子ロボティクス研究会2月月例会
  • Place of Presentation: 東京工業大学田町キャンパス(招待講演)
  • Year and Date: 2012-02-13
• [Presentation] Fold-change responsiveness and robust patterning in development (2012)
  • Author(s): 神野圭太, 近藤洋平, 澤井哲
  • Organizer: The Joint symposium by JST/BBSRC Molecular Imaging and Systems Biology
  • Place of Presentation: 東京大学弥生講堂(ポスター発表)
  • Year and Date: 2012-01-30
• [Presentation] Extracting core mechanisms of cell signaling dynamics from live-cell imaging data (2012)
  • Author(s): 近藤洋平, 神野圭太, 石原秀至, 澤井哲, 金子邦彦
  • Organizer: The Joint Symposium by JST/BBSRC Molecular Imaging and Systems Biology
  • Place of Presentation: 東京大学弥生講堂(ポスター発表)
  • Year and Date: 2012-01-30
• [Presentation] Imaging analysis of self-organization in moving amoebae (2012)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: The Joint Symposium by JST/BBSRC Molecular Imaging and Systems Biology
  • Place of Presentation: 東京大学弥生講堂(招待講演)
  • Year and Date: 2012-01-30
• [Presentation] アメーバ運動を誘起する場のリズムと波 (2012)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: 新学術領域研究「動く細胞と秩序」公開シンポジウム
  • Place of Presentation: 名古屋大学(招待講演)
  • Year and Date: 2012-01-27
• [Presentation] 細胞性粘菌の細胞運動の数理モデル (2012)
  • Author(s): 石原秀至, 谷口大相, 澤井哲
  • Organizer: 定量生物学の会第4回年会
  • Place of Presentation: 名古屋大学野依記念学術交流館(ポスター発表)
  • Year and Date: 2012-01-08
• [Presentation] 細胞性粘菌の1細胞レベルのcAMP応答におけるcAMP受容体のリン酸化の役割 (2012)
  • Author(s): 井元大輔, 本多麻衣, 澤井哲（東京大学）
  • Organizer: 第5回定量生物学の会
  • Place of Presentation: 東京大学生産技術研究所（東京都、目黒区）
• [Presentation] マイクロ流路を用いて作り出した誘因物質の進行波に対する細胞の走化性運動の解析 (2012)
  • Author(s): 中島 昭彦, 石原 秀至, 澤井 哲（東京大学）
  • Organizer: 第5回定量生物学の会
  • Place of Presentation: 東京大学生産技術研究所（東京都、目黒区）
• [Presentation] 細胞内分子を機能阻害した粘菌細胞のcAMP応答の解析 (2012)
  • Author(s): 福神史仁 , 神野圭太 , 澤井哲（東京大学）
  • Organizer: 第5回定量生物学の会
  • Place of Presentation: 東京大学生産技術研究所（東京都、目黒区）
• [Presentation] マイクロ流路を用いて作り出した誘因物質の進行波に対する細胞の走化性運動の解析 (2012)
  • Author(s): 中島 昭彦, 石原 秀至, 澤井 哲（東京大学）
  • Organizer: 第2回日本細胞性粘菌学会年会
  • Place of Presentation: 東京大学駒場Iキャンパス（東京都、目黒区）
• [Presentation] 細胞内分子を機能阻害した粘菌細胞のcAMP応答の解析 (2012)
  • Author(s): 福神史仁 , 神野圭太 , 澤井哲（東京大学）
  • Organizer: 第２回日本細胞性粘菌学会年会
  • Place of Presentation: 東京大学駒場Iキャンパス（東京都、目黒区）
• [Presentation] 細胞運動中の形態変化の数理モデル (2012)
  • Author(s): 石原秀至, 谷口大相, 澤井哲（東京大学）
  • Organizer: 第2回日本細胞性粘菌学会年会
  • Place of Presentation: 東京大学駒場Iキャンパス（東京都、目黒区）
• [Presentation] Simulating Dictyostelium Cell Deformation in Amoeboid Movement (2012)
  • Author(s): S. Ishihara , D. Taniguchi , S. Sawai ( Tokyo Univ. )
  • Organizer: NOLTA2012
  • Place of Presentation: Gran Melia Victoria (スペイン、マヨルカ島、パルマ）
• [Presentation] Analysis of protein translocation in a reconstituted Dictyostelium cell membrane on a solid substrate (2012)
  • Author(s): K. Takahashi , N. Shimada , T. Toyota , S. Sawai ( Tokyo Univ. )
  • Organizer: 第50回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋大学東山キャンパス（愛知県、名古屋市）
• [Presentation] Live-cell imaging and analysis of cAMP-induced cAMP response in Dictyostelium using microfluidics chambers (2012)
  • Author(s): F. Fukujin , K. Kamino , S. Sawai ( Tokyo Univ. )
  • Organizer: 第50回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋大学東山キャンパス（愛知県、名古屋市）
• [Presentation] Phase response of the collective cAMP oscillations in Dictyostelium discoideum and its implication to the adaptive properties (2012)
  • Author(s): D. Imoto , S. Sawai ( Tokyo Univ. )
  • Organizer: 第50回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋大学東山キャンパス（愛知県、名古屋市）
• [Presentation] Modeling morphological dynamics of migrating cells governed by self-organized excitable waves (2012)
  • Author(s): 石原秀至 , 谷口大相 , 澤井哲 （東京大学）
  • Organizer: 第50回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋大学東山キャンパス（愛知県、名古屋市）
• [Presentation] Geometries of phosphatidylinositol waves and large-scale membrane deformation during spreading and random movement of Dictyostelium (2012)
  • Author(s): S. Sawai (Tokyo Univ.)
  • Organizer: International workshop on "Active Dynamics on Microscales: Molecular Motors and Self-Propelling Particles"
  • Place of Presentation: Lorentz Center （オランダ、ライデン）
  • Invited
• [Presentation] Tuning collectivity in cell fate decision (2012)
  • Author(s): K. Fujimoto (Osaka Univ.), S. Sawai (Tokyo Univ.)
  • Organizer: The 13th International Conference of Systems Biology
  • Place of Presentation: University of Toronto （カナダ、トロント）
• [Presentation] Estimating the reaction diffusion equations for phosphatidylinositide waves in Dictyostelium from live cell imaging data (2012)
  • Author(s): S. Ishihara , D. Taniguchi , S. Sawai (Tokyo Univ.)
  • Organizer: BayesComp 2012
  • Place of Presentation: The Institute of Statistical Mathematics (ISM) （東京都、立川市）
• [Presentation] Estimating reaction diffusion equations for signaling dynamics in Dictyostelium (2012)
  • Author(s): 石原秀至 , 谷口大相 , 澤井哲 （東京大学）
  • Organizer: 理研ＢＳＩ研究会「次世代情報処理における揺らぎと確率２」
  • Place of Presentation: 理化学研究所 （埼玉県、和光市）
• [Presentation] Synchronized Onset of Quorum Sensing Transition (2012)
  • Author(s): K. Fujimoto (Osaka Univ.), S. Sawai (Tokyo Univ.)
  • Organizer: Joint Meeting of The 45th Annual Meeting of JSDB and The 64th Annual Meeting of JSCB
  • Place of Presentation: Kobe International Conference Center （兵庫県、神戸市）
• [Presentation] Single-cell fold-change responsiveness and robustness in biological pattern formation (2012)
  • Author(s): 神野圭太, 近藤洋平, 澤井哲
  • Organizer: 定量生物学の会第4回年会
  • Place of Presentation: 名古屋大学野依記念学術交流館(ポスター発表)
• [Presentation] Mechanism identification of cell signaling dynamics with statistical machine learning (2012)
  • Author(s): 近藤洋平, 神野圭太, 石原秀至, 澤井哲, 金子邦彦
  • Organizer: 定量生物学の会第4回年会
  • Place of Presentation: 名古屋大学野依記念学術交流館(ポスター発表)
• [Presentation] Robust response rescaling in cyclic AMP relay response in Dictyostelium cells (2011)
  • Author(s): 神野圭太, 近藤洋平, 澤井哲
  • Organizer: 第34回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(ポスター発表)
  • Year and Date: 2011-12-14
• [Presentation] Robust response rescaling in cyclic AMP relay response in Dictyostelium cells (2011)
  • Author(s): 神野圭太, 近藤洋平, 澤井哲
  • Organizer: 第34回分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(口頭発表)
  • Year and Date: 2011-12-14
• [Presentation] 中心体・染色体分配におけるSunBタンパクの役割 (2011)
  • Author(s): 島田奈央, 澤井哲
  • Organizer: 第1回日本細胞性粘菌学会
  • Place of Presentation: 大阪大学バイオ関連多目的施設(口頭発表)
  • Year and Date: 2011-11-04
• [Presentation] 細胞運動を支えるシグナル伝達系の2次元パターンのモデル (2011)
  • Author(s): 石原秀至, 谷口大相, 大貫武彦, 澤井哲
  • Organizer: 日本物理学会2011年秋季大会
  • Place of Presentation: 富山大学五福キャンパス(口頭発表)
  • Year and Date: 2011-09-21
• [Presentation] Temporal organization of chemoattractant field and collective cell migration (2011)
  • Author(s): 中島昭彦, 廣瀬滋規, 谷口大相, Gad Shaulsky, Adam Kuspa, 澤井哲
  • Organizer: The 3rd Bangalore Microscopy Course
  • Place of Presentation: バンガロー・インド(ポスター発表)
  • Year and Date: 2011-09-18
• [Presentation] Estimating core designs of signaling networks from live-cell imaging data using a particle filter approach (2011)
  • Author(s): 近藤洋平, 神野圭太, 石原秀至, 澤井哲, 金子邦彦
  • Organizer: 第49回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 兵庫県立大学書写キャンパス(姫路)(口頭発表)
  • Year and Date: 2011-09-18
• [Presentation] Aberrant cAMP responses in huntingtin-null cells in Dictyostelium (2011)
  • Author(s): 福神史仁, 安藤智恵, 桑山秀一, 澤井哲
  • Organizer: 第49回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 兵庫県立大学書写キャンパス(姫路)(口頭発表)
  • Year and Date: 2011-09-18
• [Presentation] 生命システムの情報 処理 "Adaptive fold-change detection in chemotactic cells and its underlying network topology (2011)
  • Author(s): S. Sawai
  • Organizer: 第49回日本生物物理学会年会シンポジウム
  • Place of Presentation: 兵庫県立大学姫路書写キャンパス、兵庫、日本
  • Year and Date: 2011-09-17
• [Presentation] Relation between collective cell migration and self-organization of chemoattractant waves (2011)
  • Author(s): 中島昭彦, 廣瀬滋規, 谷口大相, Gad Shaulsky, Adam Kuspa, 澤井哲
  • Organizer: 第49回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 兵庫県立大学書写キャンパス(姫路)(口頭発表)
  • Year and Date: 2011-09-17
• [Presentation] Adaptive fold-change detection in chemotactic cells and its underlying network topology (2011)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: 第49回日本生物物理学会年会シンポジウム 生命システムの情報処理
  • Place of Presentation: 兵庫県立大学書写キャンパス(姫路)(招待講演)
  • Year and Date: 2011-09-17
• [Presentation] A particle filter approach for estimating core architectures of signaling networks from live-cell imaging of dynamics (2011)
  • Author(s): Yohei Kondo, Keita Kamino, Shuji Ishihara, Satoshi Sawai, Kunihiko Kaneko
  • Organizer: The 12th International Conference on Systems Biology
  • Place of Presentation: ハイデルベルグ・マンハイム・ドイツ(ポスター発表)
  • Year and Date: 2011-08-30
• [Presentation] いきいきした状態の物理学を目指して (2011)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: 生物物理若手の会夏の学校メインシンポジウム-生物における運動とエネルギーの物理
  • Place of Presentation: 関西セミナーハウス(京都)(招待講演)
  • Year and Date: 2011-08-26
• [Presentation] 細胞と細胞集団にみる自己組織化現象 (2011)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: 基研研究会2011非平衡系の物理-ミクロとマクロの架け橋
  • Place of Presentation: 京都大学基礎物理学研究所(招待講演)
  • Year and Date: 2011-08-19
• [Presentation] Single-cell level analysis of adaptive fold-changedetection in cAMP relay response (2011)
  • Author(s): K. Kamino, Y. Kondo & S. Sawai
  • Organizer: The annual International Dictyostelium conference (Dicty2011)
  • Place of Presentation: Radisson Cross Keys, ボルチモア、メリーランド州、米国
  • Year and Date: 2011-08-16
• [Presentation] 空間的な位相特異点と細胞の形状 (2011)
  • Author(s): 澤井哲, 石原秀至
  • Organizer: ワークショップ生物ロコモーションと同期現象
  • Place of Presentation: グリーンピア大沼(北海道)(口頭発表)
  • Year and Date: 2011-08-16
• [Presentation] Roles of SunB in centrosome positioning and nuclear division (2011)
  • Author(s): Nao Shimada, Satoshi Sawai
  • Organizer: The Annual International Dictyostelium Conference
  • Place of Presentation: ボルチモア・メリーランド州・米国(口頭発表)
  • Year and Date: 2011-08-16
• [Presentation] Single-cell level analysis of adaptive fold-change detection in cAMP relay response (2011)
  • Author(s): Keita Kamino, Yohei Kondo, Satoshi Sawai
  • Organizer: The Annual International Dictyostelium Conference
  • Place of Presentation: ボルチモア・メリーランド州・米国(口頭発表)
  • Year and Date: 2011-08-16
• [Presentation] Frequency switch in cAMP waves and its relation to cell migration (2011)
  • Author(s): Akihiko Nakajima, Shigenori Hirose, Daisuke Taniguchi, Gad Shaulsky, Adam Kuspa, Satoshi Sawai
  • Organizer: The Annual International Dictyostelium Conference
  • Place of Presentation: ボルチモア・メリーランド州・米国(ポスター発表)
  • Year and Date: 2011-08-14
• [Presentation] The adaptation of cAMP relay response in single Dictyostelium cells (2011)
  • Author(s): K. Kamino, K. Fujimoto and S. Sawai
  • Organizer: The 5th Annual Q-bio Conference on Cellular Information Processing
  • Place of Presentation: St. John's College, サンタフェ、 ニューメキシコ州、米国
  • Year and Date: 2011-08-12
• [Presentation] Adaptation of cAMP relay response in single Dictyostelium cells (2011)
  • Author(s): Keita Kamino, Koichi Fujimoto, Satoshi Sawai
  • Organizer: The 5th Annual Q-bio Conference on Cellular Information Processing
  • Place of Presentation: サンタフェ・ニューメキシコ州・米国(ポスター発表)
  • Year and Date: 2011-08-11
• [Presentation] Fold-change detection in cAMP relay response in single Dictyostelium cells (2011)
  • Author(s): Keita Kamino, Yohei Kondo, Satoshi Sawai
  • Organizer: The Fifth Q-bio Summer School on Cellular Information Processing
  • Place of Presentation: ロスアラモス・ニューメキシコ州・米国(口頭発表)
  • Year and Date: 2011-08-03
• [Presentation] Spatial phase singularities and cell shape dynamics (2011)
  • Author(s): Satoshi Sawai
  • Organizer: International conference on Engineering of Chemical Complexity Mini-symposium-Applications to Cell Biology
  • Place of Presentation: ダーレム・ベルリン・ドイツ(招待講演)
  • Year and Date: 2011-07-07
• [Presentation] 細胞性粘菌にみるクオラムセンシングのアルゴリズム (2011)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: 第49回日本生体医工学会 シンポジウム「生物のリズム戦略」
  • Place of Presentation: 大阪国際交流センター(招待講演)
  • Year and Date: 2011-06-25
• [Presentation] 自己組織化する集合シグナルと協調的な細胞運動 (2011)
  • Author(s): 中島昭彦, 廣瀬滋規, 谷口大相, Gad Shaulsky, Adam Kuspa, 澤井哲
  • Organizer: 第11回東京大学生命科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京大学本郷キャンパス(ポスター発表)
  • Year and Date: 2011-06-04
• [Presentation] 位相の特異点からみる細胞と細胞集団の運動特性 (2011)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: アクティブマター研究会2011
  • Place of Presentation: 東京大学山上会館(口頭発表)
  • Year and Date: 2011-02-07
• [Presentation] 粘菌のcAMP振動と形態形成運動 (2011)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: 第1回新学術領域「哺乳類初期発生の細胞コミュニティー」公開シンポジウム「異分野の融合による新たな発生生物学の幕開け」
  • Place of Presentation: 九州大学(病院地区 コラボステーション)(招待講演)
  • Year and Date: 2011-01-17
• [Presentation] 粘菌細胞におけるcAMP応答の分子メカニズムの-細胞レベル解析 (2010)
  • Author(s): 神野圭太, 藤本仰一, 澤井哲
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(ポスター発表)
  • Year and Date: 2010-12-10
• [Presentation] 細胞密度をリモートセンシングする興奮かつ振動的なシグナル応答 (2010)
  • Author(s): 藤本仰一, 澤井哲
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(招待講演)
  • Year and Date: 2010-12-08
• [Presentation] Precise Tuning of Self-Organizing Waves of PIP3/Actin by SCAR/WAVE Complex (2010)
  • Author(s): 大貫武彦, 谷口大相, 澤井哲
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(ポスター発表)
  • Year and Date: 2010-12-08
• [Presentation] Adaptation and fold-change detection of CAMP response and the underlying molecular mechanism in Dicytostelium (2010)
  • Author(s): 神野圭太, 澤井哲
  • Organizer: 第3回定量生物学の会年会
  • Place of Presentation: 東京大学(生産研)(ポスター発表)
  • Year and Date: 2010-11-27
• [Presentation] 自己組織化するリン脂質パターンの位相特異点解析 (2010)
  • Author(s): 谷口大相, 石原秀至, 大貫武彦, 金子邦彦, 澤井哲
  • Organizer: 第3回定量生物学の会年会
  • Place of Presentation: 東京大学(生産研)(ポスター発表)
  • Year and Date: 2010-11-27
• [Presentation] F-actin polymerization activator SCAR/WAVE complex regulates precise PIP3/F-actin wave nucleation and propagation (2010)
  • Author(s): 大貫武彦, 谷口大相, 澤井哲
  • Organizer: 第3回定量生物学の会年会
  • Place of Presentation: 東京大学(生産研)(ポスター発表)
  • Year and Date: 2010-11-27
• [Presentation] 粘菌の細胞分化と振動シグナルとの関連についての展望 (2010)
  • Author(s): 島田奈央, 澤井哲
  • Organizer: 第3回定量生物学の会年会
  • Place of Presentation: 東京大学(生産研)(ポスター発表)
  • Year and Date: 2010-11-27
• [Presentation] Single-cell level analysis of adaptation in chemoattractantsignaling in Dictyostelium (2010)
  • Author(s): K. Kamino & S. Sawai
  • Organizer: International Conference on Systems Biology (ICSB2010)
  • Place of Presentation: EICC, エジンバラ、英国
  • Year and Date: 2010-10-13
• [Presentation] Single-cell level analysis of adaptation in chemoattractant signaling in Dictyostelium (2010)
  • Author(s): 神野圭太、澤井哲
  • Organizer: International Conference on Systems Biology(ICSB2010)
  • Place of Presentation: エジンバラ(英国)(オーガナイザー発表)
  • Year and Date: 2010-10-11
• [Presentation] Phase singularity analysis of self-organizing phosphatidylinositol waves in Dictyostelium discoideum cells (2010)
  • Author(s): 谷口大相, 石原秀至, 大貫武彦, 金子邦彦, 澤井哲
  • Organizer: 第48回生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 東北大学(仙台)(口頭発表)
  • Year and Date: 2010-09-22
• [Presentation] 細胞性粘菌の脱適応現象とその集団的振動における役割 (2010)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: 第48回生物物理学会 年会シンポジウム「システムレベルの生物物理学 多細胞ダイナミクス」
  • Place of Presentation: 東北大学 川内キャンパス(ポスター発表)
  • Year and Date: 2010-09-21
• [Presentation] Single-cell level analysis of adaptive cAMP response and the underlying network topologies in Dictyostelium (2010)
  • Author(s): K.Kamino, S.Sawai
  • Organizer: 第48回生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 東北大学 川内キャンパス(ポスター発表)
  • Year and Date: 2010-09-21
• [Presentation] Mutational analyses of PIP3/F-actin wave nucleation and propagation (2010)
  • Author(s): 大貫武彦, 谷口大相, 澤井哲
  • Organizer: 第48回生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 東北大学(仙台)(ポスター発表)
  • Year and Date: 2010-09-21
• [Presentation] Subthreshold Dynamics is Crucial for Remote Sensing of Cell Density (2010)
  • Author(s): 藤本仰一, 澤井哲
  • Organizer: 第48回生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 東北大学 川内キャンパス(口頭発表)
  • Year and Date: 2010-09-20
• [Presentation] 数理モデルとシミュレーション」"Single-cell level analysis of the adaptive cAMP response in Dictyostelium (2010)
  • Author(s): S. Sawai
  • Organizer: CBI学会2010年大会オーガナイズドセッション
  • Place of Presentation: 学術総合センター 一橋記念講堂、東京、日本
  • Year and Date: 2010-09-17
• [Presentation] Single-cell level analysis of the adaptive cAMP response in Dictyostelium (2010)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: CBI学会2010年大会 オーガナイズドセッション「数理モデルとシミュレーション」
  • Place of Presentation: 学術総合センター 一橋記念講堂(招待講演)
  • Year and Date: 2010-09-17
• [Presentation] 「バイオイメージングと定量生物学」「倍変化検出型の応答 とその集団振動における役割」 (2010)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: 第19回日本バイオイメージング学会シンポジウム
  • Place of Presentation: 慶応大学日吉キャンパス来往 舎、神奈川、日本
  • Year and Date: 2010-09-10
• [Presentation] 倍変化検出型の応答とその集団振動における役割 (2010)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: 第19回イメージング学会 シンポジウム「バイオイメージングと定量生物学」
  • Place of Presentation: 慶応大学 日吉キャンパス来往舎(招待講演)
  • Year and Date: 2010-09-10
• [Presentation] Quantitative biology of spatiotemporal dynamics in development" "Adaptation and de-adaptation kinetics underlying the synchronized oscillations in Dictyostelium (2010)
  • Author(s): S. Sawai
  • Organizer: 第43回発生生物学会シンポジウム
  • Place of Presentation: 京都国際会議場、京都、日本
  • Year and Date: 2010-06-22
• [Presentation] Adaptation and de-adaptation kinetics underlying the synchronized oscillations in Dictyostelium (2010)
  • Author(s): 澤井哲
  • Organizer: 第43回発生生物学会 年会シンポジウム"Quantitative biology of spatiotemporal dynamics in development
  • Place of Presentation: 京都国際会議場(招待講演)
  • Year and Date: 2010-06-22
• [Book] Collective Decision-Making and Oscillatory Behaviors in Cell Populations in "Engineering of Chemical Complexity"(A. Mikhailov & G. Ertl ed.) (2013)
  • Author(s): K. Fujimoto & S. Sawai
  • Total Pages: 19
  • Publisher: World Scientific
• [Book] 実験医学 31 (6) 「興奮系の自己組織化現象からみる細胞動態」 (2013)
  • Author(s): 澤井哲 石原秀至 中島昭彦
  • Total Pages: 7
  • Publisher: 羊土社
• [Book] 生細胞イメージング 細胞性粘菌(研究の新展開)モデル生物、創薬資源、バイオ (2012)
  • Author(s): 澤井哲
  • Publisher: アイピーシー出版
• [Book] 自己組織化の研究:細胞性粘菌の生物物理学 『細胞 性粘菌(研究の新展開)モデル生物、 創薬資源、バイオ』(阿部知顕、前田靖 男 編)第 8 章 p. (2012)
  • Author(s): 中島昭彦 澤井哲
  • Publisher: アイピーシー出版
• [Book] 細胞性粘菌（研究の新展開）～モデル生物、創薬資源、バイオ～（阿部知顕、前田靖男 編） (2012)
  • Author(s): 澤井哲
  • Total Pages: 19
  • Publisher: アイピーシー出版
• [Book] 細胞性粘菌（研究の新展開）～モデル生物、創薬資源、バイオ～（阿部知顕、前田靖男 編） (2012)
  • Author(s): 中島昭彦 澤井哲
  • Total Pages: 22
  • Publisher: アイピーシー出版
• [Book] 『JT生命誌研究館生命誌季刊号』65-68号「RESEARCH研究を通して-粘菌のふるまいに見る自己組織化の始まり」 (2012)
  • Author(s): 澤井哲
  • Publisher: 新曜社
• [Book] パターン形成リズムのデザイ ン細胞工学 (2011)
  • Author(s): 澤井哲
  • Publisher: 秀潤社
• [Book] 『細胞工学』Vol.30 12月号「パターン形成リズムのデザイン」 (2011)
  • Author(s): 澤井哲
  • Publisher: 秀潤社
• [Book] 『理論生物学-生命科学の新しい潮流』第3章2節「微生物の集団的な振る舞い」(望月敦史・編) (2011)
  • Author(s): 澤井哲
  • Publisher: 共立出版
• [Book] 生命科学の新しい潮流 理論生物学(望月敦史編)(3-2章 微生物の集団的な振る舞い) (2011)
  • Author(s): 澤井哲
  • Publisher: 共立出版