Elucidation of the regulation of INK4 locus and oncogenic mechanism by the dysregulation of INK4 locus.

• Project/Area Number: 22700880
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Tumor biology
• Research Institution: Hamamatsu University School of Medicine
• Principal Investigator: KOTAKE Yojiro 浜松医科大学, 医学部, 助教 (90531963)
• Project Period (FY): 2010 – 2011
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2011)
• Budget Amount: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2011: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000); Fiscal Year 2010: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
• Keywords: 細胞老化 / 転写制御 / INK4遺伝子座 / 癌化 / ポリコームタンパク / p53 / 長鎖ノンコーディングRNA / ヒストン修飾 / ポリコーム / ノンコーディングRNA

Research Abstract

INK4 locus encodes for three distinct tumor suppressors, p15, p16 and ARF, and is altered in an estimated 30-40% of human tumors. However, the mechanism of regulation of INK4 locus is unclear. In this study, we revealed that INK4 locus is regulated by Polycomb proteins, p53 and long noncoding RNA.

Research Products

• [Journal Article] Up-regulation of Cks1 and Skp2 with TNFα/NF-κB Signaling in Chronic Progressive Nephropathy (2011)
  • Author(s): Sayuri Suzuki, Hirotaka Fukasawa, Taro Misaki, Akashi Togawa, Naro Ohashi, Kyoko Kitagawa, Yojiro Kotake, Hiroyuki Niida, Akira Hishida, Tatsuo Yamamoto and Kitagawa, Masatoshi
  • Journal Title: Genes to Cells Volume: 16(11) Pages: 1110-1120
• [Journal Article] Long non-coding RNA ANRIL is required for the PRC2 recruitment to and silencing of p15^<INK4B> tumor suppressor gene (2011)
  • Author(s): Yojiro Kotake, Tadashi Nakagawa, Kyoko Kitagawa, Sayuri Suzuki, Ning Liu, Masatoshi Kitagawa and Yue Xiong
  • Journal Title: Oncogene Volume: 30 Pages: 1956-1962
• [Journal Article] Extensive and coordinated transcription of noncoding RNAs within cell-cycle promoters (2011)
  • Author(s): Tiffany Hung, Yulei Wang, Michael F. Lin, Ashley K. Koegel, Yojiro Kotake, Gavin Grant, Hugo M. Horlings, Nilay Shah, Christopher Umbricht, Pei Wang, Yu Wang, Benjamin Kong, Anita Langerod, Seung K. Kim, Marc van de Vijver, Saraswani Sukumar, Michael L. Whitfield, Manolis Kellis, Yue Xiong, David J. Wong and Howard Y. Chang
  • Journal Title: Nature Genetics Volume: 43(7) Pages: 621-629
• [Journal Article] p53 binds to and is required for the repression of Arf tumor suppressor by HDAC and Polycomb (2011)
  • Author(s): Yaxue Zeng, Yojiro Kotake, Xin-Hai Pei, Matthew Smith and Yue Xiong
  • Journal Title: Cancer Research Volume: 71 Pages: 2781-2792
• [Journal Article] 長鎖ノンコーディングRNAと細胞老化 (2011)
  • Author(s): 神武洋二郎、北川雅敏
  • Journal Title: 細胞工学 Volume: Vol.30. No.7 Pages: 729-733
• [Journal Article] 長鎖ncRNAによるクロマチン修飾因子のリクルートメント機構 (2011)
  • Author(s): 神武洋二郎、北川雅敏
  • Journal Title: 実験医学 Volume: Vol.29. No.11 Pages: 1716-1721
• [Journal Article] Long non-coding RNA ANEIL is required for the PRC2 recruitment to and silencing of p15^<INK4B> tumor suppressor gene (2011)
  • Author(s): Kotake Y., et.al
  • Journal Title: Oncogene Volume: 30 Pages: 1956-1962
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 長鎖ncRNAによるクロマチン修飾因子のリクルートメント機構 (2011)
  • Author(s): 神武洋二郎・北川雅敏
  • Journal Title: 実験医学 Volume: 29 Pages: 1716-1721
• [Journal Article] 長鎖ノンコーディングRNAと細胞老化 (2011)
  • Author(s): 神武洋二郎・北川雅敏
  • Journal Title: 細胞工学 Volume: 30 Pages: 729-733
• [Journal Article] GSK3 regulates the expressions of human and mouse c-Myb via different mechanisms (2010)
  • Author(s): Kyoko Kitagawa, Yojiro Kotake, Yoshihiro Hiramatsu, Ning Liu, Sayuri Suzuki, Satoki Nakamura, Akira Kikuchi and Masatoshi Kitagawa
  • Journal Title: Cell Division Volume: 5 Pages: 27-27
  • NAID: 120005305355
• [Journal Article] NFAT5 regulates transcription of the mouse telomerase reverse transcriptase gene (2010)
  • Author(s): Tsukasa Fujiki, Miyako Udono, Yojiro Kotake, Makiko Yamashita, Sanetaka Shirahata and Yoshinori Katakura
  • Journal Title: Experimental Cell Research Volume: 316(20) Pages: 3342-3350
• [Journal Article] NFAT5 regulates transcription of the mouse telomerase reverse transcriptase gene. (2010)
  • Author(s): Fujiki T, et.al.
  • Journal Title: Experimental Cell Research. Volume: 316(20) Pages: 3342-3350
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] GSK3 regulates the expressions of human and mouse c-Myb via different mechanisms. (2010)
  • Author(s): Kitagawa K, et.al.
  • Journal Title: Cell Division Volume: 5:27 Pages: 1-10
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 長鎖ノンコーディングRNA ANRILによる癌抑制遺伝子p15/p16の転写制御機構 (2012)
  • Author(s): 神武洋二郎
  • Organizer: 第6回浜松医科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 浜松
  • Year and Date: 2012-02-24
• [Presentation] 長鎖ノンコーディングRNA ANRILによる癌抑制遺伝子p15p16の転写制御機構 (2012)
  • Author(s): 神武洋二郎
  • Organizer: 浜松医科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 浜松
  • Year and Date: 2012-02-24
• [Presentation] Masatoshi Kitagawa The epigenetic regulation of INK4 locus by Polycomb and long noncoding RNA (2011)
  • Author(s): Yojiro Kotake, Tadashi Nakagawa, Kyoko Kitagawa, Sayuri Suzuki, Ning Liu, Hiroyuki Niida, Yue Xiong
  • Organizer: ANRIL第34回日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] Long noncoding RNA ANRIL represses the INK4 locus via polycomb recruitment (2011)
  • Author(s): Yojiro Kotake, Kyoko Kitagawa, Hiroyuki Niida and Masatoshi Kitagawa
  • Organizer: 第70回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] 慢性進行性腎障害におけるNF-kB経路によるSkp2およびCks1の発現亢進 (2011)
  • Author(s): 鈴木小由里、深澤洋敬、三崎太郎、戸川証、北川恭子、神武洋二郎、丹伊田浩行、菱田明、山本龍夫、北川雅敏
  • Organizer: 第84回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] 長鎖ノンコーディングRNA ANRILによるポリコームリクルートメントを介したINK4 locus転写抑制機構 (2011)
  • Author(s): 神武洋二郎、中川直、北川恭子、鈴木小由里、劉寧、丹伊田浩行、Yue Xiong、北川雅敏
  • Organizer: 第84回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] Long non-coding RNA ANRIL negatively regulates cell prolifereation via silencing of INK4 locus (2011)
  • Author(s): 北川雅敏、神武洋二郎
  • Organizer: 第63回日本細胞生物学会大会
  • Place of Presentation: 札幌
• [Presentation] Long non-coding RNA ANRIL is required for the Polycomb recruitment to and silencing of INK4 locus (2011)
  • Author(s): Yojiro Kotake, Tadashi Nakagawa, Kyoko Kitagawa, Hiroyuki Niida, Yue Xiong and Masatoshi Kitagawa
  • Organizer: Sixteenth Annual Meeting of the RNA Society
  • Place of Presentation: Kyoto
• [Presentation] 長鎖ノンコーディングRNAによるINK4 locus制御機構 (2011)
  • Author(s): 神武洋二郎、中川直、北川恭子、丹伊田浩行、Yue Xiong、北川雅敏
  • Organizer: 第5回日本エピジェネティクス研究会年会
  • Place of Presentation: 熊本
• [Presentation] 長鎖ノンコーディングRNAによるINK4 locus制御機構 (2011)
  • Author(s): 神武洋二郎, 他
  • Organizer: 日本エピジェネティクス研究会
  • Place of Presentation: 熊本
• [Presentation] Long non-coding RNA ANRIL is required for the Polycomb recruitment to and silencing of INK4 locus (2011)
  • Author(s): Kotake Y, et.al
  • Organizer: RNA Society
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] 長鎖ノンコーディングRNA ANRILはINK4 locusの転写抑制を介し細胞増殖を制御する (2011)
  • Author(s): 北川雅敏, 他
  • Organizer: 日本細胞生物学会
  • Place of Presentation: 札幌
• [Presentation] 長鎖ノンコーディングENA ANRILによるポリコームリクルートメントを介したINK4 locus転写抑制機構 (2011)
  • Author(s): 神武洋二郎, 他
  • Organizer: 日本生化学会
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] 慢性進行性腎障害におけるNF-kB経路によるSkp2およびCks1の発現亢進 (2011)
  • Author(s): 鈴木小由里, 他
  • Organizer: 日本生化学会
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] Long noncoding RNA ANRIL represses the INK4 locus via polycomb recruitment (2011)
  • Author(s): 神武洋二郎, 他
  • Organizer: 日本癌学会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] Polycomb/noncoding RNAによる癌抑制遺伝子p16転写制御機構の解明 (2010)
  • Author(s): 神武洋二郎
  • Organizer: 第2回浜松医科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 浜松
  • Year and Date: 2010-12-17
• [Presentation] Polycomb/noncoding RNAによる癌抑制遺伝子p16転写制御機構の解明 (2010)
  • Author(s): 神武洋二郎
  • Organizer: 浜松医科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 浜松
  • Year and Date: 2010-12-17
• [Presentation] 癌抑制遺伝子産物Mig-6のリン酸化とその責任酵素の解析 (2010)
  • Author(s): Ning Liu、北川恭子、神武洋二郎、丹伊田浩行、北川雅敏
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会/第83回日本生化学大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] 慢性進行性腎障害におけるCks1およびSkp2の発現亢進の意義 (2010)
  • Author(s): 鈴木小由里、深澤洋敬、三崎太郎、戸川証、北川恭子、神武洋二郎、山本龍夫、北川雅敏
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会/第83回日本生化学大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] GSK3によるc-Mybの量的制御機構 (2010)
  • Author(s): 北川恭子、神武洋二郎、北川雅敏
  • Organizer: 日本分子生物学会・日本生化学会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] CUL4-DDB1/MLL complex activates the p16 transcription through histone H3K4 methylation (2010)
  • Author(s): 神武洋二郎、Yue Xiong、北川恭子、北川雅敏
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会/第83回日本生化学大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] The epigenetic regulation of INK4 locus by Polycomb and noncoding RNA (2010)
  • Author(s): Yojiro Kotake, Kyoko Kitagawa, Tadashi Nakagawa T, Yue Xiong and Masatoshi Kitagawa
  • Organizer: International Symposium on Epigenome Network, Development and Reprogramming of Germ Cells
  • Place of Presentation: Fukuoka
• [Presentation] c-Mybの量的制御機構におけるGSK3の関与 (2010)
  • Author(s): 北川恭子、神武洋二郎、北川雅敏
  • Organizer: 第69回日本癌学会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] CUL4A-DDB1 ubiquitin ligase and MLL histone methyltransferase are required for the oncogene-induced p16^<INK4a> activation (2010)
  • Author(s): 神武洋二郎、北川恭子、北川雅敏
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] CUL4A-DDB1 ubiquitin ligase and MLL histon methyltransferase are required for the oncogene-induced p16^<INK4a> activation. (2010)
  • Author(s): 神武洋二郎, 他
  • Organizer: 日本癌学会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] c-Mybの量的制御機構におけるGSK3の関与 (2010)
  • Author(s): 北川恭子, 他
  • Organizer: 日本癌学会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] CUL4-DDB1/MLL complex activates the p16 transcription through histone H3K4 methylation (2010)
  • Author(s): 神武洋二郎, 他
  • Organizer: 日本分子生物学会・日本生化学会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] The epigenetic regulation of INK4 locus by Polycomb and noncoding RNA (2010)
  • Author(s): 神武洋二郎, 他
  • Organizer: International Symposium on Epigenome Network, Development and Reprogramming of Germ Cells
  • Place of Presentation: 福岡
• [Remarks]
  • URL: http://www2.hama-med.ac.jp/w1a/bio1/index-j.html
• [Remarks]
  • URL: http://www2.hama-med.ac.jp/wla/biol/index-j.html
• [Remarks]
  • URL: http://www2.hama-med.ac.jp/w1a/bio1/index-j.html