Creation of artificial clock proteins to induce rhythmic gene expression

• Project/Area Number: 22710213
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Living organism molecular science
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: IMANISHI Miki 京都大学, 化学研究所, 助教 (80362391)
• Project Period (FY): 2010 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000); Fiscal Year 2011: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000); Fiscal Year 2010: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
• Keywords: 遺伝子発現 / ジンクフィンガー / 人工転写因子 / タンパク質デザイン / 概日時計

Research Abstract

An artificial zinc finger transcription factor targeting a core clock gene was designed and it successfully changed the circadian time. A simple system to manipulate gene expression patterns to be circadian was also constructed using a zinc finger motif. These artificial proteins would be useful for elucidating the mechanism of rhythmic gene expression and for manipulating gene expression.

Research Products

• [Journal Article] Construction of a rhythm transfer system that mimics the cellular clock (2012)
  • Author(s): Miki Imanishi, Kazutoshi Yamamoto, Hiroyuki Yamada, Yuka Hirose, Hitoshi Okamura, and Shiroh Futaki
  • Journal Title: ACS Chem. Biol Volume: 7 Issue: 11 Pages: 1817-1821
  • DOI: 10.1021/cb300432s
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Design of artificial DNA binding proteins toward control and elucidation of cellular functions (2012)
  • Author(s): Miki Imanishi
  • Journal Title: Yakugaku Zasshi Volume: 132 Pages: 1431-1436
  • NAID: 130002489524
  • URL: https://www.jstage.jst.go.jp/article/yakushi/132/12/132_12-00228/_article
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Control of circadian phase by an artificial zinc finger transcription regulator (2011)
  • Author(s): Miki Imanishi, Atsushi Nakamura, Masao Doi, Shiroh Futaki, and Hitoshi Okamura
  • Journal Title: Angew. Chem. Int. Ed Volume: 50 Issue: 40 Pages: 9396-9399
  • DOI: 10.1002/anie.201103307
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ジンクフィンガー型人工転写因子の創製と細胞機能の制御 (2012)
  • Author(s): 今西未来
  • Organizer: 日本薬学会第132年会
  • Place of Presentation: 北海道大学(札幌市)
  • Year and Date: 2012-03-29
• [Presentation] Circadian rhythmic gene expression induced by artificial clock proteins (2011)
  • Author(s): Kazutoshi Yamamoto, Miki Imanishi, Hitoshi Okamura, and Shiroh Futaki
  • Organizer: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
  • Place of Presentation: 北海道大学(札幌市)
  • Year and Date: 2011-11-10
• [Presentation] 人工時計タンパク質を用いた周期的遺伝子発現システムの構築 (2011)
  • Author(s): 山本和俊、今西未来、岡村 均、二木史朗
  • Organizer: 第61回日本薬学会近畿支部大会
  • Place of Presentation: 神戸学院大学(神戸市)
  • Year and Date: 2011-10-22
• [Presentation] 人工時計タンパク質によるリズミックな遺伝子発現の誘起 (2011)
  • Author(s): 今西未来、山本和俊、岡村 均、二木史朗
  • Organizer: 第5回バイオ関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: つくば国際会議場エポカルつくば(つくば市)
  • Year and Date: 2011-09-14
• [Presentation] ジンクフィンガー型人工転写因子を用いた細胞時計の制御 (2011)
  • Author(s): 今西未来、中村篤史、岡村 均、二木史朗
  • Organizer: 日本ケミカルバイオロジー学会第6回年会
  • Place of Presentation: 東京工業大学大岡山キャンパス(東京都)
  • Year and Date: 2011-05-25
• [Presentation] ジンクフィンガーモチーフを用いた新規DNA 結合タンパク質の創製 (2011)
  • Author(s): 今西未来
  • Organizer: 日本薬学会第131年会
  • Place of Presentation: 静岡市
  • Year and Date: 2011-03-30
• [Presentation] ジンクフィンガーモチーフを用いた新規DNA結合タンパク質の創製 (2011)
  • Author(s): 今西未来
  • Organizer: 日本薬学会第131年会
  • Place of Presentation: 静岡市(招待講演 ただし開催中止(発表は成立))
  • Year and Date: 2011-03-30
• [Presentation] Creation of artificial DNA binding proteins based on properties of a C2H2 zinc finger motif (2011)
  • Author(s): Miki Imanishi
  • Organizer: 日本農芸化学会2011年度大会
  • Place of Presentation: 京都女子大学(京都市)
  • Year and Date: 2011-03-28
• [Presentation] Creation of artificial DNA binding proteins based on properties of a C2H2 zinc finger motif (2011)
  • Author(s): Imanishi M
  • Organizer: 日本農芸化学会2011年度大会
  • Place of Presentation: 京都市(招待講演 ただし開催中止(発表は成立))
  • Year and Date: 2011-03-28
• [Presentation] Design of artificial clock proteins (2010)
  • Author(s): Miki Imanishi, Kazutoshi Yamamoto, and Shiroh Futaki
  • Organizer: 2010環太平洋国際化学会議
  • Place of Presentation: Honolulu, Hawaii (USA)
  • Year and Date: 2010-12-18
• [Presentation] 亜鉛フィンガー型人工転写因子を用いた細胞時計制御 (2010)
  • Author(s): 今西未来、中村篤史、土居雅夫、二木史朗、岡村均
  • Organizer: 第17回日本時間生物学会学術大会
  • Place of Presentation: 早稲田大学(東京都)
  • Year and Date: 2010-11-20
• [Presentation] 亜鉛フィンガー型人工転写因子を用いた細胞時計制御 (2010)
  • Author(s): 今西未来、中村篤史、土居雅夫、二木史朗、岡村均
  • Organizer: 第17回日本時間生物学会学術大会
  • Place of Presentation: 東京都(招待講演)
  • Year and Date: 2010-11-20
• [Presentation] ゲノムレベルでの時計遺伝子プロモーター解析を目指した亜鉛フィンガー型人工転写因子の創製とその機能 (2010)
  • Author(s): 中村篤史、今西未来、土 居 雅 夫 、岡 村 均 、二木史朗
  • Organizer: 日本ケミカルバイオロジー学会第5年会
  • Place of Presentation: 慶応大学日吉キャンパス(横浜市)
  • Year and Date: 2010-05-10
• [Presentation] ゲノムレベルでの時計遺伝子プロモーター解析を目指した亜鉛フィンガー型人工転写因子の創製とその機能 (2010)
  • Author(s): 中村篤史、今西未来、土居雅夫、岡村均、二木史朗
  • Organizer: 日本ケミカルバイオロジー学会第5年会
  • Place of Presentation: 横浜市
  • Year and Date: 2010-05-10
• [Presentation] ジンクフィンガー型人工転写因子を用いた細胞時計の制御
  • Author(s): 今西未来
  • Organizer: 日本ケミカルバイオロジー学会第6回年会
  • Place of Presentation: 東京工業大学大岡山キャンパス（東京都）
• [Presentation] 人工時計タンパク質によるリズミックな遺伝子発現の誘起
  • Author(s): 今西未来
  • Organizer: 第５回バイオ関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（つくば市）
• [Presentation] 人工時計タンパク質を用いた周期的遺伝子発現システムの構築
  • Author(s): 山本 和俊
  • Organizer: 第61回日本薬学会近畿支部大会
  • Place of Presentation: 神戸学院大学（神戸市）
• [Presentation] Circadian Rhythmic Gene Expression Induced by Artificial Clock Proteins
  • Author(s): YAMAMOTO, K.
  • Organizer: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
  • Place of Presentation: 北海道大学（札幌市）
• [Presentation] ジンクフィンガー型人工転写因子の創製と細胞機能の制御
  • Author(s): 今西未来
  • Organizer: 日本薬学会第132年回年会
  • Place of Presentation: 北海道大学（札幌市）
  • Invited
• [Remarks]
  • URL: http://www.scl.kyoto-u.ac.jp/~bfdc/index.html