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Detection of the direct interaction between bioactive small molecule and its target protein using photoreactive amino acid

Research Project

Project/Area Number 22710227
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Living organism molecular science
Research InstitutionMicrobial Chemistry Research Foundation

Principal Investigator

NAKAE Koichi  公益財団法人微生物化学研究会, 微生物化学研究所, 研究員 (20390776)

Project Period (FY) 2010 – 2012
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2012: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2011: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsケミカルバイオロジー
Research Abstract

The analysis of the biological mechanism of small bioactive molecules in cells contributes to not only the basic research but also drug discovery research. For analyzing the mechanism of bioactive molecules, one of their approaches is to detect the direct interaction between small molecules and its target protein. Although this approach is quite effective and conduced breakthrough results, success probability is still not enough. In this research, in addition to the existing technique, it aims to provide one of the alternative methods for the direct detection technique. In detail, after preparing the cells incorporated the photoreactive amino acids in their protein and bioactive molecules attached to detecting moiety, we mixed these materials and induced covalent cross-linking between bioactive molecule and its target protein by radiating ultraviolet. Finally this approach appeared to improve the detection sensitivity.

Report

(4 results)
  • 2012 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2013 2012 2011 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] NAD(P)H quinone oxidoreductase 1 (NQO1)-bioactivated pronqodine A regulates prostaglandin release from human synovial sarcoma cells2013

    • Author(s)
      Nakae K, Adachi H, Sawa R, Hosokawa N, Hatano M, Igarashi M, Nishimura Y, Akamatsu Y and Nomoto A
    • Journal Title

      J. Natural Products

      Volume: 76 Issue: 4 Pages: 510-515

    • DOI

      10.1021/np300643f

    • Related Report
      2012 Annual Research Report 2012 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sacchathridine A, a prostaglandin release inhibitor from Saccharothrix sp2013

    • Author(s)
      Nakae K, Kurata I, Kojima F, Igarashi M, Hatano M, Sawa R, Kubota Y, Adachi H, Nomoto A
    • Journal Title

      J. Natural Products

      Volume: 76 Issue: 4 Pages: 720-722

    • DOI

      10.1021/np3006327

    • Related Report
      2012 Annual Research Report 2012 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 放 線菌代謝産物から得られた新規プロスタ グランジン放出阻害物質pronqoline に 関する研究2013

    • Author(s)
      中栄功一、倉田育子、細川信夫、波多野 和樹、五十嵐雅之、久保田由美子、澤 竜 一、西村吉雄、安達勇光、野本明男
    • Organizer
      日本農芸化学会2013 年度大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2013-03-25
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 放線菌代謝 産物から得られた新規プロスタグランジ ン放出阻害物質sacchathridine A に関す る研究2013

    • Author(s)
      中栄功一、倉田育子、小島蕗子、五十嵐 雅之、波多野和樹、澤 竜一、久保田由 美子、安達勇光、野本明男
    • Organizer
      日本農芸化学会2012 年度大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2013-03-23
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 新規天然化合物pronqodine A は生 体内のNQO1 により活性化され、プロスタ グランジンの産生を抑制する2012

    • Author(s)
      中栄功一、安達勇光、細川信夫、五十嵐 雅之、波多野和樹、 澤竜一、久保田由美 子、倉田育子、西村吉雄、赤松穰、野本 明男
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第7回年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2012-06-08
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 放線菌代謝産物から得られた新規プロスタグランジン放出阻害物質sacchathridine Aに関する研究2012

    • Author(s)
      中栄功一、倉田育子、小島蕗子、五十嵐雅之、波多野和樹、澤竜一、久保田由美子、安達勇光、野本明男
    • Organizer
      日本農芸化学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      京都(京都女子大学)
    • Year and Date
      2012-03-23
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 放線菌代謝産物から 得られた新規プロスタグランジン放出阻 害物質pronqodine A に関する研究2011

    • Author(s)
      中栄功一、細川信夫、小島蕗子、五十嵐 雅之、木下直子、澤 竜一、久保田由美子、 増田 徹、大庭俊一、安達勇光、西村吉雄、 赤松 穰、野本明男
    • Organizer
      日本農芸化学会2011 年度大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2011-03-26
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 放線菌代謝産物から得られた新規プロスタグランジン放出阻害物質pronqodine Aに関する研究2011

    • Author(s)
      中栄功一
    • Organizer
      日本農芸化学会 2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2011-03-26
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 新規天然化合物pronqodine Aは生体内のNQO1により活性化され、プロスタグランジンの産生を抑制する

    • Author(s)
      中栄功一、安達勇光、細川信夫、五十嵐雅之、波多野和樹、 澤竜一、久保田由美子、倉田育子、西村吉雄、赤松穰、野本明男
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第7回年会
    • Place of Presentation
      京都大学百周年時計台記念館百周年記念ホール (京都)
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 放線菌代謝産物から得られた新規プロスタグランジン放出阻害物質pronqolineに関する研究

    • Author(s)
      中栄功一、倉田育子、細川信夫、波多野和樹、五十嵐雅之、久保田由美子、澤 竜一、西村吉雄、安達勇光、野本明男
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学 川内北キャンパス(宮城)
    • Related Report
      2012 Annual Research Report

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Published: 2010-11-30   Modified: 2019-07-29  

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