A new method for high-throughput screening of enzymes using microbial sensor

• Project/Area Number: 22780081
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Applied microbiology
• Research Institution: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• Principal Investigator: UCHIYAMA Taku 独立行政法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 研究員 (70450658)
• Project Period (FY): 2010 – 2011
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2011)
• Budget Amount: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000); Fiscal Year 2011: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2010: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: メタゲノム / バイオテクノロジー / 微生物センサー / ゲルマイクロドロップ / 酵素 / 転写制御因子 / 有用微生物スクリーニング / ハイスループットスクリーニング / フローサイトメーター / 産業用酵素

Research Abstract

The study developed a new method for high-throughput screening of enzyme activity in bacteria by combing PIGEX method, flow cytometry and gel micro droplet. The method which allows viable microbial cells to be sorted on the basis of the expressed enzyme activity. The potential of the method was demonstrated by selecting benzoamidase positive cells from an artificial mixture of benzoamidase positive and negative E. coli.

Research Products

• [Journal Article] メタゲノムからの未知遺伝子スクリーニング法 (2011)
  • Author(s): 内山拓
  • Journal Title: 土と微生物 Volume: Vol.65 Pages: 73-77
• [Journal Article] Product induced gene expression, a product responsive reporter assay used to screen metagenomic libraries for enzyme encoding genes (2010)
  • Author(s): 内山拓、宮崎健太郎
  • Journal Title: Applied and Environmental Microbiology Volume: Vol.76 Pages: 7029-7035
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Product-induced gene expression, a product-responsive reporter assay used to screen metagenomic libraries for enzyme-encoding genes. (2010)
  • Author(s): 内山拓、宮崎健太郎
  • Journal Title: Applied and Environmental Microbiology Volume: 76 Pages: 7029-7035
  • Peer Reviewed
• [Presentation] PIGEX法のハイスループット化の検討 (2011)
  • Author(s): 内山拓、宮崎健太郎
  • Organizer: 第63回日本生物工学会大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2011-09-27
• [Presentation] PIGEX法のハイスループット化の検討 (2011)
  • Author(s): 内山拓、宮崎健太郎
  • Organizer: 第63回日本生物工学会大会
  • Place of Presentation: 東京都、東京農工大学
  • Year and Date: 2011-09-27
• [Presentation] PIGEX法のさらなるハイスループット化の検討 (2011)
  • Author(s): 内山拓、宮崎健太郎
  • Organizer: 日本農芸化学会2011年度大会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2011-03-28
• [Presentation] メタゲノムからの有用遺伝子取得法の開発 (2011)
  • Author(s): 内山拓
  • Organizer: LS-BT合同研究発表会
  • Place of Presentation: つくば
  • Year and Date: 2011-02-01
• [Presentation] メタゲノムからの未利用遺伝子資源の探索 (2010)
  • Author(s): 内山拓
  • Organizer: 第5回産業用酵素シンポジウム
  • Place of Presentation: 長浜
  • Year and Date: 2010-11-06
• [Presentation] PIGEX(Product Induced Gene Expression):微生物センサーを利用した酵素遺伝子スクリーニング法の開発 (2010)
  • Author(s): 内山拓、宮崎健太郎
  • Organizer: 第62回日本生物工学会大会
  • Place of Presentation: 宮崎
  • Year and Date: 2010-10-28
• [Presentation] PIGEX (Product-Induced Gene Expression):微生物センサーを利用した酵素遺伝子スクリーニング法の開発 (2010)
  • Author(s): 内山拓、宮崎健太郎
  • Organizer: 第62回日本生物工学会大会
  • Place of Presentation: 宮崎
  • Year and Date: 2010-10-28
• [Presentation] メタゲノムを活用した有用酵素の開発 (2010)
  • Author(s): 内山拓
  • Organizer: 平成22年度産学官連携推進会議
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2010-06-05
• [Book] Metagenomics ; Methods in Molecular Biology, Substrate-induced gene expression(SIGEX) screening ; a method for high-throughput screening of metagenome libraries (2010)
  • Author(s): 内山拓、宮崎健太郎
  • Publisher: Springer
• [Book] 難培養微生物研究の最新技術II.ゲノム解析を中心とした最前線と将来展望.、SIGEX :メタゲノムからのハイスループットな代謝系遺伝子スクリーニング法 (2010)
  • Author(s): 内山拓
  • Publisher: シーエムシー出版
• [Book] 難培養微生物研究の最新技術II～ゲノム解析を中心とした最前線と将来展望～、SIGEX:メタゲノムからのハイスループットな代謝系遺伝子スクリーニング法 (2010)
  • Author(s): 内山拓
  • Total Pages: 287
  • Publisher: シーエムシー出版
• [Book] Metagenomics : Methods in Molecular Biology, Substrate-induced gene expression (SIGEX) screening a method for high-throughput screening of metagenome libraries. (2010)
  • Author(s): 内山拓、宮崎健太郎
  • Total Pages: 341
  • Publisher: Springer
• [Remarks]
  • URL: http://staff.aist.go.jp/miyazaki-kentaro/group/uchiyama.html