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Comprehensive screening of gene expression pattern as indicator of stress diagnosis in leaf photosynthesis

Research Project

Project/Area Number 22780135
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Forest science
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

SAITO Hideyuki  北海道大学, 大学院・農学研究院, 講師 (70312395)

Project Period (FY) 2010 – 2011
Project Status Completed (Fiscal Year 2011)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2011: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2010: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywords遺伝子発現 / 機能ゲノム学 / ゲノム生物学的情報 / ストレス診断 / DNAマイクロアレイ / ブナ / ゲノム生理生態学 / 土壌乾燥ストレス / マクロアレイ
Research Abstract

We generated 355, 845, 739 sequence from a full-length enriched cDNA library of beech(Fagus crenata) leaves by using 454 next generation sequencer. The DNA microarray for analysis of gene expression of beech leaves was developed, 12, 446 annotated genes and 31, 357 non-annotated genes. The high temperature-, drought-and acidification(H_2O_2)-specific gene expression patterns were found. The soil-drought intensity-and its history-dependent gene expression pattern related to photosynthetic reduction were found. These results suggested that transcriptome analysis will became promising method that provides useful indicators for diagnosis of health and stress of beech leaves.

Report

(3 results)
  • 2011 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2012 2011 2010

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (12 results)

  • [Journal Article] ブナ林のたどっている道-分布域北限の動向-2012

    • Author(s)
      斎藤秀之
    • Journal Title

      北方林業

      Volume: 64巻(2) Pages: 38-41

    • Related Report
      2011 Annual Research Report 2011 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ブナのDNAマイクロアレイの開発2011

    • Author(s)
      斎藤秀之、瀬々潤、清水(稲継)理恵、神村章子、山田宰靖、清水健太郎
    • Journal Title

      北海道の林木育種

      Volume: 54巻(2) Pages: 11-14

    • NAID

      40019244788

    • Related Report
      2011 Final Research Report
  • [Journal Article] ブナのDNAマイクロアレイの開発2011

    • Author(s)
      斎藤秀之・瀬々潤・清水(稲継)理恵・神村章子・山田宰靖・清水健太郎
    • Journal Title

      北海道の林木育種

      Volume: 54(2) Pages: 11-14

    • NAID

      40019244788

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 土壌水分変動がブナ苗木の葉の遺伝子発現に与える影響のゲノム網羅的解析2012

    • Author(s)
      斎藤秀之、石堂光、神村章子、瀬々潤、清水(稲継)理恵、清水健太郎
    • Organizer
      第123回日本森林学会
    • Place of Presentation
      宇都宮大学(宇都宮市)
    • Year and Date
      2012-03-28
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      2011 Annual Research Report 2011 Final Research Report
  • [Presentation] ブナにおける花芽形成の日長誘導経路に関わる遺伝子群の発現特性2012

    • Author(s)
      小倉俊治、斎藤秀之、門松昌彦、渋谷正人、小池孝良
    • Organizer
      第123回日本森林学会
    • Place of Presentation
      宇都宮大学(宇都宮市)
    • Year and Date
      2012-03-28
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  • [Presentation] ブナ林の遺伝子診断による環境ストレス評価2012

    • Author(s)
      斎藤秀之
    • Organizer
      富士山の自然環境保全に関するワークショップ2012
    • Place of Presentation
      静岡県環境衛生科学研究所(静岡市)
    • Year and Date
      2012-03-26
    • Related Report
      2011 Annual Research Report 2011 Final Research Report
  • [Presentation] ブナの遺伝子発現情報を用いたストレス診断技術の開発に向けて-コンセプトと診断指標性のある遺伝子の探索-ワークショップ2012

    • Author(s)
      斎藤秀之
    • Organizer
      ブナ林生態系における生物・環境モニタリングシステムの構築
    • Place of Presentation
      国立環境研究所(つくば市)
    • Year and Date
      2012-03-11
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      2011 Final Research Report
  • [Presentation] ブナの遺伝子発現情報を用いたストレス診断技術の開発に向けて-コンセプトと診断指標性のある遺伝子の探索-2012

    • Author(s)
      斎藤秀之
    • Organizer
      ワークショップ「ブナ林生態系における生物・環境モニタリングシステムの構築」
    • Place of Presentation
      国立環境研究所(つくば市)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-11
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  • [Presentation] ブナ林の衰退現象と樹木のストレス評価について-遺伝子発現情報を用いたストレス診断技術の開発-2012

    • Author(s)
      斎藤秀之
    • Organizer
      神奈川県研究人材活性化のための講演会
    • Place of Presentation
      神奈川県自然環境保全センター(厚木市)
    • Year and Date
      2012-02-21
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  • [Presentation] ブナ林の衰退現象と樹木のストレス評価について-遺伝子発現情報を用いたストレス診断技術の開発-2012

    • Author(s)
      斎藤秀之
    • Organizer
      神奈川県研究人材活性化のための講演会
    • Place of Presentation
      神奈川県自然環境保全センター(厚木市)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-02-21
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  • [Presentation] ブナのDNAマイクロアレイの開発-遺伝子発現情報によるストレス診断技術にむけて-2011

    • Author(s)
      斎藤秀之、山田宰靖、神村章子、瀬々潤、福崎睦美、清水(稲継)理恵、清水健太郎
    • Organizer
      第60回北方森林学会
    • Place of Presentation
      札幌市コンベンションセンター(札幌市)
    • Year and Date
      2011-11-15
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      2011 Annual Research Report 2011 Final Research Report
  • [Presentation] ブナ葉の高温・乾燥・酸化ストレスに応答する発現遺伝子の網羅的探索2011

    • Author(s)
      斎藤秀之、山田宰靖、瀬々潤、福崎睦美、清水(稲継)理恵、清水健太郎
    • Organizer
      第122回日本森林学会
    • Place of Presentation
      静岡大学(静岡市)
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      2011 Final Research Report
  • [Presentation] ブナ葉の高温・乾燥・酸化ストレスに応答する発現遺伝子の網羅的探索2011

    • Author(s)
      斎藤秀之・山田宰靖・瀬々潤・福崎睦美・清水(稲継)理恵・清水健太郎
    • Organizer
      第122回日本森林学会
    • Place of Presentation
      静岡市,静岡大学
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 摩周湖における対流圏オゾン濃度とその植物影響について2010

    • Author(s)
      山口高志、龍田慎平、渡辺誠、渡邊忠、久保島康行、斎藤秀之、野口泉、小池孝良
    • Organizer
      第51回大気環境学
    • Place of Presentation
      大阪大学(豊中市)
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      2011 Final Research Report
  • [Presentation] 摩周湖における対流圏オゾン濃度とその植物影響について2010

    • Author(s)
      山口高志・龍田慎平・渡辺誠・渡邊忠・久保島康行・斎藤秀之・野口泉・小池孝良
    • Organizer
      第51回大気環境学
    • Place of Presentation
      豊中市,大阪大学
    • Related Report
      2010 Annual Research Report

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Published: 2010-08-23   Modified: 2016-04-21  

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