DNA methylation and endothelial cell-specific gene expression

• Project/Area Number: 22790066
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Biological pharmacy
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: OKADA Yoshiaki 大阪大学, 大学院・薬学研究科, 助教 (50444500)
• Project Period (FY): 2010 – 2011
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2011)
• Budget Amount: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2011: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000); Fiscal Year 2010: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
• Keywords: エピジェネティクス / DNAメチル化 / 遺伝子発現制御 / 血管内皮細胞 / Robo4遺伝子 / Robo4 / エビジェネティクス

Research Abstract

The CpG sites in the Robo4 proximal promoter is specifically non-methylated in endothelial cells(ECs) but not non-ECs. In this study we performed assays using DNA methyltransferase inhibitor, methylated reporter plasmids, and ES cell lines containing mutant promoters, and demonstrated that cell-type-specific DNA methylation of the 11 CpG sites in the proximal promoter regulates EC-specific Robo4 gene expression.

Research Products

• [Journal Article] Embryonic stem cell differentiation system for evaluating gene functions involved in physiological megakaryocytic differentiation (2012)
  • Author(s): Okada Y, Yonekura M, Watanabe M, Nakai T, Wakimura A, Shimizu M, Kamikawa Y, Kitayama M, Kitajima K, Aird WC, Doi T
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun Volume: Vol.419 Pages: 477-481
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Embryonic stem cell differentiation system for evaluating gene functions involved in physiological megakaryocytic differentiation (2012)
  • Author(s): Okada Yoshiaki
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun Volume: 419 Issue: 3 Pages: 477-481
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.02.021
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Multiple ETS Family Proteins Regulate PF4 Gene Expression by Binding to the Same ETS Binding Site (2011)
  • Author(s): Okada Y, Nobori H, Shimizu M, Watanabe M, Yonekura M, Nakai T, Kamikawa Y, Wakimura A, Funahashi N, Naruse H, Watanabe A, Yamasaki D, Fukada S, Yasui K, Matsumoto K, Sato T, Kitajima K, Nakano T, Aird WC, Doi T
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: Vol.9
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] New Protein Purification System Using Gold-Magnetic Beads and a Novel Peptide Tag," the Methionine Tag" (2011)
  • Author(s): Okada Y, Takano TY, Kobayashi N, Hayashi A, Yonekura M, Nishiyama Y, Abe T, Yoshida T, Yamamoto TA, Seino S, Doi T
  • Journal Title: Bioconjugate Chemistry Volume: Vol.22 Pages: 887-893
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Vascular bed specific regulation of the von Willebrand factor promoter in the heart and skeletal muscle (2011)
  • Author(s): Liu J, Yuan L, Molema G, Regan E, Janes L, Beeler D, Spokes KC, Okada Y, Minami T, Oettgen P, Aird WC
  • Journal Title: Blood Volume: Vol.117 Pages: 342-361
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Multiple ETS Family Proteins Regulate PF4 Gene Expression by Binding to the Same ETS Binding Site (2011)
  • Author(s): Okada Yoshiaki
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: 6(9) Issue: 9 Pages: e24837-e24837
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0024837
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] New Protein Purification System Using Gold-Magnetic Beads and a Novel Peptide Tag, "the Methionine Tag" (2011)
  • Author(s): Okada Yoshiaki
  • Journal Title: Bioconjugate Chemistry Volume: 22(5) Issue: 5 Pages: 887-93
  • DOI: 10.1021/bc100429d
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Vascular bed specific regulation of the von Willebrand factor promoter in the heart and skeletal muscle (2011)
  • Author(s): Ju Liu, Yoshiaki Okada
  • Journal Title: Blood Volume: 117 Pages: 342-361
  • Peer Reviewed
• [Presentation] DNAメチル化によるRobo4遺伝子の組織特異的発現の制御 (2011)
  • Author(s): 岡田欣晃、西山侑児、鈴木綾乃、酒井美貴、舟橋伸昭、加納義浩、成瀬啓樹、William Aird、土井健史
  • Organizer: 第61回日本薬学会近畿支部総会・大会
  • Place of Presentation: 神戸学院大学
  • Year and Date: 2011-10-22
• [Presentation] DNAメチル化によるRobo4遺伝子の組織特異的発現の制御 (2011)
  • Author(s): 岡田欣晃
  • Organizer: 第61回日本薬学会近畿支部総会・大会
  • Place of Presentation: 神戸学院大学(神戸)
  • Year and Date: 2011-10-22
• [Presentation] Protein purification system using magnetic beads modified with gold nanoparticles (2011)
  • Author(s): Seino S, Okada Y, Takano TY, Doi T, Koga Y, Takashi Nakagawa T, Yamamoto TA
  • Organizer: 第35回日本磁気学会学術講演会(日本磁気学会国際シンポジウム)
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ
  • Year and Date: 2011-09-28
• [Presentation] DNAメチル化はRobo4遺伝子を血管内皮細胞特異的に発現させる (2011)
  • Author(s): 岡田欣晃、舟橋伸昭、加納義浩、西山侑児、成瀬啓樹、鈴木綾乃、William Aird、土井健史
  • Organizer: 第5回日本エピジェネティクス研究会年会
  • Place of Presentation: KKRホテル熊本
  • Year and Date: 2011-05-19
• [Presentation] DNAメチル化はRobo4遺伝子を血管内皮細胞特異的に発現させる (2011)
  • Author(s): 岡田欣晃
  • Organizer: 第5回日本エピジェネティクス研究会年会
  • Place of Presentation: KKRホテル熊本(熊本)
  • Year and Date: 2011-05-19
• [Presentation] 血管内皮細胞特異的に発現するRobo4遺伝子の発現は血管平滑筋細胞の共存により抑制される (2011)
  • Author(s): 鈴木綾乃, 成瀬啓樹, 舟橋伸昭, 西山侑児, 岡田欣晃, 土井健史
  • Organizer: 日本薬学会第131年会
  • Place of Presentation: ツインメッセ静岡
  • Year and Date: 2011-03-30
• [Presentation] Robo4遺伝子の血管内皮細胞特異的な発現を担うエピジェネティックな遺伝子発現制御メカニズム (2011)
  • Author(s): 西山侑児, 舟橋伸昭, 成瀬啓樹, 鈴木綾乃, 岡田欣晃, 土井健史
  • Organizer: 日本薬学会第131年会
  • Place of Presentation: ツインメッセ静岡
  • Year and Date: 2011-03-30
• [Presentation] 血小板第4因子遺伝子の-51ETSサイトを介した発現制御メカニズムについて (2011)
  • Author(s): 志水美己子, 神川悠子, 仲井友子, 渡邊美穂, 米倉正哲, 岡田欣晃, 土井健史
  • Organizer: 日本薬学会第131年会
  • Place of Presentation: ツインメッセ静岡
  • Year and Date: 2011-03-30
• [Presentation] Gold/ Iron-oxide composite nanoparticles as new type of magnetic nanocarrier for in-vivo and in-vitro applications (2010)
  • Author(s): Seino S, Koga Y, Mukai Y, Okada Y, Nakagawa T, Yamamoto TA., Doi T,Nakagawa Shinsaku
  • Organizer: Pacifichem2010
  • Place of Presentation: ホノルル
  • Year and Date: 2010-12-17
• [Presentation] 血小板系列特異的に特定の遺伝子を発現できるES細胞分化系の構築 (2010)
  • Author(s): 米倉正哲, 渡邊美穂, 仲井友子, 志水美己子, 神川悠子, 岡田欣晃, 土井健史
  • Organizer: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会合同大会)
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド
  • Year and Date: 2010-12-10
• [Presentation] 血小板分化における野生型および変異型RUNX1の機能について (2010)
  • Author(s): 仲井友子、渡邊美穂、米倉正哲、志水美己子、神川悠子、岡田欣晃、土井健史
  • Organizer: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会合同大会)
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド
  • Year and Date: 2010-12-10
• [Presentation] 血管新生関連因子Robo4の発現制御メカニズムの解析 (2010)
  • Author(s): 成瀬啓樹、蒋志侠、舟橋伸昭、志水美己子、鈴木綾乃、西山侑児、William Aird、岡田欣晃、土井健史
  • Organizer: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会合同大会)
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド
  • Year and Date: 2010-12-09
• [Presentation] 血管新生関連因子Robo4の発現制御メカニズムの解析 (2010)
  • Author(s): 成瀬啓樹
  • Organizer: BMB2010
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド
  • Year and Date: 2010-12-09
• [Presentation] 金/酸化鉄磁性複合ナノ粒子を用いたタンパク質の精製 (2010)
  • Author(s): 清野智史、澤祐司、中川貴、古賀雄一、岡田欣晃、土井健史、中川晋作、山本孝夫
  • Organizer: 第34回日本磁気学会学術講演会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場
  • Year and Date: 2010-09-04
• [Presentation] Robo4遺伝子が血管内皮細胞特異的に発現するメカニズムとは (2010)
  • Author(s): 岡田欣晃
  • Organizer: 第11回Pharmaco-Hematologyシンポジウム
  • Place of Presentation: 日本薬学会長井記念ホール
  • Year and Date: 2010-06-19
• [Presentation] Robo4遺伝子が血管内皮細胞特異的に発現するメカニズムとは? (2010)
  • Author(s): 岡田欣晃
  • Organizer: 第11回Pharmaco-Hematologyシンポジウム
  • Place of Presentation: 日本薬学会長井記念ホール
  • Year and Date: 2010-06-19
• [Remarks]
  • URL: http://www.phs.osaka-u.ac.jp/homepage/b018/
• [Remarks]
• [Remarks]
  • URL: http://www.phs.osaka-u.ac.jp/homepage/b018/index.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.phs.osaka-u.ac.jp/homepage/b018/