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Discovery of biomarkers for early colon cancer using a phospho-proteomic approach

Research Project

Project/Area Number 22790539
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Laboratory medicine
Research Institution独立行政法人医薬基盤研究所

Principal Investigator

KUGA Takahisa  独立行政法人医薬基盤研究所, プロテオームリサーチプロジェクト, 研究員 (20551857)

Project Period (FY) 2010 – 2011
Project Status Completed (Fiscal Year 2011)
Budget Amount *help
¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2011: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2010: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords腫瘍検査学 / 大腸癌 / タンパク質リン酸化 / バイオマーカー / プロテオーム解析 / Phospho-iTRAQ法 / SRM法 / 血中バイオマーカー
Research Abstract

The profile of protein phosphorylation in colon malignant tumor tissues were compared with those in colon benign tumor and non-tumor tissues using a phospho-proteomic technique(Phospho-iTRAQ). Phosphorylation levels at more than 200 phosphorylation sites were altered in the malignant tumor tissues, suggesting that these alterations are candidates for colon cancer. To validate these candidates, a phospho-SI-SRM technique was developed. Using these proteomic techniques and bioinformatics, I identified candidate biomarkers for colon cancer and signaling proteins involved in colon cancer.

Report

(3 results)
  • 2011 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (41 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (34 results) Remarks (3 results)

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Published: 2010-08-23   Modified: 2016-04-21  

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