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Target screening for cancer stem cells by a novel integrated N-terminomics and phospho- proteomics

Research Project

Project/Area Number 22F22111
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Review Section Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
Research InstitutionKumamoto University
Host Researcher 荒木 令江  熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 准教授 (80253722)
Foreign Research Fellow CHANG CHIH-HSIANG  熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2022-04-22 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywordsがん幹細胞 / プロテオミクス / プロテアーゼ / キナーゼ
Outline of Research at the Start

癌幹細胞(CSC)は悪性腫瘍の治療抵抗性と再発の根源であり治療標的とされている. 我々は, CSCの維持/分化/悪性化の分子機構と標的分子を明らかにするため, 種々の腫瘍からCSC樹立法を確立した。本研究では, 悪性神経膠芽腫幹細胞(GSCs)を用いてリン酸化プロテオミクスHAMMOC法とN-Terminomics (プロテアーゼ網羅解析)法とグローバルLFQ法を融合的に最適化し, 経時的変動を伴うタンパク質リン酸化と分解部位の全情報のプロファイル化を介して, キナーゼとプロテアーゼのクロストークによる活性化ネットワークを抽出し, これらの治療標的としての可能性を検証する.

Outline of Annual Research Achievements

癌幹細胞(CSC)は悪性腫瘍の治療抵抗性と再発の根源であり治療標的とされている. 我々は, CSCの維持/分化/悪性化の分子機構と標的分子を明らかにするため, 種々の腫瘍からCSC樹立法を確立し, 独自の融合プロテオミクスによって, 細胞内キナーゼやプロテアーゼの多くが, CSC分化スイッチングの際に大きく変動することを見出した. キナーゼとプロテアーゼの癌特異的なクロストークは, 有効な治療標的として近年大きく注目されている. 本研究では, 悪性神経膠芽腫幹細胞(GSCs)を用いてリン酸化プロテオミクスHAMMOC法とN-Terminomics(プロテアーゼ網羅解析)法とグローバルLFQ法を融合的に最適化し, 経時的変動を伴うタンパク質リン酸化と分解部位の全情報をプロファイル化し, キナーゼとプロテアーゼのクロストークによる活性化ネッ トワークを抽出し, これらの治療標的としての可能性を検証しようとした。
悪性神経膠芽腫細胞株と患者組織から樹立した6クローンのGSCを用いて、悪性分化誘導有/無の経時的変化(4 point)を各 4 replicateを調製し、これら各々より、細胞タンパク質可溶化2条件(Urea Base(核抽出)とPTSbase(膜抽出))で前処理を行い、各々高感度StageTip-baseによるHAMMOC法と電荷媒介位置選択法で濃縮し、高感度nanoLC-MSMSにて網羅的分子同定および定量解析の最適化を行った。グリオーマ分化過程に共通して動的変化するプロテアーゼ/キナーゼ特定法を検討し、特にGSCにおいて特異的に活性化するキナーゼおよびプロテアーゼ群および、それらの基質となるタンパク質群の抽出に一部成功した。更なる検証実験が必要であるが、これらの阻害剤がGSCに有効である可能性がある。

Research Progress Status

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Report

(1 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 7 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 2 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] 国立コンケン大学(タイ)

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    • Author(s)
      Panawan Orasa, Silsirivanit Atit、Chang Chih‐Hsiang、Putthisen Siyaporn、Boonnate Piyanard、Yokota Taro、Nishisyama‐Ikeda Yuki、Detarya Marutpong、Sawanyawisuth K、Kaewkong W、Muisuk K、Luang S、Vaeteewoottacharn K、Kariya R、Yano H、Komohara Y、Ohta K、Okada S、Wongkham S、Araki Norie
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: in press Issue: 8 Pages: 3230-3246

    • DOI

      10.1111/cas.15812

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    • Author(s)
      Takeshi Masuda, Norie Araki, Sumio Ohtsuki
    • Journal Title

      Journal of Proteome Data and Methods

      Volume: 5 Issue: 0 Pages: 1

    • DOI

      10.14889/jpdm.2023.0001

    • ISSN
      2434-6454
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    • Author(s)
      Takao Kitagawa, Daiki Kobayashi, Byron Baron, Hajime Okita, Tatsuo Miyamoto, Rie Takai, Durga Paudel, Tohru Ohta, Yoichi Asaoka, Masayuki Tokunaga, Koji Nakagawa, Makoto Furutani-Seiki, Norie Araki, Yasuhiro Kuramitsu, Masanobu Kobayashi
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Issue: 10 Pages: 0269077-0269077

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0269077

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    • Author(s)
      Masuda Takeshi、Inamori Yuma、Furukawa Arisu、Yamahiro Maki、Momosaki Kazuki、Chang Chih-Hsiang、Kobayashi Daiki、Ohguchi Hiroto、Kawano Yawara、Ito Shingo、Araki Norie、Ong Shao-En、Ohtsuki Sumio
    • Journal Title

      Analytical Chemistry

      Volume: 94 Issue: 29 Pages: 10329-10336

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.1c05487

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  • [Journal Article] SIRT7 suppresses energy expenditure and thermogenesis by regulating brown adipose tissue functions in mice2022

    • Author(s)
      Yoshizawa Tatsuya、Sato Yoshifumi、Sobuz Shihab U.、Mizumoto Tomoya、Tsuyama Tomonori、Karim Md. Fazlul、Miyata Keishi、Tasaki Masayoshi、Yamazaki Masaya、Kariba Yuichi、Araki Norie、Araki Eiichi、Kajimura Shingo、Oike Yuichi、Braun Thomas、Bober Eva、Auwerx Johan、Yamagata Kazuya
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 7439-7439

    • DOI

      10.1038/s41467-022-35219-z

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    • Author(s)
      Chih-Hsiang Chang, Yasushi Ishihama
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      Journal of Proteome Data and Methods

      Volume: 4 Issue: 0 Pages: 3

    • DOI

      10.14889/jpdm.2022.0003

    • ISSN
      2434-6454
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      津曲 和哉、西田 紘士、張 智翔(Chih-Hsiang Chang)、石濱 泰
    • Journal Title

      Proteome Letters

      Volume: 7 Issue: 2 Pages: 47-52

    • DOI

      10.14889/jpros.7.2_47

    • ISSN
      2432-2776
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Large scale of global proteomics identify lipid metabolic pathways as a characteristic target of glioma stem-like cells2022

    • Author(s)
      Orasa Panawan, Atit Silsirivanit, Chih-Hsiang Chang, Siyaporn Putthisen, Worasak Kaewkong, Kanha Muisuk, Marutpong Detarya2, Sukanya Luang2 , Kulthida Vaeteewoottacharn, Ryosho Kariya, Seiji Okada, Sopit Wongkham and Norie Araki
    • Organizer
      The 81st annual meeting of the Japanese cancer association
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    • Author(s)
      横田 太郎、パナワン オラサ、チーシャン チャン、シルシリヴァ ニト アチト、田上 久美子、中村 雅史、荒木 令江
    • Organizer
      The 81st annual meeting of the Japanese cancer association
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Proteomics-Based Integrated Systems Biology for Tumor Research2022

    • Author(s)
      Norie Araki, Orasa Panawan, Marutpong Detarya, Akiko Niibori-Nambu, Chih-Hsiang Chang, Yuki Ikeda-Nishiyama, Daiki Kobayashi, Atit Silsirivanit
    • Organizer
      17th International Symposium of the Protein Society of Thailand
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Global- and phospho-proteomics identify specific lipid metabolism pathways involved in the maintenance of glioma stem-like cells2022

    • Author(s)
      Orasa Panawan, Atit Silsirivanit, Chih-Hsiang Chang, Siyaporn Putthisen, Taro Yokota, Yuki Nishisyama-Ikeda , Akiko NiiboriNambu, Norie Araki
    • Organizer
      日本プロテオーム学会2022年大会 JPrOS2022(20th JHUPO)
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  • [Presentation] 最適化グローバルプロテオミクスによる胆管がん由来幹細胞の性状解析 Characterization of cholangiocarcinoma stem-like cells by optimized global proteomics2022

    • Author(s)
      横田 太郎、パナワン オラサ、チーシャン チャン、シルシリヴァニト アチト、田上 久美子、中村 雅史、荒木 令江
    • Organizer
      日本プロテオーム学会2022年大会 JPrOS2022(20th JHUPO)
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      Araki, Norie, Panawan, Orasa, Chang, Chih-Hsiang, Yokota, Taro, Nishisyama-Ikeda, Yuki, Niibori-Nambu, Akiko, Silsirivanit, Atit
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      Norie Araki, Orasa Panawan, Marutpong Detarya, Akiko Niibori-Nambu1, Chih-Hsiang Chang, Yuki Ikeda-Nishiyama, Daiki Kobayashi, Atit Silsirivanit
    • Organizer
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      小形公亮、張智翔(Chang Chih-Hsiang)、Yeung, Darien、Spicer, Victor、 Krokhin, Oleg、石濱泰
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    • Author(s)
      荒木 令江 他 (小野 浩雅 編)
    • Total Pages
      248
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      9784758104067
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  • [Remarks] JPOST Repository/Database

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      https://jpostdb.org/

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  • [Remarks] 熊本大学大学院生命科学研究部腫瘍医学講座ホームページ

    • URL

      https://tgbaraki.com/

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Published: 2022-04-28   Modified: 2024-12-25  

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