Target screening for cancer stem cells by a novel integrated N-terminomics and phospho- proteomics
| Project/Area Number |
22F22111
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| Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 外国 |
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| Review Section |
Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
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| Research Institution | Kumamoto University |
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| Host Researcher |
荒木 令江 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 准教授 (80253722)
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| Foreign Research Fellow |
CHANG CHIH-HSIANG 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 外国人特別研究員
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| Project Period (FY) |
2022-04-22 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
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| Keywords | がん幹細胞 / プロテオミクス / プロテアーゼ / キナーゼ |
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| Outline of Research at the Start |
癌幹細胞(CSC)は悪性腫瘍の治療抵抗性と再発の根源であり治療標的とされている. 我々は, CSCの維持/分化/悪性化の分子機構と標的分子を明らかにするため, 種々の腫瘍からCSC樹立法を確立した。本研究では, 悪性神経膠芽腫幹細胞(GSCs)を用いてリン酸化プロテオミクスHAMMOC法とN-Terminomics (プロテアーゼ網羅解析)法とグローバルLFQ法を融合的に最適化し, 経時的変動を伴うタンパク質リン酸化と分解部位の全情報のプロファイル化を介して, キナーゼとプロテアーゼのクロストークによる活性化ネットワークを抽出し, これらの治療標的としての可能性を検証する.
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| Outline of Annual Research Achievements |
癌幹細胞(CSC)は悪性腫瘍の治療抵抗性と再発の根源であり治療標的とされている. 我々は, CSCの維持/分化/悪性化の分子機構と標的分子を明らかにするため, 種々の腫瘍からCSC樹立法を確立し, 独自の融合プロテオミクスによって, 細胞内キナーゼやプロテアーゼの多くが, CSC分化スイッチングの際に大きく変動することを見出した. キナーゼとプロテアーゼの癌特異的なクロストークは, 有効な治療標的として近年大きく注目されている. 本研究では, 悪性神経膠芽腫幹細胞(GSCs)を用いてリン酸化プロテオミクスHAMMOC法とN-Terminomics(プロテアーゼ網羅解析)法とグローバルLFQ法を融合的に最適化し, 経時的変動を伴うタンパク質リン酸化と分解部位の全情報をプロファイル化し, キナーゼとプロテアーゼのクロストークによる活性化ネッ トワークを抽出し, これらの治療標的としての可能性を検証しようとした。
悪性神経膠芽腫細胞株と患者組織から樹立した6クローンのGSCを用いて、悪性分化誘導有/無の経時的変化(4 point)を各 4 replicateを調製し、これら各々より、細胞タンパク質可溶化2条件(Urea Base(核抽出)とPTSbase(膜抽出))で前処理を行い、各々高感度StageTip-baseによるHAMMOC法と電荷媒介位置選択法で濃縮し、高感度nanoLC-MSMSにて網羅的分子同定および定量解析の最適化を行った。グリオーマ分化過程に共通して動的変化するプロテアーゼ/キナーゼ特定法を検討し、特にGSCにおいて特異的に活性化するキナーゼおよびプロテアーゼ群および、それらの基質となるタンパク質群の抽出に一部成功した。更なる検証実験が必要であるが、これらの阻害剤がGSCに有効である可能性がある。
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| Research Progress Status |
翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。
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Report
(1 results)
Research Products
(19 results)
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[Journal Article] AT-hook DNA-binding motif-containing protein one knockdown downregulates EWS-FLI1 transcriptional activity in Ewing’s sarcoma cells2022
Author(s)
Takao Kitagawa, Daiki Kobayashi, Byron Baron, Hajime Okita, Tatsuo Miyamoto, Rie Takai, Durga Paudel, Tohru Ohta, Yoichi Asaoka, Masayuki Tokunaga, Koji Nakagawa, Makoto Furutani-Seiki, Norie Araki, Yasuhiro Kuramitsu, Masanobu Kobayashi
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Journal Title
PLOS ONE
Volume: 17
Issue: 10
Pages: 0269077-0269077
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Presentation] Large scale of global proteomics identify lipid metabolic pathways as a characteristic target of glioma stem-like cells2022
Author(s)
Orasa Panawan, Atit Silsirivanit, Chih-Hsiang Chang, Siyaporn Putthisen, Worasak Kaewkong, Kanha Muisuk, Marutpong Detarya2, Sukanya Luang2 , Kulthida Vaeteewoottacharn, Ryosho Kariya, Seiji Okada, Sopit Wongkham and Norie Araki
Organizer
The 81st annual meeting of the Japanese cancer association
Related Report
Int'l Joint Research
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[Presentation] a) Identification of novel target signal networks of cancer stem cells by the functional integrated proteomics, b) Introduction of JPDM2022
Author(s)
Araki, Norie, Panawan, Orasa, Chang, Chih-Hsiang, Yokota, Taro, Nishisyama-Ikeda, Yuki, Niibori-Nambu, Akiko, Silsirivanit, Atit
Organizer
HUPO 2022 world congress
Related Report
Int'l Joint Research
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