Genomic Information Reveals Environmental Responses of Riverine Organisms: Conservation Focusing on Natural Selection and Functional Diversity

• Project/Area Number: 22H01627
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 22060:Environmental systems for civil engineering-related
• Research Institution: Ehime University
• Principal Investigator: 渡辺 幸三 愛媛大学, 沿岸環境科学研究センター, 教授 (80634435)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 竹門 康弘 京都大学, 防災研究所, 准教授 (50222104)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2025-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000); Fiscal Year 2023: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000); Fiscal Year 2022: ¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000)
• Keywords: 河川 / 進化 / 生物多様性 / 次世代シークエンサー / 環境

Outline of Research at the Start

河川生物のゲノムワイドの塩基配列情報を解析し，種・個体群レベルおよび群集レベルの環境応答を正確に定量する新規的技術を開発する。研究目的は以下３つである。
1.次世代シークエンシング解析で得た各生息種のゲノム情報から選択性遺伝子座を探索し，それらの自然選択を起こしている環境因子（選択圧）を同定する。
2.種の生息分布の限界域では，その厳しい生息環境に適応した遺伝子型の頻度が高まる性質を補完的に活用することで，種の生息場適性モデルの精度を高める。
3.ゲノム情報が明らかにする生物群集や環境DNAの「機能的多様性」という保全概念を提唱すると共に，地域群集の機能的多様性を保全するための河川環境条件を導く。