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Elucidating integration mechanisms of plant nutritional information as a basis for Liebig's minimum law

Research Project

Project/Area Number 22H04977
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (S)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Broad Section F
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

柳澤 修一  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (20222359)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮川 拓也  京都大学, 生命科学研究科, 准教授 (50596559)
櫻庭 康仁  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (80792192)
Project Period (FY) 2022-04-27 – 2027-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥194,610,000 (Direct Cost: ¥149,700,000、Indirect Cost: ¥44,910,000)
Fiscal Year 2025: ¥34,580,000 (Direct Cost: ¥26,600,000、Indirect Cost: ¥7,980,000)
Fiscal Year 2024: ¥34,970,000 (Direct Cost: ¥26,900,000、Indirect Cost: ¥8,070,000)
Fiscal Year 2023: ¥34,450,000 (Direct Cost: ¥26,500,000、Indirect Cost: ¥7,950,000)
Fiscal Year 2022: ¥56,030,000 (Direct Cost: ¥43,100,000、Indirect Cost: ¥12,930,000)
Keywords植物栄養 / 肥料三要素 / リービッヒの最小律 / 栄養シグナル / 転写制御 / シグナル伝達 / 遺伝子発現制御 / 硝酸シグナル伝達 / 転写因子
Outline of Research at the Start

植物成長の本質を表す概念に「植物の成長は最も不足している栄養素にのみ影響される」とするリービッヒの最小律があるが、この概念を裏打ちする分子メカニズムは未解明である。肥料三要素(窒素、リン、カリ)は植物の栄養素の中でも必要量が多いために欠乏状態になりやすい栄養素である。そこで、肥料三要素に焦点を当て、シロイヌナズナとイネを用いて、これら栄養素に関する情報の統合メカニズムを解明する。さらに、この栄養情報の統合メカニズムによって肥料三要素の獲得バランスが調節され、成長速度が決定されていることを示し、リービッヒの最小律を裏打ちする分子メカニズムの実体を明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

どのようにして植物は肥料三要素に関する栄養情報を統合して成長の最適化を行なっているかを解明することを目的として研究を進めた。まず、硝酸シグナル応答において中心的な役割を担うNLP7転写因子の硝酸シグナル受容ドメインは硝酸イオンに直接結合することを示し、NLP7が硝酸センサーであることを明らかにした。また、NLP7の標的遺伝子の一つがNADH合成経路の鍵酵素遺伝子(AO)であることから、NLP7結合部位が破壊された変異型AOプロモーターあるいは野生型AOプロモーターによってAOの発現が制御されているシロイヌナズナ系統を作出していたが、これらにおける遺伝子発現を包括的に比較するとともに硝酸還元活性も比較することで、硝酸シグナルがNADH合成を促進する理由はTCA回路を維持するためであり、NLP7によるAOの制御は硝酸シグナルに応答した広範囲な遺伝子発現の変化に必要であることを明らかにした。また、NLP7の標的遺伝子の一つとしてHB52転写因子遺伝子を同定し、この転写制御の意義は葉緑体の機能維持であることを示唆していたことから、異なる光条件下にあるnlp7変異体とhb52変異体の葉緑体の電子顕微鏡観察を行うことで、このことを確立した。一方で、イネにおける窒素欠乏応答を担う転写抑制因子OsHHO3は幾つかのリン酸トランスポーター遺伝子の発現抑制因子でもあることを発見し、この抑制の意義を明らかするための解析を開始した。また、共発現解析等によりOsHHO3遺伝子と同様にイネにおける窒素欠乏応答の鍵転写因子遺伝子であると示唆されたOsHHO4遺伝子をゲノム編集技術により破壊すると、oshho3変異体と同様の表現型を示すことを明らかにした。しかしながらoshho3変異体とoshho4変異体では表現型に異なる点も見られたことから、これらの転写抑制因子としての機能の差異に関する解析を開始した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

NLP転写因子が硝酸センサーであることを示すなど大きな成果を挙げてており、また、他の解析も順調に進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

研究計画に大きな変更を加えることなく、研究課題を着実に進める。

Assessment Rating
Interim Assessment Comments (Rating)

A: In light of the aim of introducing the research area into the research categories, the expected progress has been made in research.

Report

(4 results)
  • 2024 Interim Assessment (Comments) ( PDF )
  • 2022 Abstract ( PDF )   Comments on the Screening Results   Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] Dept. of Mol. Biol., MGH(米国)

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  • [Journal Article] Arabidopsis nitrate-induced aspartate oxidase gene expression is necessary to maintain metabolic balance under nitrogen nutrient fluctuation2022

    • Author(s)
      Moriaki Saito, Mineko Konishi, Atsuko Miyagi, Yasuhito Sakuraba, Maki Kawai-Yamada, Shuichi Yanagisawa
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 5 Issue: 1 Pages: 432-432

    • DOI

      10.1038/s42003-022-03399-5

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Arabidopsis NLP7-HB52/54-VAR2 pathway modulates energy utilization in diverse light and nitrogen conditions2022

    • Author(s)
      Ariga Takuto、Sakuraba Yasuhito、Zhuo Mengna、Yang Mailun、Yanagisawa Shuichi
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 32 Issue: 24 Pages: 5344-5353

    • DOI

      10.1016/j.cub.2022.10.024

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] NIN-like protein 7 transcription factor is a plant nitrate sensor2022

    • Author(s)
      Liu, K.-H., Liu, M., Lin, Z., Wang, Z.-F., Chen, B., Liu, C., Guo, A., Konishi, M., Yanagisawa, S., Wagner, G, Sheen, J.
    • Journal Title

      Science

      Volume: 377 Issue: 6613 Pages: 1419-1425

    • DOI

      10.1126/science.add1104

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  • [Journal Article] RWP-RK domain-containing transcription factors in the Viridiplantae: biology and phylogenetic relationships2022

    • Author(s)
      Sakuraba Yasuhito、Zhuo Mengna、Yanagisawa Shuichi
    • Journal Title

      Journal of Experimental Botany

      Volume: 73 Issue: 13 Pages: 4323-4337

    • DOI

      10.1093/jxb/erac229

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    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 植物における硝酸シグナル伝達の仕組みと役割の新理解2023

    • Author(s)
      柳澤修一
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会, シンポジウム「植物の環境センシングと信号伝達における研究最前線」
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    • Invited
  • [Presentation] The role of OsHHO3 transcription repressor in controlling phosphorus acquisition in rice2023

    • Author(s)
      Yang, M., Liu, K., Sakuraba, Y., Yanagisawa, S.
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
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  • [Presentation] グルタミンによる硝酸輸送体遺伝子の発現抑制におけるNIGT1転写因子およびLBDタンパク質の役割2023

    • Author(s)
      鳥井要佑、小西美稲子、櫻庭康仁、柳澤修一
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
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  • [Presentation] イネの窒素欠乏応答ネットワークにおけるOsbZIP11転写因子の役割2023

    • Author(s)
      大槻並枝、植田佳明、櫻庭康仁、柳澤修一
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] NIGT1-centered transcriptional network for the balanced acquisition of nitrogen and phosphorus2022

    • Author(s)
      Shuichi Yanagisawa
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会, JPR国際シンポジウム
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    • Invited
  • [Presentation] イネの窒素欠乏応答ネットワークにおけるOsbZIP11転写因子の役割2022

    • Author(s)
      大槻並枝、植田佳明、櫻庭康仁、柳澤修一
    • Organizer
      日本土壌肥料学会2022年度東京大会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] グルタミンによる窒素応答関連遺伝子の発現抑制におけるLBDタンパク質およびNIGT1転写因子の役割2022

    • Author(s)
      鳥井要佑、小西美稲子、櫻庭康仁、柳澤修一
    • Organizer
      日本土壌肥料学会2022年度東京大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Involvement of chloroplastic Sec14-like protein in the regulation of phosphorus acquisition and use2022

    • Author(s)
      Yang, M., Sakuraba, Y., Ishikawa, T., Ohtsuki, N., Kawai-Yamada, M., Yanagisawa, S.
    • Organizer
      19th International Symposium on Rice Functional Genomics
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

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Published: 2022-04-28   Modified: 2025-04-17  

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