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情報流のパス展開理論と神経ネットワーク活動計測に基づく生物の行動決定機構の解明

Research Project

Project/Area Number 22K03453
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 13010:Mathematical physics and fundamental theory of condensed matter physics-related
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

森 史  九州大学, 農学研究院, 准教授 (90525891)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岡田 崇  京都大学, 医生物学研究所, 准教授 (10741043)
杉 拓磨  広島大学, 統合生命科学研究科(理), 准教授 (70571305)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords複雑ネットワーク / 情報流 / 神経回路 / 摂動論 / 全脳イメージング
Outline of Research at the Start

生物系において、外部刺激に応じた行動決定を担っているのは神経ネットワークの活動である。線虫では、ある刺激に対する行動選択を担っている局所的なネットワーク構造が発見されているが、さまざまな刺激に対して常に局所的な情報処理で答えを出しているのか、あるいは、時に大域的な構造も利用しているのかは、定かではない。本研究では「ネットワーク上の情報流のパス展開理論」を線虫の神経回路に適用し、シグナルの伝達に重要な経路群を特定する。さらに、実験的にその経路群を観測することで、高分解能の情報流測定を実現する。こうして、理論と実験により、局所的及び大域的な情報流の全貌を明らかにし、行動決定のメカニズムを解明する。

Outline of Annual Research Achievements

生物の神経回路においてどのような情報処理が実行されどのように行動決定がなされているのかは、未解明である。例えば、神経回路のトポロジーが分かっている線虫では、ある刺激に対する行動選択を担っている局所的なネットワーク構造が発見されているが、さまざまな刺激に対して常に局所的な情報処理で答えを出しているのか、あるいは、時に大域的なネットワーク構造も利用しているのかは、定かではない。本研究では、ネットワーク上の情報流を記述する理論を線虫などの神経回路に適用し、刺激シグナルの伝達に重要な経路群を特定することを目指している。今年度は、高分解能ライトフィールド顕微鏡(high-resolution computational optical sectioning light-field microscopy:HR-OptSec LFM) )のカスタマイズが一段と進んだ。これにより、線虫やマウスの脳スライスおよび自由行動中の大脳皮質において、カルシウムイメージングにより神経活動を観測することに成功した。マウスの観測データから各ニューロン間の移動エントロピーを計算し、情報流のネットワークの特徴量(平均距離、クラスター係数、次数分布など)を調べたところ、脳スライスでは定常的にスモールワールド性が観測され、大脳皮質では、痛み刺激に対して、ネットワークの構造が変化する様子が見られた。このような様子は、高時間分解能・高空間分解能を持つデータでないと、捉えることができないことも確認された。これらの結果を、APPW2025などで発表した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

線虫のみならず、マウスに対しても、神経活動を観測することができた。また、実験データを用いて、情報の流れを計算することもできた。よって、おおむね順調に進展してると言える。

Strategy for Future Research Activity

比較的短い観測時間における線虫の神経活動データを使って、物理学的・生物学的に意味のある情報を抽出するために、理論側と実験側のディスカッションを続けていく。

Report

(3 results)
  • 2024 Research-status Report
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2025 2024 2023 2022 Other

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 10 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Enhanced precision of circadian rhythm by output system2023

    • Author(s)
      Kaji Hotaka、Mori Fumito、Ito Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Theoretical Biology

      Volume: 574 Pages: 111621-111621

    • DOI

      10.1016/j.jtbi.2023.111621

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Patterns of change in regulatory modules of chemical reaction systems induced by network modification2023

    • Author(s)
      Hishida Atsuki、Okada Takashi、Mochizuki Atsushi
    • Journal Title

      PNAS Nexus

      Volume: 3 Issue: 1

    • DOI

      10.1093/pnasnexus/pgad441

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Caenorhabditis elegans transfers across a gap under an electric field as dispersal behavior2023

    • Author(s)
      Chiba Takuya、Okumura Etsuko、Nishigami Yukinori、Nakagaki Toshiyuki、Sugi Takuma、Sato Katsuhiko
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 33 Issue: 13 Pages: 2668-2677

    • DOI

      10.1016/j.cub.2023.05.042

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Large-Scale Cultivation of Nematodes to Study Their Collective Behaviors2023

    • Author(s)
      Imamura Ryuki、Nakane Yurina、Jiajing Hu、Ito Hiroshi、Sugi Takuma
    • Journal Title

      Journal of Visualized Experiments

      Volume: 1 Issue: 198 Pages: 10-10

    • DOI

      10.3791/65569

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Information-transfer characteristics in network motifs2023

    • Author(s)
      Mori Fumito、Okada Takashi
    • Journal Title

      Physical Review Research

      Volume: 5 Issue: 1 Pages: 013037-013037

    • DOI

      10.1103/physrevresearch.5.013037

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Root PRR7 Improves the Accuracy of the Shoot Circadian Clock through Nutrient Transport2023

    • Author(s)
      Uemoto Kyohei、Mori Fumito、Yamauchi Shota、Kubota Akane、Takahashi Nozomu、Egashira Haruki、Kunimoto Yumi、Araki Takashi、Takemiya Atsushi、Ito Hiroshi、Endo Motomu
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 64 Issue: 3 Pages: 352-362

    • DOI

      10.1093/pcp/pcad003

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  • [Presentation] Inference of coupling direction in a pair of self-sustained oscillators and its verification using metronomes2025

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      Fumito Mori
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      杉拓磨
    • Organizer
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      森史
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    • Author(s)
      Fumito Mori
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      STATPHYS28
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      森史、岡田崇
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      森史、岡田崇
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      Takuma Sugi
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      BISC2023
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    • Author(s)
      Takashi Okada
    • Organizer
      ICIAM 2023
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Determining regulations of biochemical reaction systems from network topology2023

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      Takashi Okada
    • Organizer
      The 29th East Asia Joint Symposium
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  • [Presentation] Lineage frequency fluctuations reveal the spatial dynamics of disease transmission in SARS-CoV-22023

    • Author(s)
      Takashi Okada
    • Organizer
      APS March Meeting 2023
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  • [Presentation] Graphical expansion of information flows in network motifs2022

    • Author(s)
      Fumito Mori
    • Organizer
      Conference on complex systems 2022
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Output systems can improve accuracy of biological rhythms2022

    • Author(s)
      Hotaka Kaji, Fumito Mori, and Hiroshi Ito
    • Organizer
      Conference on complex systems 2022
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 振動の時刻データを用いた振動子間の結合強度の推定2022

    • Author(s)
      森史
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    • Author(s)
      梶穂高、森史、伊藤浩史
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      第29回日本時間生物学会学術大会
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    • Author(s)
      Takuma Sugi
    • Organizer
      The 31th International Toki conference on plasma and fusion research
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  • [Remarks] ネットワークの三角構造が担う情報伝達の役割を解明

    • URL

      https://www.kyushu-u.ac.jp/f/51272/23_0126_02.pdf

    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2025-12-26  

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