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Elucidation of the role of low-energy electrons in biomolecular damage in liquid water by ion beams

Research Project

Project/Area Number 22K03549
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 13040:Biophysics, chemical physics and soft matter physics-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

土田 秀次  京都大学, 工学研究科, 准教授 (50304150)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2024: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywordsイオンビーム / 生体分子 / 液相水 / 放射線損傷 / DNA損傷 / 水和 / 炭素イオンビーム / ヌクレオチド / 液体の水 / 低エネルギー電子
Outline of Research at the Start

本研究は、粒子線がん治療の基礎研究として、Braggピーク領域のエネルギーを持つイオンビームによる水中における生体分子損傷について、水分子に囲まれた生体分子に対して、生体に吸収された放射線のエネルギーで生じた二次電子がどのような反応を誘発するのかを実験的に解明する。特に、水中で発生した二次電子のうち、生体分子の電離エネルギーのしきい値より低く、尚且つ、水和前の低エネルギー二次電子による生体分子の損傷過程を解明する。このような低エネルギー電子による生体分子損傷の素反応の解明により、放射線のDNA損傷の原因を原子・分子レベルで理解することに繋げる。

Outline of Annual Research Achievements

今年度は、ヌクレオチド分子に対するイオンビームの線エネルギー付与(LET)依存性と、グリシンペプチド分子に対する水和の有無による分子損傷の違いについての研究課題に取り組んだ。
前者の課題では、生体分子に4種類のRNAベースのヌクレオチド(アデノシン一リン酸、グアノシン一リン酸、シチジン一リン酸、ウリジン一リン酸)を用い、これらの試料に、ヘリウム、リチウム、炭素、および酸素ビームを照射することでLETを変え、分子損傷のLET依存性を調べた。ここでは、リン酸+リボース部位の損傷と塩基部位の損傷の割合に注目し、ウリジン一リン酸とアデノシン一リン酸の結果を比較すると、損傷割合は、LETの値が小さいと塩基損傷が支配的に起こり、他方、LETの値が大きいとリン酸+リボース部位の損傷が支配的に起こることが分かった。この結果をDNA損傷に拡張すると、LETの値が大きくなると、鎖切断が支配的になることに対応し、本研究で、DNA損傷のLET依存性を原子レベルで観測することに成功した。
後者の課題では、生体分子にグリシンのジペプチド、トリペプチド、テトラペプチドを用い、これらの水溶液と固体状試料に、4 MeVの炭素イオンビームを照射し、グリシンペプチド分子の損傷における分子周辺の液相水の影響を調べた。得られた主な結果として、水溶液試料は、グリシンのCα-C結合切断に由来する分解イオンが生成され、固体状試料では、N末端やC末端の切断に起因する分解イオンが生成されることが分かった。また、水溶液試料において、グリシンのCα-C結合切断は、ペプチド分子の数が多くなると、その切断が促進されることが分かった。この原因は未解明であるが、今後の研究において水の放射線分解生成物(ラジカル)の関与を調べる予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究課題は着実に進んでおり、実験的にトラブルは特に生じていない。また、本研究で得られた実験結果の解釈も進めており、シミュレーションによるモデル計算を実施している。これら実験とシミュレーションの比較は概ね一致しており、本研究の最終目的である水中の生体分子損傷が二次電子の挙動とどう関わっているかを解明できる見込みである。

Strategy for Future Research Activity

本研究の最終課題は、水中の生体分子の損傷における低エネルギー二次電子の役割を明らかにすることである。この課題を達成するために今後の研究では、10 eVから200 eVの電子ビームとイオンビームを、液体ジェット法による生体分子水溶液に照射し、生体分子の損原子レベルでの損傷を観察する実験に取り組む。用いるイオンビームの種類は、ヘリウム、リチウム、炭素、および酸素ビームで、これらは、粒子線がん治療の新しい方法である「マルチイオン照射法」に用いるものである。イオンビームによる二次電子の生成は、これまでの研究から、線エネルギー付与(LET)に依存することが分かっており、具体的にはLETの値が小さいと低エネルギーの電子の成分が多く、他方、LETの値が大きいと高エネルギーの電子の成分が多い。このことを利用することで、低および高エネルギー電子の発生量の違いによる生体分子の損傷過程と明らかにすることができる。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] First-principles simulation of an ejected electron produced by monochromatic deposition energy to water at the femtosecond order2023

    • Author(s)
      Kai Takeshi、Toigawa Tomohiro、Matsuya Yusuke、Hirata Yuho、Tezuka Tomoya、Tsuchida Hidetsugu、Yokoya Akinari
    • Journal Title

      RSC Advances

      Volume: 13 Issue: 46 Pages: 32371-32380

    • DOI

      10.1039/d3ra05075k

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Initial yield of hydrated electron production from water radiolysis based on first-principles calculation2023

    • Author(s)
      Takeshi Kai, Tomohiro Toigawa, Yusuke Matsuya, Yuho Hirata, Tomoya Tezuka, Hidetsugu Tsuchida, Akinari Yokoya
    • Journal Title

      Royal Society of Chemistry Advances

      Volume: 13 Issue: 11 Pages: 7076-7086

    • DOI

      10.1039/d2ra07274b

    • Related Report
      2023 Research-status Report 2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Elucidation of the mechanism of biomolecular damage in liquid water that occurs on a nanoscale by ion beams2022

    • Author(s)
      土田秀次、間嶋拓也、甲斐健師
    • Journal Title

      Oyo Buturi

      Volume: 91 Issue: 9 Pages: 553-557

    • DOI

      10.11470/oubutsu.91.9_553

    • ISSN
      0369-8009, 2188-2290
    • Year and Date
      2022-09-01
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Toward the elucidation of biomolecular damage in liquid water near tracks caused by ion beams2022

    • Author(s)
      Hidetsugu Tsuchida, Takuya Majima, Takeshi Kai
    • Journal Title

      JSAP Review

      Volume: 2022 Issue: 0 Pages: n/a

    • DOI

      10.11470/jsaprev.220413

    • ISSN
      2437-0061
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 重イオン衝突による液体および固体中のペプチド分子の損傷過2024

    • Author(s)
      手塚智哉、秀嶋雄登、橘彩菜、間嶋拓也、斉藤学、 土田秀次(登壇者)
    • Organizer
      日本物理学会 2024年春季大会、2024年3月18日、オンライン
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Radiolysis of liquid water occurring around ion tracks of carbon beams2023

    • Author(s)
      Hidetsugu Tsuchida
    • Organizer
      8th International Conference "Dynamics of Systems on the Nanoscale" (DySoN 2023), April 24-26, 2023, Prague, Czech Republic
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Damage process of nucleotide molecules in water by ion irradiation2023

    • Author(s)
      Hidetsugu Tsuchida
    • Organizer
      11th International Symposium "Atomic Cluster Collisions" (ISACC 2023), July 20-22, 2023, Iceland
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Ion beam induced biomolecular damage in water using MeV-SIMS2023

    • Author(s)
      Hidetsugu Tsuchida
    • Organizer
      24th International Workshop on Inelastic Ion-Surface Collisions (IISC24), September 10-15, 2023, Charleston, South Carolina, USA
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Bond breakages of biomolecules by ion-induced ionization and electronic excitation2023

    • Author(s)
      Tomoya Tezuka, Takuya Majima, Manabu Saito, Hidetsugu Tsuchida
    • Organizer
      21st International Conference on Radiation Effects in Insulators, September 3-8, 2023, Fukuoka, Japan
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] イオンビームによる液相水中で起こるヌクレオチド分子の損傷過程2023

    • Author(s)
      土田秀次、手塚智哉、大田哲郎、秀嶋雄登、間嶋拓也、斉藤学
    • Organizer
      第70回応用物理学会春季学術講演会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 重イオンの直接作用におけるUMP分子の分解とエネルギー付与との関係2023

    • Author(s)
      手塚智哉、間嶋拓也、斉藤学、土田秀次
    • Organizer
      日本物理学会2023年春季大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 重イオン照射による液相水から放出される正負二次イオンの生成過程2023

    • Author(s)
      土田秀次、手塚智哉、甲斐健師、松谷悠佑、間嶋拓也、斉藤学
    • Organizer
      日本物理学会2023年春季大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Projectile dependence in dissociation on biomolecules by swift heavy ion irradiation2022

    • Author(s)
      Tomoya Tezuka, Mizuki Hongo, Takuya Majima, Manabu Saito, Hidetsugu Tsuchida
    • Organizer
      29th International conference on atomic collisions in solids
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] PHITSを用いたイオンビームと液相水との相互作用におけるトラック内反応の解析2022

    • Author(s)
      土田秀次、手塚智哉、甲斐健師、松谷悠佑、間嶋拓也、斉藤学
    • Organizer
      第83回応用物理学会秋季学術講演会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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