• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Development of automated path search methods for reactions including spin-inversion

Research Project

Project/Area Number 22K05031
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 32010:Fundamental physical chemistry-related
Research InstitutionSaitama University

Principal Investigator

高柳 敏幸  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (90354894)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2024: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2023: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywordsスピン反転 / 密度汎関数法 / 反応機構 / 反応経路探索 / 反応動力学 / 量子化学 / 触媒反応 / 反経路探索
Outline of Research at the Start

本研究では,有効ハミルトニアン行列法を反応経路自動探索法と融合させ,スピン反転反応経路自動探索法を開発する.スピン反転は本質的にはスピン状態間の電子的非断熱遷移であるため,その効率はスピン軌道相互作用の大きさによって決定される.しかし,生体反応を初めとする複雑な分子について,スピン軌道相互作用を正確に計算することは事実上不可能である.そこで機械学習を使ったスピン軌道相互作用の予測モデルを構築することを行う.さらにスピン反転を伴う反応の新しい非断熱遷移状態理論の構築を行う.

Outline of Annual Research Achievements

本年度は、アセチレン3分子環化反応によるベンゼン生成の金属触媒として3d遷移金属原子Ti(2価イオン)に着目した。適切な密度汎関数法と基底関数を用いて反応経路の詳細な計算を行った。ここでは以前の研究で用いて氷クラスターやCNアニオンを配位子として計算を行った。その結果、以前に調査したFeおよびVイオン錯体の触媒では、反応途中に必ずバリヤーが存在したが、Ti触媒については、予想に反して全くのバリヤーなしでベンゼン生成まで進行することを見出した。このことはTi触媒ではスピンの反転が起こらないことと関係していることが示唆された。また、本年度は鉄ポルフィリン錯体への酸素分子の吸着についての全自由度を考慮したポテンシャルエネルギー曲面の開発も行った。ポルフィリンの部分については、高速な計算が可能である半経験的電子状態理論(GFN2-xTB法)を利用し、酸素分子の吸着分は独自にポテンシャルエネルギー関数を開発した。この反応系では、酸素分子が錯体に接近する際はスピン三重項であるが、吸着生成物はスピン一重項であるため、それぞれのスピン状態に対応するポテンシャル曲面を作成し、これらの異なるスピン状態間のスピン軌道相互作用を考慮することで、ポテンシャルエネルギー曲面の交差ダイナミクスが十分記述できることを確認した。次年度は開発したポテンシャルエネルギー曲面を用いて、電子的非断熱ダイナミクス計算を行う予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究は計画通りに進行しており、最終年度に向けてスピン反転ダイナミクス計算を行う準備も整えることができた。

Strategy for Future Research Activity

これまでは密度汎関数法を用いて反応経路の探索に重点を置いてきたが、今後は実時間の反応シミュレーションに力を入れていく予定である。そのために、超高速半経験的拡張タイトバインディング法(GFN2-xTB法)を使える環境をすでに整えた。GFN2-xTB法と自作したポテンシャルエネルギー曲面関数を組み合わせることで、原子の全自由度を考慮した酸素分子のポルフィリン鉄錯体への吸着ダイナミクス計算が合理的な計算時間で実行できることを確認した。今後は詳細な電子的非断熱遷移ダイナミクス計算を行い、生物の呼吸過程とスピン軌道相互作用によるスピン反転機構の関連について議論することを予定している。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 5 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Possible Roles of Transition Metal Cations in the Formation of Interstellar Benzene via Catalytic Acetylene Cyclotrimerization2023

    • Author(s)
      Murakami Tatsuhiro、Matsumoto Naoki、Fujihara Takashi、Takayanagi Toshiyuki
    • Journal Title

      Molecules

      Volume: 28 Issue: 21 Pages: 7454-7454

    • DOI

      10.3390/molecules28217454

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Machine learning‐assisted study of correlation between post‐transition‐state bifurcation and initial phase information at the ambimodal transition state2023

    • Author(s)
      Murakami Tatsuhiro、Kikuma Yuya、Ibuki Shunichi、Matsumoto Naoki、Ogino Kanon、Hashimoto Yu、Takayanagi Toshiyuki
    • Journal Title

      Journal of Physical Organic Chemistry

      Volume: 36 Issue: 11

    • DOI

      10.1002/poc.4561

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Molecular dynamics simulations and machine-learning assisted study of the reaction path bifurcation: Application to the intramolecular Diels?Alder cycloaddition between cyclobutadiene and butadiene2023

    • Author(s)
      Murakami Tatsuhiro、Ibuki Shunichi、Takayanagi Toshiyuki
    • Journal Title

      Computational and Theoretical Chemistry

      Volume: 1227 Pages: 114239-114239

    • DOI

      10.1016/j.comptc.2023.114239

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Dynamics study of the post-transition-state-bifurcation process of the (HCOOH)H<sup>+</sup> → CO + H<sub>3</sub>O<sup>+</sup>/HCO<sup>+</sup> + H<sub>2</sub>O dissociation: application of machine-learning techniques2023

    • Author(s)
      Murakami Tatsuhiro、Ibuki Shunichi、Hashimoto Yu、Kikuma Yuya、Takayanagi Toshiyuki
    • Journal Title

      Physical Chemistry Chemical Physics

      Volume: 25 Issue: 20 Pages: 14016-14027

    • DOI

      10.1039/d3cp00252g

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The importance of nuclear dynamics in reaction mechanisms of acetylene cyclotrimerization catalyzed by Fe+-compounds2023

    • Author(s)
      T. Murakami, N. Matsumoto, T. Takayanagi, T. Fujihara
    • Journal Title

      Journal of Organometallic Chemistry

      Volume: 987-988 Pages: 122643-122643

    • DOI

      10.1016/j.jorganchem.2023.122643

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Two-state reactivity in the acetylene cyclotrimerization reaction catalyzed by a single atomic transition-metal ion: The case for V+ and Fe+2022

    • Author(s)
      T. Takayanagi
    • Journal Title

      Computational and Theoretical Chemistry

      Volume: 1211 Pages: 113682-113682

    • DOI

      10.1016/j.comptc.2022.113682

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Interstellar Benzene Formation Mechanisms via Acetylene Cyclotrimerization Catalyzed by Fe+ Attached to Water Ice Clusters: Quantum Chemistry Calculation Study2022

    • Author(s)
      T. Murakami, T. Takayanagi
    • Journal Title

      Molecules

      Volume: 27 Issue: 22 Pages: 7767-7767

    • DOI

      10.3390/molecules27227767

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Triplet-quintet spin-crossover efficiency in β-hydrogen transfer between Fe(C2H5)+ and HFe(C2H4)+2022

    • Author(s)
      T. Murakami, T. Takayanagi
    • Journal Title

      Computational and Theoretical Chemistry

      Volume: 1217 Pages: 113888-113888

    • DOI

      10.1016/j.comptc.2022.113888

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Non-adiabatic spin-inversion dynamics studied by wave packet calculations2023

    • Author(s)
      T. Takayanagi
    • Organizer
      An International Conference on Structure and Dynamics: Spectroscopy and Scattering (SDSS-2023) (Kolkata, India, 2023/10/05-08).
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 星間化学反応の理論研究:リングポリマー分子動力学と機械学習の応用2023

    • Author(s)
      高柳敏幸
    • Organizer
      原子衝突学会第48回年会 (東京, 2023/10/25-26).
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Two-state reactivity in Fe-catalyzed β-hydrogen elimination of ethyl cation2022

    • Author(s)
      T. Murakami, T. Takayanagi
    • Organizer
      XVIth Quantum Reactive Scattering Workshop (Hungary. 2022/09/04-09)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 鉄触媒によるエチルカチオンの三重項-五重項間のスピン反転の反応性2022

    • Author(s)
      村上龍大, 高柳敏幸
    • Organizer
      化学反応経路探索のニューフロンティア2022 (横浜, 2022/09/18)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Theoretical astrochemistry based on microscopic processes in the gas and solid phases2022

    • Author(s)
      T. Takayanagi
    • Organizer
      Symposium on Next Generation Astrochemistry (Japan, Tokyo, 2022/11/29-12/02)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi