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未知・未培養ポリエチレンテレフタレート分解微生物の探索とその酵素の獲得

Research Project

Project/Area Number 22K05310
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 37010:Bio-related chemistry
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

飯塚 怜  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (90541954)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsポリエチレンレテレフタレート / 酵素 / ポリエチレンテレフタレート
Outline of Research at the Start

ポリエチレンテレフタレート(PET)は難分解性のポリエステルだが,エステル結合を加水分解する酵素は自然界に広く存在する.このため,PETを分解する酵素の探索が行われてきた.しかし現時点で,真にPETを分解(解重合)できる酵素は4種類だけである.そこで本研究では,培養を必要としない迅速なPET分解微生物の探索法を確立する.またその探索法を実践し,未知・未培養微生物由来の新たなPET分解酵素を取得する.さらに,取得した酵素をPETのリサイクルに即した酵素へと進化させる.

Outline of Annual Research Achievements

本研究は,ポリエチレンテレフタレート(PET)分解微生物・酵素を探索する方法を確立すること,またその方法を利用して未知・未培養微生物由来の新規PET分解酵素を取得,PETのリサイクルに即した酵素へと進化させることを目指している.令和5年度は,以下の項目に取り組んだ.
(1) 要素技術の確立
油中に分散した水滴(油中水滴)にPET粉体を封入すると,外力による変形を受けにくくなることを見出した.PET粉体と微生物を封入した油中水滴の中から変形能が増大した油中水滴を回収することができれば,PET分解微生物を単離することができると考え,アガロース・アガロース分解菌の系を用い,油中水滴の変形能を利用した探索法を確立した.この成果は,Analytical Chemistry誌に掲載された.次に,この方法を利用してPET分解微生物の探索を実践すべく,微細なPET粉体を調製する方法を確立した.
(2) 堆肥メタゲノムからのPET分解酵素遺伝子の探索
高いPET分解能を示す酵素の多くは,堆肥由来の好熱性放線菌のクチナーゼである.昨年度,高温発酵堆肥より抽出したメタゲノムを鋳型にし,好熱性放線菌のクチナーゼ遺伝子に対するユニバーサルプライマーを用い,32種類の候補遺伝子を得た.各遺伝子を大腸菌で組換え発現させ,26種類のタンパク質を可溶性画分に発現させることに成功した.このうちの多くは,ポリエステル・PET分解活性を示した.また,その活性は,大腸菌における発現様式と関連することが示唆された.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

申請時に掲げた目標は,達成することができた.今後の成果が見込まれる.

Strategy for Future Research Activity

PET分解微生物の探索法をおおむね確立することができたので,その方法を実践する.また,メタゲノムより得られたPET分解酵素の機能解析を引き続き行う.

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (37 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 7 results) Presentation (26 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] N-terminal region of Drosophila melanogaster Argonaute2 forms amyloid-like aggregates2023

    • Author(s)
      Narita Haruka、Shima Tomohiro、Iizuka Ryo、Uemura Sotaro
    • Journal Title

      BMC Biology

      Volume: 21 Issue: 1 Pages: 78-78

    • DOI

      10.1186/s12915-023-01569-3

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    • Author(s)
      Mikihisa Muta, Takao Yoshida, Takashi Funatsu, Ryo Iizuka
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 12 Issue: 7

    • DOI

      10.1128/mra.00278-23

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  • [Journal Article] Accumulation of TERT in mitochondria shows two opposing effects on apoptosis2023

    • Author(s)
      Hiroshi Ebata, Tomohiro Shima, Ryo Iizuka, Sotaro Uemura
    • Journal Title

      FEBS Open Bio

      Volume: 13 Issue: 9 Pages: 1667-1682

    • DOI

      10.1002/2211-5463.13682

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    • Author(s)
      Mikihisa Muta, Wataru Kawakubo, Dong Hyun Yoon, Daiki Tanaka, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji, Mei Ito, Yuji Hatada, Takashi Funatsu, Ryo Iizuka
    • Journal Title

      Analytical Chemistry

      Volume: 95 Issue: 44 Pages: 16107-16114

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.3c02174

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    • Author(s)
      Ryo Iizuka, Hirohito Yamazaki, Sotaro Uemura
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 19 Issue: 0 Pages: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v19.0032

    • ISSN
      2189-4779
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      Ryo Iizuka, Kentaro Tahara, Anna Matsueda, Soichiro Tsuda, Dong Hyun Yoon, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji, Takashi Funatsu
    • Journal Title

      Biochemical Engineering Journal

      Volume: 187 Pages: 108627-108627

    • DOI

      10.1016/j.bej.2022.108627

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  • [Journal Article] Application of engineered polyethylene terephthalate (PET) hydrolase Cut190 to bio-recycling of PET waste2022

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      Fusako Kawai, Yoshitomo Furushima, Norihiro Mochizuki, Naoki Muraki, Mitsuaki Yamashita, Akira Iida, Rie Mamoto, Takehiko Tosha, Ryo Iizuka, Sakihito Kitajima
    • Journal Title

      AMB Express

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 134-134

    • DOI

      10.1186/s13568-022-01474-y

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      Akira Kitamura, Ryo Iizuka
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 19 Issue: 0 Pages: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v19.0044

    • ISSN
      2189-4779
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      Mei Ito, Mikihisa Muta, Takashi Funatsu, Yuji Hatada, Ryo Iizuka
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 11 Issue: 12

    • DOI

      10.1128/mra.00934-22

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      畑 昂樹,安部 夏月,飯塚 怜,野口 恵一,森屋 利幸,大島 泰郎,養王田 正文
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      牟田 幹悠,斉藤 開,飯塚 怜,川久保 渉,尹 棟鉉,関口 哲志,庄子 習一,伊藤 芽,秦田 勇二,船津 高志
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    • Author(s)
      山崎 洋人,飯塚 怜,上村 想太郎
    • Total Pages
      208
    • Publisher
      化学同人
    • ISBN
      9784759814057
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  • [Remarks] Researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/ryoiizuka

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URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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