Development of bifunctional RNA aptamers that induce targeted protein degradation

• Project/Area Number: 22K05322
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 37010:Bio-related chemistry
• Research Institution: Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University
• Principal Investigator: 福永 圭佑 沖縄科学技術大学院大学, 核酸化学・工学ユニット, ポストドクトラルスカラー (80639279)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2025-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2022)
• Budget Amount: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000); Fiscal Year 2024: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000); Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000); Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
• Keywords: RNAアプタマー / SELEX / 二重特異性 / アンドラッガブルターゲット

Outline of Research at the Start

二重特異性RNAアプタマーを用いて哺乳動物細胞内の標的タンパク質を分解誘導する技術の開発を行う。まずは、E3に対するRNAアプタマーを試験管内のセレクション（SELEX）で新たに取得する。また、標的タンパク質に結合するRNAアプタマーとE3結合RNAアプタマーを融合することで二重特異性RNAアプタマーを作製する。プラスミドベクターにアプタマー配列を挿入し、トランスフェクションによる二重特異性RNAアプタマーの一過性発現により内在性タンパク質の分解誘導を試みる。