Project/Area Number |
22K05393
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 38020:Applied microbiology-related
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Research Institution | Niigata Institute of Technology |
Principal Investigator |
仁平 高則 新潟工科大学, 工学部, 准教授 (80615469)
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Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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Keywords | ホスホリラーゼ / ライブラリー / β-ガラクトシド / 糖代謝 |
Outline of Research at the Start |
嫌気性微生物は,酸素を利用した効率的なATP生産を行なえないため,ATP消費無しに糖質を分解・リン酸化できるホスホリラーゼを鍵酵素とした特徴的な糖代謝経路を有することがある。本研究では,グルコースやマンノースとならび多くの生物種が利用可能なガラクトースの重合体であるβ-ガラクタンや寒天などのβ-ガラクトシドに作用するホスホリラーゼを,ゲノム情報やメタゲノムライブラリーを利用して網羅的に探索し,発見した酵素の機能特性を明らかにする。これにより,ホスホリラーゼを鍵酵素とする新規ATP消費抑制型β-ガラクトシド代謝経路の全容を解明し,嫌気性微生物の生存戦略の一端について新たな一石を投じる。
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Outline of Annual Research Achievements |
嫌気性微生物は,酸素を利用した効率的なATP生産を行なえないため,ATPの消費無しに糖質を分解・リン酸化できる糖質加リン酸分解酵素(ホスホリラーゼ)が関与する特徴的な糖代謝経路を有することがある。本研究では,ゲノム情報やメタゲノムライブラリーなどを利用しβ-ガラクトシドに作用するホスホリラーゼを網羅的に探索し,発見した酵素の機能特性を明らかにし,ホスホリラーゼを鍵酵素とする新規ATP消費抑制型β-ガラクトシド代謝経路の全容を解明を目指す。 当年度は,(1)ゲノム情報を基盤とした網羅的なホスホリラーゼ探索,(2)ゲノムライブラリーおよびメタゲノムライブラリーの作製,(3)基質および炭素源とするβ-ガラクトオリゴ糖の調製について,当初予定通り検討を加えた。ゲノム情報から系統解析を行なうことにより既知酵素から進化学的に遠い遺伝子に注目し,網羅的にホスホリラーゼホモログ遺伝子を検索・クローニングした。その結果,機能未知タンパク質の取得に至ったが,当該酵素のアクセプター特異性を確認したところ,N-アセチルグルコサミンに最も作用したため,残念ながら既知ラクト-N-ビオースホスホリラーゼであると判断された。また,ホスホリラーゼ遺伝子を多く持つ微生物のゲノムDNAおよび環境中から回収したヘテロなゲノムDNAを断片化,クローン化することでゲノムライブラリーおよびメタゲノムライブラリーの調製手法が確立でき,スクリーニングステップへの展開が可能となった。次年度以降に必要となる各種β-ガラクトシドの調製に関しては,寒天をはじめとする各種β-ガラクトシドを加水分解することで,重合度はそろっていないものの粗オリゴ糖シラップを調製することができた。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究では,既知遺伝子情報からのホスホリラーゼホモログ遺伝子のクローニングおよびゲノムライブラリーからの遺伝子のスクリーニングにより,β-ガラクトシドに作用するこれまでに知られていないホスホリラーゼの発見を目指している。当年度は,(1)ゲノム情報を基盤とした網羅的なホスホリラーゼ探索,(2)ゲノムライブラリーおよびメタゲノムライブラリーの作製,(3)基質および炭素源とするβ-ガラクトオリゴ糖の調製について,当初予定通り検討を加えた。 (1)では,ゲノム情報から系統解析を行ない,既知酵素から進化学的に遠い遺伝子に注目し,網羅的にホスホリラーゼホモログ遺伝子を検索・クローニングした。その結果,機能未知タンパク質の取得に至ったが,当該酵素のアクセプター特異性を確認した結果,N-アセチルグルコサミンに最も作用したため,残念ながら既知ラクト-N-ビオースホスホリラーゼであると判断された。(2)では,ホスホリラーゼ遺伝子を多く持つ微生物のゲノムDNAおよび環境中から回収したヘテロなゲノムDNAを断片化,クローン化することでゲノムライブラリーおよびメタゲノムライブラリーの調製手法が確立でき,スクリーニングステップへの展開が可能となった。(3)では,寒天をはじめとする各種β-ガラクトシドを加水分解することで,重合度はそろっていないものの粗オリゴ糖シラップを調製することができた。
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Strategy for Future Research Activity |
当初予定に準拠し,当年度調製したゲノムライブラリーおよびメタゲノムライブラリーを用いたホスホリラーゼホモログ遺伝子のスクリーニングを遂行する。また,引き続き遺伝子情報から網羅的にホスホリラーゼホモログ遺伝子のクローニングを展開し,得られた機能未知酵素遺伝子によってコードされるタンパク質の機能解析を遂行する。新規酵素が発見された際には,さらに詳細な酵素学的,反応速度論的解析を進め,大量発現可能なものに関しては構造学的解析への展開も目指す。
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