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Analysis of amine degradation pathways toward microbial gamma-glutamylation for prodrug development

Research Project

Project/Area Number 22K05418
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionKansai University

Principal Investigator

IWAKI Hiroaki  関西大学, 化学生命工学部, 教授 (00368200)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywords生体異物アミン / γ-グルタミル中間体 / プロドラッグ / 4-アミノ安息香酸 / ピペリジン / アニリン / バイオレメディエーション / 排水処理 / γ-グルタミル化 / γ-グルタミル化合物合成酵素 / γ-グルタミル化合物 / 2,4-ジニトロフェノール / γ-グルタミルアミド合成酵素 / アミン分解 / アミン分解菌 / ニトロ化合物分解菌 / 分解経路 / 芳香族アミン / 微生物分解 / 微生物生産
Outline of Research at the Start

申請者は、γ-グルタミル化合物の生成が生体異物アミンの代謝において重要な役割を果たしていると考えている。更に、γ-グルタミル化合物はプロドラッグとしても有用である。また、アミン化合物は、工業的に重要な化合物であるだけでなく、ニトロおよびアミド化合物の分解生成物としても生じる。本課題では、微生物機能を利用したγ-グルタミル化合物合成、排水処理・バイオレメディエーションのための基礎的知見を得るため、申請者保有菌株、新規分離株、配列データベースなどから、γ-グルタミル化を含むアミン代謝経路を検索・同定するとともにγ-グルタミル化合物合成酵素およびその他代謝関連酵素の機能および特性を解明する。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we newly isolated microbial degraders of xenobiotic amines such as 4-nitroaniline and piperidine, and sequenced the whole genomes of these and previously obtained strains to investigate catabolic pathways involving γ-glutamyl intermediates. In particular, detailed genomic analysis of Paraburkholderia terrae KU-15 revealed that the initial step in 4-aminobenzoate degradation is γ-glutamylation, and the function of the associated gene cluster pabB1AB2B3C was experimentally verified. Furthermore, analysis of other genomes and publicly available sequence data suggested that γ-glutamylation-mediated pathways may represent one of the major metabolic strategies employed by microbes to degrade aromatic and related amines.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、生体異物アミンの微生物代謝におけるγ-グルタミル中間体を経る経路の多様性と保存性を明らかにし、芳香族アミンを含む広範な化合物に対して、微生物が共通して用いる主要な代謝戦略の一つである可能性を示した。従来、γ-グルタミル化は一部の基質に特異的な経路と見なされていたが、本研究により、その普遍性と応用可能性に新たな視座が加わった。得られた知見は、γ-グルタミル化合物の利用を基盤とするプロドラッグ設計や、生体異物アミンの無毒化・分解を指向した排水処理・バイオレメディエーション技術への応用が期待される。

Report

(4 results)
  • 2024 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2024 2022

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results)

  • [Journal Article] Complete genome sequence of Paraburkholderia terrae strain KU-46, a 2,4-dinitrophenol-degrading bacterium2024

    • Author(s)
      Tanaka Tomoki、Okano Kenji、Iwaki Hiroaki
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 13 Issue: 6

    • DOI

      10.1128/mra.00282-24

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification and characterization of a pab gene cluster responsible for the 4-aminobenzoate degradation pathway, including its involvement in the formation of a γ-glutamylated intermediate in Paraburkholderia terrae strain KU-152024

    • Author(s)
      Yaxuan Liu, Kenji Okano, Hiroaki Iwaki
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 137 Issue: 1 Pages: 38-46

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2023.11.002

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Paraburkholderia terrae Strain KU-15, a 2-Nitrobenzoate-Degrading Bacterium2022

    • Author(s)
      Liu Yaxuan、Okano Kenji、Iwaki Hiroaki
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 11 Issue: 7 Pages: 1-3

    • DOI

      10.1128/mra.00373-22

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2026-01-16  

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