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Elucidation of the stereocontrol mechanisms of the BC-ring in the biosynthesis of canonical strigolactones

Research Project

Project/Area Number 22K05463
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38040:Bioorganic chemistry-related
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

杉本 幸裕  神戸大学, 農学研究科, 名誉教授 (10243411)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywordsストリゴラクトン / 立体制御 / 環化
Outline of Research at the Start

典型的ストリゴラクトン(strigolactone; SL)はABC環とD環から成る基本構造を有し、植物ごとにC環の立体化学が異なるSLが生産されている。トマトとササゲのCYP722CやソルガムのLGS1を用いた酵素反応では、基質となるcarlactonoic acid(CLA)や18-HO-CLAが環化し典型的SLを生成物として与える。しかし、これらの反応ではBC環の環化が立体制御なく進行する。植物が生産するSLのC環の立体化学は厳密に制御されているため、SL生合成には立体選択的にBC環の環化を担う因子の存在が想定される。本研究では、BC環立体制御に関わる因子および制御機構を解明する。

Outline of Annual Research Achievements

Orobancholは多くの植物の根分泌物に検出される代表的なストリゴラクトンである。すでに、ストリゴラクトンの共通の生合成前駆体であるcarlactonoic acid(CLA)がCYP722Cによって18-oxo-CLAに酸化され、これが自発的に環化してorobancholとジアステレオマーであるent-2′-epi-orobancholを生成することを明らかにした。本研究の初年度にはorobanchol のみを分泌するトマトから、18-oxo-CLAをorobancholに立体選択的に環化する、stereoselective ring-formation factor(SRF)と名付けたタンパク質を見出した。本年度は、SRF遺伝子をノックアウトしたトマトを作出し、その根分泌物中にorobancholだけでなくent-2′-epi-orobancholも検出したことから植物体でのSRFの機能を確認した。さらに、AlphaFold2によりSRFタンパク質の立体構造を予測し、基質である18-oxo-CLAとドッキングシミュレーションした。活性に関わると考えられるいくつかのアミノ酸残基が予想され、それらを個々に置換した変異タンパク質を調製し酵素活性を調べた結果、活性に必須の複数のアミノ酸残基を特定した。一方、タバコにはorobancholのみを生産する種とent-2′-epi-orobancholも生産する種が知られている。トマトと異なりタバコにはSRFをコードする遺伝子が4つあり、種によってSRF遺伝子の発現プロファイルに違いが認められた。タバコの種における18-oxo-CLAの環化の違いに対するそれぞれのSRFの機能の解析に着手した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

トマトにおいてSRF遺伝子をノックアウトし植物体での機能を確認した。さらに、SRFタンパク質の立体構造ならびに活性に必須のアミノ酸残基を特定した。一連の成果を論文に取りまとめ投稿した。トマトで得た知見をタバコに応用し、タバコの種における18-oxo-CLAの環化様式の違いの解析に着手した。

Strategy for Future Research Activity

栽培条件によるタバコのSRF遺伝子群の発現パターンを解析するとともに、根から分泌されるorobancholおよびent-2′-epi-orobancholを分析する。また、異種発現した個々のSRFタンパク質について18-oxo-CLAの環化を制御する機能を調べる。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2023 2022

All Journal Article (1 results) (of which Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Insights into stereoselective ring formation in canonical strigolactone: Discovery of a dirigent domain-containing enzyme catalyzing orobanchol synthesis2023

    • Author(s)
      Homma Masato、Wakabayashi Takatoshi、Moriwaki Yoshitaka、Shiotani Nanami、Shigeta Takumi、Isobe Kazuki、Okazawa Atsushi、Ohta Daisaku、Terada Tohru、Shimizu Kentaro、Mizutani Masaharu、Takikawa Hirosato、Sugimoto Yukihiro
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2023.08.07.552212

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Open Access
  • [Presentation] Stereoselective BC-ring formation mechanism of orobanchol in tomato2023

    • Author(s)
      Masato Homma, Takatoshi Wakabayashi, Yoshitaka Moriwaki, Nanami Shiotani, Takumi Shigeta, Kazuki Isobe, Atsushi Okazawa, Daisaku Ohta, Tohru Terada, Kentaro Shimizu, Masaharu Mizutani, Hirosato Takikawa, Yukihiro Sugimoto
    • Organizer
      IPGSA2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Nicotiana tabacumにおけるorobanchol合成酵素の機能解析2023

    • Author(s)
      阿部怜生、本間大翔、若林孝俊、滝川浩郷、水谷正治、杉本幸裕
    • Organizer
      植物化学調節学会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] トマトにおいて18-oxo-CLAを基質とするorobanchol合成酵素の同定2022

    • Author(s)
      本間大翔、若林孝俊、塩谷七洋、磯部一樹、岡澤敦司、太田大策、滝川浩郷、水谷正治、杉本幸裕
    • Organizer
      植物化学調節学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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