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酵素反応を考慮した土壌炭素分解モデル構築に向けて~酸化酵素活性の制御要因の探索~

Research Project

Project/Area Number 22K05734
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 40010:Forest science-related
Research InstitutionForest Research and Management Organization

Principal Investigator

森 大喜  国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (90749095)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsポリフェノールオキシダーゼ / 炭素循環 / 酵素活性 / 酸化酵素 / 窒素添加 / 土壌 / 微生物 / 土壌酵素 / 土壌微生物
Outline of Research at the Start

酵素反応を組み込んだ土壌炭素分解モデルの構築に向けて、その重要な構成要素である「環境要因から酸化酵素活性を予測するモデル」の構築を行う。これまで考慮されてこなかった「土壌を構成する鉱物中に存在する金属による無機触媒反応由来の酵素反応(正確には酵素ではなく触媒)」に着目し、この金属触媒由来と微生物由来の酸化酵素活性を分離して独立に予測しそれを合成する新たなアプローチによって精度の高い予測モデル構築を達成する。

Outline of Annual Research Achievements

難分解性有機物の分解に関与する酸化酵素ポリフェノールオキシダーゼ(PPO)について、渓流水サンプル中での活性を測定する際に使用されていた従来の手法がpHの影響を受け、大きな誤差を生じていることを明らかにし、その測定手法を改良した。これは、有機物分解プロセスのより正確な理解に貢献する。
ポリフェノールオキシダーゼ(PPO)は、難分解性有機物の分解に関与する酸化酵素であり、渓流水中の炭素分解においても重要な役割を果たしている。PPO活性はL-DOPAを基質としてその酸化速度を測定しているが、L-DOPAの酸化速度はpHの影響を強く受けるため、測定値は渓流水のpHに依存して不正確である可能性があった。実際に渓流水中のPPO活性を測定し、オートクレーブ処理によって酵素を失活させた同一サンプルと比較した結果、オートクレーブ処理されたサンプルの酵素活性がより高いことが観察された。このことから測定値は明らかに不正確であったことが示唆された。この不正確な測定結果は、オートクレーブ処理によってpHが上昇したことに起因していた。この問題に対処するために、pH5の酢酸バッファーを用いた改良法を検討したところ、先述の問題が解決され、より正確な測定を行うことに成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

土壌鉱物の金属触媒力の大きさを微生物由来の酵素活性から分離して独立に予測する手法の開発に関しては、実験および分析が完了しており、間もなく手法を提案できる段階にある。また、「養分収奪仮説」を検証する実験については分析がほぼ完了しており、おおむね順調に進展している。

Strategy for Future Research Activity

当初の仮説であった「リン収奪仮説」をアップデートした「養分収奪仮説」の検証を行う。培養実験は終了しているため、分析を完了するとともに解析を行い、本仮説が窒素と酸化酵素活性の関係を統一的に説明できるかを明らかにする。さらに、土壌鉱物の金属触媒力の大きさを微生物由来の酵素活性から分離して予測する手法を開発し、環境要因から酸化酵素活性を予測する線形モデルを完成させる。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Empirical evidence challenges the effectiveness of the enzymatic stoichiometry of glucosidase and phosphatase as an indicator of microbial C vs P limitation2024

    • Author(s)
      MORI Taiki
    • Journal Title

      Science of the Total Environment

      Volume: 915 Pages: 170079-170079

    • DOI

      10.1016/j.scitotenv.2024.170079

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Contradiction with enzymatic stoichiometry theory: Persistent low ratios of β-glucosidase to phosphomonoesterase following 10-year continuous phosphorus fertilization in three subtropical forests2024

    • Author(s)
      MORI Taiki、 Cong Wang、Senhao Wang、Wei Zhang、Jiangming Mo
    • Journal Title

      Pedobiologia

      Volume: 103 Pages: 50931-50931

    • DOI

      10.1016/j.pedobi.2024.150931

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Resource allocation theory reveals sulfur shortage for microbes under phosphorus amendment in tropical forests with divergent land use history2023

    • Author(s)
      Cong Wang、Qinggong Mao、MORI Taiki、 Juan Huang、Hui Mo、Jiangming Mo、Xiankai Lu
    • Journal Title

      Soil Biology and Biochemistry

      Volume: 184 Pages: 109126-109126

    • DOI

      10.1016/j.soilbio.2023.109126

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Importance of considering enzyme degradation for interpreting the response of soil enzyme activity to nutrient addition: in-sights from a field and laboratory study2023

    • Author(s)
      MORI Taiki、 Senhao Wang、Cheng Peng、 Cong Wang、 Jiangming Mo、Mianhai Zheng、Wei Zhang
    • Journal Title

      Forests

      Volume: 14 Issue: 6 Pages: 1206-1206

    • DOI

      10.3390/f14061206

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Does simultaneous phosphorus fertilization negate the suppressive effect of nitrogen fertilization on polyphenol oxidase activity?2023

    • Author(s)
      MORI Taiki, IMAI Nobuo, KITAYAMA Kanehiro
    • Journal Title

      Geoderma

      Volume: 430 Pages: 116287-116287

    • DOI

      10.1016/j.geoderma.2022.116287

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] リン酸分解酵素活性の窒素および炭素獲得酵素に対する比率は温帯林の林内雨中よりも熱帯林の林内雨中で高かった2023

    • Author(s)
      森大喜、Senhao Wang、Kaijun Zhou、Jiangming Mo、Wei Zhang
    • Organizer
      日本熱帯生態学会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 熱帯林土壌における高いリン酸分解酵素活性は速い微生物回転速度によって説明されうる2023

    • Author(s)
      森大喜
    • Organizer
      日本生態学会大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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