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Mechanism of molecular recognition between intrinsically disordered regions.

Research Project

Project/Area Number 22K06101
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43020:Structural biochemistry-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

星野 大  京都大学, 薬学研究科, 准教授 (70304053)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords天然変性タンパク質 / 分子認識 / タンパク質間相互作用 / NMR
Outline of Research at the Start

「タンパク質」は我々のからだを構築するだけでなく、摂取した食物を消化してエネルギーに変換したり、外界からの刺激(光・温度・匂い)を脳に伝達したり、あらゆる生命活動において中心的役割を果たしている。タンパク質は特有の立体構造により機能を発現しているが、機能に必要な「特有の立体構造」をもたないタンパク質が、ヒトを含む高等な生物に多数存在することが明らかとなってきた。「特有の立体構造」をもたないタンパク質が、どうやって機能を発揮しているのかを「タンパク質のかたち」に注目しつつ解明する。

Outline of Annual Research Achievements

「タンパク質」は我々のからだを構築するだけでなく、摂取した食物を消化してエネルギーに変換したり、外界からの刺激(光・温度・匂い)を脳に伝達したり、あらゆる生命活動において中心的役割を果たしている。タンパク質は特有の立体構造により機能を発現しているが、機能に必要な「特有の立体構造」をもたないタンパク質が、ヒトを含む高等な生物に多数存在することが明らかとなってきた。「特有の立体構造」をもたないタンパク質が、どうやって機能を発揮しているのかを「タンパク質のかたち」に注目しつつ解明する。
転写因子であるSp1に存在する、グルタミン残基に富むSp1-QBドメインは、そのような天然変性タンパク質の一種である。興味深いことに、Sp1-QBドメインは、特定の構造をもたないにも関わらず自己会合してホモオリゴマーを形成する。さらに、TAF4という基本転写因子のタンパク質とも相互作用して、Sp1-TAF4ヘテロオリゴマーを形成する。
本研究では、特定の構造を持たない天然変性タンパク質が、複数の異なるタンパク質(Sp1-Sp1およびSp1-TAF4)を認識・相互作用する分子機構を明らかにすることを目的とする。そのために、溶液高分解能NMRを用いて両タンパク質の相互作用を残基レベル分解能で解析する。計画は順調に進行しており、相互作用にともなって特定の残基に由来する共鳴ピークが減弱することを見出している。今後さらに計画を進め、相互作用にともなう分子運動の変化を解析する予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

前年度までの研究により得られたNMRスペクトルの帰属情報をもとに、Sp1-QB ドメインと TAF4-中央ドメインの相互作用における相互作用部位を詳細に解析することに成功した。これにより、QB のC末端部分とTAF4のN末端部の関与が示唆された。

Strategy for Future Research Activity

両タンパク質における相互作用部位は比較的狭い領域に限局していることが明らかになった。今後は、この「局所的な」相互作用が、タンパク質の他の領域にどのような構造変化をもたらすのかを明らかにする。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 6 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Insights into the dual nature of alphaB crystallin chaperone activity from the p.P39L mutant at the N-terminal region.2024

    • Author(s)
      A. Barati, L.R. Somee, M.B. Shahsavani, A. Ghasemi, M. Hoshino, J. Hong, A.A. Saboury, A.A. Moosavi-Movahedi, G. Agnetti & R. Yousefi
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 14 Issue: 1 Pages: 7353-7353

    • DOI

      10.1038/s41598-024-57651-5

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Unraveling the impact of the p.R107L mutation on the structure and function of human aB-Crystallin: Implications for cataract formation.2024

    • Author(s)
      F. Nasiri, P. Ebrahimi, M.B. Shahsavani, A. Barati, I. Zarei, J. Hong, M. Hoshino, A.A. Moosavi-Movahedi & R. Yousefi
    • Journal Title

      Biochimie

      Volume: 222 Pages: 151-168

    • DOI

      10.1016/j.biochi.2024.03.004

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Understanding the structural and functional changes and biochemical pathomechanism of the cardiomyopathy-associated p.R123W mutation in human alphaB-crystallin.2024

    • Author(s)
      L.R. Somee, A. Barati, M.B. Shahsavani, M. Hoshino, J. Hong, A. Kumar, A.A. Moosavi-Movahedi, M. Amanlou & R. Yousefi
    • Journal Title

      BBA General Subjects

      Volume: 1868 Issue: 4 Pages: 130579-130579

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2024.130579

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Charge manipulation of the human insulin B chain C-terminal to shed light on the complex mechanism of insulin fibrillation.2024

    • Author(s)
      M.B. Shahsavani, M. Hoshino, A. Kumar & R. Yousefi
    • Journal Title

      10.1016/j.bbagen.2024.130578

      Volume: 1868 Issue: 4 Pages: 130578-130578

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2024.130578

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Unveiling the structural and functional consequences of the p.D109G pathogenic mutation in human alphaB-Crystallin responsible for restrictive cardiomyopathy and skeletal myopathy.2024

    • Author(s)
      M.H. Jafari, M.B. Shahsavani, M. Hoshino, J. Hong, A.A. Saboury, A.A. Moosavi-Movahedi & R. Yousefi
    • Journal Title

      Int. J. Biol. Macromol.

      Volume: 254 Pages: 127933-127933

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2023.127933

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Optimizing expression, purification, structural and functional assessments of a novel dimeric incretin (GLP-1cpGLP-1).2023

    • Author(s)
      R.M. Albaghlany, M.B. Shahsavani, M. Hoshino, A.A. Moosavi-Movahedi, Y. Ghasemi & R. Yousefi
    • Journal Title

      Biochimie

      Volume: - Pages: 133-146

    • DOI

      10.1016/j.biochi.2023.10.020

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 血清アミロイドAの自己凝集機構の解析・アカモクフコイダンのアミロイドβ凝集抑制機構の解析2023

    • Author(s)
      星野 大、奥西 泰之、八木 寿梓
    • Organizer
      第14回 タンパク質の異常凝集とその防御・修復機構に関する研究会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 血清アミロイドAのアミロイド線維形成機構の解明2023

    • Author(s)
      奥西 泰之、松崎 勝己、星野 大
    • Organizer
      第23回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 血清アミロイドAのアミロイド線維形成機構の解明2023

    • Author(s)
      奥西 泰之、松崎 勝己、星野 大
    • Organizer
      第20回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 血清アミロイドAの線維形成における主要な構造変化2023

    • Author(s)
      奥西 泰之、松崎 勝己、星野 大
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 血清アミロイドAの自己凝集機構の解析・アカモクフコイダンのアミロイドβ凝集抑制機構の解析2023

    • Author(s)
      星野 大、奥西 泰之、八木 寿梓
    • Organizer
      第14回タンパク質の異常凝集とその防御・修復機構に関する研究会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Inhibitory effect of fucoidan on the fibril formation by amyloid-beta peptides2022

    • Author(s)
      Masaru Hoshino, Yoshinori Kato and Hisashi Yagi
    • Organizer
      The 4th Proteostasis and Disease Research Symposium
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Biophysical analysis of the amyloid fibril formation by serum amyloid A2022

    • Author(s)
      Taishi Okunishi, Katsumi Matsuzaki and Masaru Hoshino
    • Organizer
      The 4th Proteostasis and Disease Research Symposium
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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