小型のRNA結合タンパク質を合理的に設計する方法の開発

• Project/Area Number: 22K06122
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 遠藤 慧 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 助教 (40626074)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2022)
• Budget Amount: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000); Fiscal Year 2025: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000); Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000); Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000); Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
• Keywords: RNA結合タンパク質 / ジンクフィンガー / タンパク質設計 / 生細胞スクリーニング

Outline of Research at the Start

近年、RNAの塩基修飾の重要性が注目を集め、任意のRNAを標的可能なRNA結合タンパク質へのニーズが劇的に高まっている。本研究では、小型で、かつ１本鎖RNAの配列認識もRNAの立体的な構造認識も可能なジンクフィンガーモチーフに着目して、高次構造も含めた任意のRNA配列モチーフに結合する小型のRNA結合タンパク質を合理的に設計する方法の創出に取り組む。最近開発したタンパク質とRNAの相互作用を検出する方法を用いて、相互作用するアミノ酸配列モチーフと標的RNA配列の組み合わせを、直接、実験的に探索し、「アミノ酸配列を合理的に設計する」という観点から RNA認識機構を構成的に明らかにする。