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極限環境光合成微生物における3重耐性化と近赤外光利用の分子戦略

Research Project

Project/Area Number 22K06144
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

木村 行宏  神戸大学, 農学研究科, 准教授 (20321755)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords極限環境微生物 / 3重耐性 / 近赤外光 / Hlr. halochloris / 3重耐性 / 紅色光合成細菌 / 光捕集1反応中心複合体
Outline of Research at the Start

紅色光合成細菌は、低いエネルギーを高いエネルギーに変換するuphill型エネルギー移動により近赤外光をエネルギー源とした光ー物質変換を営んでいる。本研究では、極限環境光合成微生物Hlr. halochlorisの3重耐性(耐熱性、耐塩性、耐アルカリ性)および近赤外光利用の分子機構を明らかにするため、BChl bを集光色素とする紅色光合成細菌を比較対象とし、分光学的、熱力学的手法による解析ならびにCryoEMによる構造解析を融合させ、Hlr. halochlorisの耐熱化、耐塩化、耐アルカリ化、低エネルギー吸収特性の詳細な分子機構を明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

紅色光合成細菌は近赤外光を光電変換する光捕集・電荷分離システム(光捕集1反応中心複合体:LH1-RC)を備えており、低いエネルギーを高いエネルギーに変換するuphill型エネルギー移動により近赤外光をエネルギー源とした光ー物質変換を営んでいる。本研究では、極限環境光合成微生物Hlr. halochlorisの3重耐性(耐熱性、耐塩性、耐アルカリ性)および近赤外光利用の分子機構を明らかにするため、BChl bを集光色素とする紅色光合成細菌(Hlr. halochloris、Hlr. abdelmalekii, Blc. tepida, Blc. viridis)を比較対象として、物理化学的手法による解析ならびにCryoEMによる構造解析を組み合わせ、Hlr. halochlorisの耐熱化、耐塩化、耐アルカリ化、低エネルギー吸収特性の詳細な分子機構を明らかにすることを目的としている。具体的には、(1)可視近赤外分光法および示差走査熱量分析法による3重耐性の検証、(2)灌流誘起ATR-FTIR分光法による塩濃度およびpH依存的LH1-RC構造変化の検出、(3)等温滴定熱量分析(ITC)による塩濃度およびpH依存的LH1-RC相互作用変化の解析、(4)Cryo-EM構造解析によるLH1-RC構造の解明の4つのテーマを遂行している。
今年度は(2)について検討を続けた。バックグラウンドの安定化に課題が残り、有意な信号を得ることはできなかった。(3)については試料の大量調製が可能となったため測定を行なっているが、再現性を検証する必要があり、次年度も継続的にデータを収集する予定である。一方、(4)については共同研究により、Hlr. halochlorisのCryo-EM構造論文を報告した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度はHlr.halochlorisの(2)について検討を続け、バックグラウンドの安定化に課題が残り有意な信号を得ることはできなかったが、改善の余地が残されており、引き続き検証する予定である。(3)についてはHlr.halochloris LH1-RCと塩の相互作用に由来する熱信号が検出された。次年度も継続し、再現性を検証する。(4)については共同研究により、Hlr. halochlorisのCryo-EM構造を報告した。また、Blc. tepidaについても構造解析を行い、Hlr. halochlorisとは全く異なるメカニズムで耐熱性を獲得していることが判明した。現在論文を執筆している。

Strategy for Future Research Activity

Hlr. halochlorisおよびHlr. abdelmarekiiについては継続して(2)の灌流誘起ATR-FTIR分光法による分析を進めていく。また、(3)のITC測定を補完し、熱力学的に塩結合によるLH1-RC安定化のメカニズムを明らかにしていく。(4)については、Halorhodospira abdelmalekiiののCryo-EM構造解析を進めていく。また、Blastochloris tepidaのCryoEM構造論文を投稿する。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] 南イリノイ大学(米国)

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] Chinese Academy of Sciences(中国)

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  • [Int'l Joint Research] 南イリノイ大学(米国)

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Journal Article] Structural insights into the unusual core photocomplex from a triply extremophilic purple bacterium, <i>Halorhodospira halochloris</i>2024

    • Author(s)
      Qi Chen‐Hui、Wang Guang‐Lei、Wang Fang‐Fang、Wang Jie、Wang Xiang‐Ping、Zou Mei‐Juan、Ma Fei、Madigan Michael T.、Kimura Yukihiro、Wang‐Otomo Zheng‐Yu、Yu Long‐Jiang
    • Journal Title

      Journal of Integrative Plant Biology

      Volume: 00 Issue: 10 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1111/jipb.13628

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Calcium and the ecology of photosynthesis in purple sulfur bacteria2024

    • Author(s)
      Madigan Michael T.、Sattley W. Matthew、Kimura Yukihiro、Wang‐Otomo Zheng‐Yu
    • Journal Title

      Environmental Microbiology

      Volume: 26 Issue: 2

    • DOI

      10.1111/1462-2920.16591

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Advances in the Spectroscopic and Structural Characterization of Core Light-Harvesting Complexes from Purple Phototrophic Bacteria2023

    • Author(s)
      Kimura Yukihiro、Tani Kazutoshi、Madigan Michael T.、Wang-Otomo Zheng-Yu
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 127 Issue: 1 Pages: 6-17

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.2c06638

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      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Salt- and pH-Dependent Thermal Stability of Photocomplexes from Extremophilic Bacteriochlorophyll b-Containing Halorhodospira Species2022

    • Author(s)
      Kimura Yukihiro、Nakata Kazuna、Nojima Shingo、Takenaka Shinji、Madigan Michael T.、Wang-Otomo Zheng-Yu
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 10 Issue: 5 Pages: 959-959

    • DOI

      10.3390/microorganisms10050959

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 紅色光合成細菌由来カルシウム結合型LH1-RC複合体の構造機能解析2023

    • Author(s)
      木村行宏
    • Organizer
      第29回光合成セミナー:反応中心と色素系の多様性
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Purification and characterization of a new thermophilic purple sulfur bacterium Caldichromatium japonicum2023

    • Author(s)
      Minamino, A., Saini, M.K., Takenaka, S., Wang-Otomo, Z.-Y., and Kimura, Y
    • Organizer
      The 61th Annual Meeting of the BSJ
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 新規好熱性紅色光合成細菌Caldichromatium japonicmの特性解析2023

    • Author(s)
      南野朱音、M.K. Saini、竹中慎治、大友征宇、木村行宏
    • Organizer
      第29回光合成セミナー:反応中心と色素系の多様性
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      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Electrostatic charge controls spectral properties and thermal stabilities of LH1-RCs from triply extremophilic Halorhodospira halochloris2022

    • Author(s)
      Yukihiro Kimura, Kazuna Nakata, Shingo Nojima, Shinji Takenaka, Michael T. Madigan, Zheng-Yu Wang-Otomo
    • Organizer
      The 60th Annual Meeting of the BSJ 2022年9月
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 好極限性紅色細菌Halorhodospira halochlorisにおける低エネルギー吸収特性および3重耐性の分子機構2022

    • Author(s)
      中田和菜、能島紳吾、竹中慎治、Madigan, M.T.、大友征宇、木村行宏
    • Organizer
      第29回 光合成セミナー 2022年7月
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Remarks]

    • URL

      https://www.edu.kobe-u.ac.jp/ans-bpc/seika.html

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Remarks]

    • URL

      https://www.edu.kobe-u.ac.jp/ans-bpc/seika.html

    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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